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第十章 基因信息的传递. DNA 的生物合成. 基因 : 生物活性产物编码的 DNA 功能片段. 复制 : 以 DNA 作为 模板 指导的 DNA 合成,即将 DNA 携带的信息传至子代 DNA DNA 合成也可以 RNA 为 模板 指导合成,通常将其称作反转录作用 , 见于 RNA 病毒. 模板 作用: 大量生 产同一产品. 模 板. 中心法则 Central Dogma. DNA. 复制. 逆 转录. 转录. RNA. 翻译. 蛋白质(病毒). 少数病毒复制. 翻译. 蛋白质. 父链. 子链. 第一节 半保留复制.
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第十章 基因信息的传递 DNA的生物合成
基因:生物活性产物编码的DNA功能片段 复制:以DNA作为模板指导的DNA合成,即将DNA携带的信息传至子代DNA DNA合成也可以RNA为模板指导合成,通常将其称作反转录作用,见于RNA病毒
模板作用:大量生产同一产品 模 板
中心法则Central Dogma DNA 复制 逆转录 转录 RNA 翻译 蛋白质(病毒) 少数病毒复制 翻译 蛋白质
父链 子链 第一节 半保留复制 定义:两个子代分子中各有一条链来自亲代,各有另一条新合成的链,这种复制方式叫半保留复制
1958 – Matthew Meselson和Franklin Stahl 福兰克林.斯塔尔(Franklin Stahl) 美国科学家马修.梅塞尔(Matthew Keelson)
普通DNA 含15N-DNA的细菌 培养于普通培养液 重DNA 第一代 中等密度DNA 继续培养于 普通培养液 普通DNA 第二代 中等密度DNA 新合成 的链 (蓝: 15N) (棕: 14N) 意义? DNA半保留复制的证据
全保留 普通DNA 二代 重DNA 混 合 一代 一代 二代 中等密度DNA
3’ 亲代DNA 分子 5’ 复制叉 3’ 5’ 复制的起始点与方向 亲代DNA开链,复制起始点呈叉型移动 ori 复制起始点(ori):DNA复制要从DNA分子的特定部位开始,此部位称复制起始点 原核:一个起始点,约245bp,特殊的重复序列 真核:多个起始点
E.coli复制起始点oriC跨度为245bp,有3组串联重复序列和2对反向重复序列E.coli复制起始点oriC跨度为245bp,有3组串联重复序列和2对反向重复序列
AGCT TCGA 串联重复序列 GATTNTTTATTT…GATCTNTTNTATT…GATCTCTTATTAG 反向重复序列 回文结构 TGTGGATTA……TTATACACA… A--TA--GTGT …TTTGGATAA…..TTATCCACA AATAGGT--T
复制方向 • DNA合成的方向单向、双向? 1个起始点
ori ori ori ori 双向复制 以起始点为中心,向两个方向进行复制 复制子 真核生物两个相邻复制起始点之间的DNA片段
第二节 DNA复制的酶学 1. 模板:解开成单链的DNA母链 2. 底物dNTP :dATP,dGTP,dCTP,dTTP 3. DNA聚合酶,DNA-pol 4. 引物(primer):RNA引物 5. 其他酶和蛋白质因子
N1OH N1N2-OH 5` 5` 3` 3` 一、复制的化学反应 生成磷酸二酯键 DNA pol +dN2TP +PPi 3’——TAGAAGACCTATTGGCC——5’ 5’——ATCTTCTGGATAACCGG——3’
二、 解链相关酶类 1. 解旋酶(helicase) 2. 拓扑异构酶(topoisomerase I、II) 3. 单链DNA结合蛋白(SSB)
解螺旋酶 2.1 解旋酶 (helicase) 作用:断裂互补碱基间的氢键,使DNA成单链 ATP DnaA、B、C… dnaA、B、C…
2.2 拓扑异构酶(Topo) 拓扑(topology)与拓扑异构 DNA正超螺旋与负超螺旋 螺旋 拓扑异构酶 超螺旋 正超螺旋 DNA双螺旋 负超螺旋
