Cap. 6 L’espressione genica: la traduzione pp.144-167

1. Cap. 6 L’espressione genica: la traduzione pp.144-167

2. Sintesi 06 • Chiamiamo codice genetico l’insieme delle triplette di nucleotidi (codoni), ciascuna delle quali designa un amminoacido nella catena polipeptidica • Il codice genetico è (1) universale, (2) continuo e (3) degenerato, cioè per un amminoacido possono esistere più triplette • Il messaggero viene tradotto in un peptide nei ribosomi • L’ RNAt presenta al ribosoma gli amminoacidi • La sequenza polipeptidica viene determinata dal legame fra il codone e l’anticodone complementare del tRNA • Il codone di inizio trascrizione è AUG, che codifica per Met • La traduzione termina quando sull’mRNA si incontra un codone di stop (UAG, UAA o UGA)

3. Cellula pro- ed Eu-cariote

4. Struttura di un amminoacido

5. Gli amminoacidi

6. Le quattro strutture proteiche

7. Khorana: miniRNA in sistema cell-free Frequenze nell’RNA ottenuto a partire da ¾ U e ¼ G e nei polipeptidi: Attese Osservate P(UUU) = ¾ x ¾ x ¾ = 27/64 Phe = 1.00 P(UUG) = ¾ x ¾ x ¼ = 9/64 Leu = 0.32 P(UGU) = ¾ x ¼ x ¾ = 9/64 Cys = 0.31 P(GUU) = ¼ x ¾ x ¾ = 9/64 Val = 0.37 P(UGG) = ¾ x ¼ x ¼ = 3/64 Trp = 0.12 P(GUG) = ¼ x ¾ x ¼ = 3/64 Gly = 0.14 P(GGU) = ¼ x ¼ x ¾ = 3/64 P(GGG) = ¼ x ¼ x ¼ = 1/64

8. Khorana: miniRNA in sistema cell-free Attese Osservate P(UUU) = ¾ x ¾ x ¾ = 27/64 Phe = 1.00 P(UUG) = ¾ x ¾ x ¼ = 9/64 Leu = 0.32 P(UGU) = ¾ x ¼ x ¾ = 9/64 Cys = 0.31 P(GUU) = ¼ x ¾ x ¾ = 9/64 Val = 0.37 P(UGG) = ¾ x ¼ x ¼ = 3/64 Trp = 0.12 P(GUG) = ¼ x ¾ x ¼ = 3/64 Gly = 0.14 P(GGU) = ¼ x ¼ x ¾ = 3/64 P(GGG) = ¼ x ¼ x ¼ = 1/64

9. Il codice genetico

10. Il codice genetico: • È a triplette; • È continuo (nessun nucleotide viene saltato); • Non ha sovrapposizioni (eccezioni: alcuni procarioti); • È universale (eccezioni: mitocondri, Tetrahymena); • È degenerato (tranne che per met e trp); • Ha segnali di inizio (AUG) e fine (UAA, UAG, UGA). • Qual è il vantaggio di un codice degenerato?

11. Wobbling o vacillamento in terza base

12. L’amminoacido viene legato al tRNA

13. Schema della traduzione • Inizio: Legame fra fattori d’inizio e subunità 30S del ribosoma Legame fra la seq. Di Shine-Dalgarno e l’rRNA 30S (complesso d’inizio 30S) Legame fra AUG e fMet-tRNA Legame con la subunità 50S del ribosoma (complesso d’inizio 70S) 2. Allungamento: Legame fra amminoacil-tRNA e ribosoma Formazione del legame peptidico Scorrimento (traslocazione) del ribosoma lungo l’mRNA 3. Terminazione: Incontro col codone di stop Legame fra fattore di rilascio e codone di stop Rilascio del polipeptide, separazione delle subunità ribosomali

14. Traduzione: inizio

15. Traduzione: allungamento

16. Traduzione: terminazione

17. Riassunto 06 • Chiamiamo codice genetico l’insieme delle triplette di nucleotidi (codoni), ciascuna delle quali designa un amminoacido nella catena polipeptidica • Il codice genetico è (1) universale, (2) continuo e (3) degenerato, cioè per un amminoacido possono esistere più triplette • Il messaggero viene tradotto in un peptide nei ribosomi • L’ RNAt presenta al ribosoma gli amminoacidi • La sequenza polipeptidica viene determinata dal legame fra il codone e l’anticodone complementare del tRNA • Il codone di inizio trascrizione è AUG, che codifica per Met • La traduzione termina quando sull’mRNA si incontra un codone di stop (UAG, UAA o UGA)