Helicase Topo酶:切割DNA链,使其松弛后再连接 TopoⅡ(DNA Gyrase)
Supercoiled DNA Helicase TOPOⅡ
ATP TOPOⅡ
2.3 单链DNA结合蛋白(SSB) 作用:防止单链DNA重新形成双链,防止单链DNA被核酸酶水解 SSB
三、DNA聚合酶(DNA-pol) 即依赖于DNA的DNA聚合酶(DDDP) 原核生物有3种: DNA-polⅠ、 Ⅱ、 Ⅲ 真核生物有多种: DNA-pol、、、、…
DNA聚合酶功能 • 5´3´聚合作用 • 5´3´外切酶 • 3´5´外切酶活性
dNTP DNA pol 5´3´聚合作用 3 'agctcgatcgtagcctagcgtagcagtgcacgatc 5 ' 5'ucgagcuag-OH 3 ' 3 'agctcgatcgtagcctagcgtagcagtgcacgatc 5 ' 5 'ucgagcuag catcggatcgcatcgtcacgtgctag 3 '
5’ 3’ 外切酶与内切酶作用图解 内切酶 5’ 3’ 外切酶 5´3´外切酶活性的功能 切除引物,切除突变片段
错配碱基 校 读 3’5’外切酶活性
大肠杆菌三种DNA聚合酶比较 DNA 聚合酶Ⅰ DNA 聚合酶Ⅱ DNA聚合酶Ⅲ (复合物) 特 性 109,000 400 + + + 1 校读,修复1000 400,000 10-20 + + + 50 复制100000 分子量 每个细胞的分子统计数 5´-3 ´聚合酶作用 3´-5 ´核酸外切酶作用 5´-3 ´核酸外切酶作用 转化率 主要功能 活性(nt/min) 120,000 40 + + - 0 .05 不清 填补缺口 50
核心酶 延长因子 Pol III DNA聚合酶Ⅲ二聚体 Pol III DNA聚合酶Ⅲ全酶
DNA pol I 大片段 (Klenow fragment) 小片段 5 '→3 '聚合功能 3 '→5 '外切酶活性 5'→3'外切酶活性
5´ 3´ 5´ 3´ 5´ 5´ RNA引物 四、引物酶(Primase)和引发体 DNA合成需在RNA引物的基础上进行 催化RNA引物合成的酶叫引物酶,它是一种特殊的RNA聚合酶
5´ 3´ DnaC 解螺旋酶 引发体 3´ 5´ 引物酶 引发体(primosome):包括解螺旋酶 、DnaC、引物酶及DNA复制的起始区域 DnaA
五、DNA连接酶(DNA ligase) 功能: 催化DNA双链的3’羟基和相邻的5’磷酸基团形成磷酸二酯键,从而把两段相邻的DNA链连成完整的链
小 结 主要成员 主要作用 DnaA 识别复制起始位点 解螺旋酶 解开DNA双链 SSB 维持已解开单链DNA的稳定 引物酶 合成RNA引物 TOPO 使打结、缠绕、正超螺旋的DNA松驰 DNA-pol Ⅲ DNA复制 DNA-polⅠ 水解引物、填补空隙、修复作用 DNA连接酶 催化双链DNA中单链缺口的连接
第三节 DNA生物合成过程 1.复制的起始 2.链的延长 3.复制的终止
DNA合成期 哺乳动物的细胞周期
一 复制的起始 (一) DNA解成单链 由特定蛋白质识别复制起始位点(ori),在解螺旋酶、TOPO酶及单链DNA结合蛋白的共同作用下,DNA解链,解旋,形成复制叉 倒Y
5´ 3´ DnaC 解旋酶 引发体 3´ 5´ 引物酶 (二)引发体的生成 解旋酶解开双链后引物酶进入形成引发体
5´ 3´ 5´ 3´ 5´ 5´ RNA引物 (三) RNA引物的合成
参与复制起始的蛋白因子 功能 名称 DnaA蛋白 辨认起始点 解螺旋酶(DnaB,Rep) 解开DNA双链 DnaC 协助解螺旋酶 引物酶(DnaG) 催化RNA引物生成 SSB 稳定解开的单链 拓扑异构酶 理顺DNA链 OriC E.coli复制起始点
5’- DNA - O - P -N - OH 5’- DNA - OH +dNTPs + P P 二 复制的延长 引物合成后,由DNA polⅢ(在真核细胞为DNA聚合酶和)催化,按碱基配对原则,将dNTP逐一添加到引物3’末端,形成磷酸二酯键,使新合成的链不断延长 3’——AAGACCTATT——5’ 5’——TTCTGGATAA——3’ DNA Pol I, II and III