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主要内容

主要内容. 一、 pubmed 简介 二、 检索 原理及检索功能 三、 pubmed 检索方式 四、辅助功能的使用 五、检索结果管理. 一、 pubmed 简介 bmed 简介. 美国国立医学图书馆 ( U.S. National Library of Medicine,NLM ) 下属的美国国立生物技术信息中心（ National Center for Biotechnology Information, NCBI ）开发 因特网生物医学信息检索系统（ 免费检索系统 ） 。. ( 一 ) 数据来源： 1 MEDLINE

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Presentation Transcript

  1. 主要内容 • 一、pubmed简介 • 二、检索原理及检索功能 • 三、pubmed检索方式 • 四、辅助功能的使用 • 五、检索结果管理

  2. 一、pubmed简介bmed简介 美国国立医学图书馆(U.S. National Library of Medicine,NLM)下属的美国国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information, NCBI）开发因特网生物医学信息检索系统（免费检索系统）。

  3. (一) 数据来源： 1 MEDLINE 2 In Process Citations （临时性医学文献数据库） 3 Publisher supplied citations （出版商向PubMed提交） PREMEDLINE

  4. 1、MEDLINE 收录1950年以来70多个国家40多种语言的4800余种生物医学期刊，起始时间1950年，英文刊物占93%、3/4有摘要，周更新。 记录标注:[PubMed – indexed for MEDLINE]

  5. 2、In Process Citations 临时性医学文献数据库，每天接收由medline的期刊出版商提供的尚未经过规范处理的新数据。经MeSH词表标引后，每周周末向medline移加。 记录标注:[PubMed - in process]

  6. 3、Publisher supplied citations 出版商直接向PubMed递送的电子文献。包括： （1）medline收录的期刊文献 （2）不属于medline收录范围的生物医学电子文献 记录标注： [PubMed - as supplied by publisher]

  7. （二）PubMed数据库的进入方式 1、www.pubmed.gov 2、图书馆网页 数字资源 外文数据库 Pubmed 3、使用google、baidu等搜索引擎查找网址。

  8. （三）检索界面 默认的检索界面（基本检索） 检索框 数据库选择 高级检索界面链接 限定检索的链接

  9. 高级检索 检索框 预览检索结果 检索式的编制器 检索历史查看和管理区域

  10. 限定检索 出版时间更新 文献类型 文献语种 研究类型 研究性别 数据库子集 限定年龄段 限定字段

  11. 检索结果页 免费全文链接 检索结果题录显示区域 综述

  12. （四）检索结果著录格式及字段标识符介绍 1、著录格式 文献篇名 作者名 文献来源 链接免费标示 链接免费全文 链接相关文献

  13. 2、字段标识符（检索入口/检索项） ALL All Fields 所有 TI Title 题名（篇名） AU Authors’ names 作者 AD Affilation 第一作者工作单位、地址 LA Language 语言 AB Abstract 文摘 MAJR MeSH Major Topic 主要主题词， MH MeSH Terms 主题词 SHP Subheadings 副主题词 SB Subset 子集 DP Publication Date 出版日期

  14. PT Publication Type 出版类型 IS ISSN 国际标准连续出版物编号 IP Issue 期刊的期号 VI Volume卷,册 TA Journal Title 刊名 TW Text Word 文本字段 TIAB Title/ Abstract 录入格式: 检索词 [字段标识] 如：Shi j s [au] AND 1999 [dp]

  15. 二、检索原理及检索功能 1、智能检索（词汇自动转换功能） 2、短语检索（强制检索）功能 3、截词检索功能 4、链接功能

  16. 1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping） 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。 1） MeSH转换表(MeSH Translation Table) 2）刊名转换表(Journal Translation Table) 3） 短语表(Phrase List) 4） 著者索引(Author Index)

  17. 1) MeSH转换表(MeSH Translation Table) 包括MeSH主题词、副主题词、统一医学语言系统（UMLS）中的同义词、主要的药物、药物制品及它们的同义词等词汇。 例如：AIDS "Acquired Immunodeficiency Syndrome"[MeSH Terms] OR AIDS [Text Word]

  18. 2) 刊名转换表（Journal Tanslation Table） 包括刊名的全称、刊名的MEDLINE形式缩写以及刊名的ISSN号 例如："new england journal of medicine" [All Fields] OR "N Engl J Med" [Journal]

  19. 3) 短语表（Phrase list） 该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS: Unified Medical Language System）和补充概念（物质）名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。

  20. 4) 著者索引（Author Index） 如果键入的术语在上述3表中未找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1-2个字母的短语，PubMed就到著者索引中去查找。

  21. 如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的检索词时，PubMed就会将该词断开分成单个单词后再重复上述自动词汇转换过程。如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的检索词时，PubMed就会将该词断开分成单个单词后再重复上述自动词汇转换过程。 • 如果仍找不到匹配词，则用AND将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找。 • 如键入：pressure point，其检索表达式为("pressure"[MeSH Terms] OR pressure[Text Word]) AND point[All Fields]

  22. 2、短语检索（强制检索）功能 如果在短语上加双引号，将不执行转换功能 例如： “single cell” （单个细胞） 备注：使用双引号检索，系统自动关闭词汇转换功能

  23. 3、截词检索功能 * 例：输入bacter*，检出bacteria、 bacterium、 bacteriophage等 备注： 1、截词检索只限于单词，对词组无效，如infection*可检索出“infections”、“infection”，但不能检索出“infection control”； 2、只能查找词表中前方一致的前150个检索词

  24. 4.链接功能 • （1）链接相关文献； • （2）链接NCBI数据库； • （3）链接外部资源； • （4）链接相关图书。

  25. 1）链接相关文献 • PubMed在检索结果的显示状态下，每条记录的下方均有“ ”超链。点击该链，系统按文献的相关度从高到低显示相关文献。

  26. （2）链接NCBI数据库 • PubMed在其主页上与NCBI的多个数据库建立了超链接。这些数据库包括：Protein[氨基酸（蛋白质）序列]数据库，DNA/RNA数据库，Structure（分子结构模型）数据库和Genome(基因组序列)数据库。

  27. （3）链接外部资源 • PubMed提供从检索结果到期刊全文、生物学数据、序列中心等的链接。该功能通过链接上述资源站点的方式来实现。在检索结果显示状态下，点击“LinkOut”进入相关网站。

  28. （4）链接相关图书 • 点击“Books”，可参考相关书籍的文摘页。书籍文摘页上的某些短语是超链接，点击短语超链，可连到相关图书的页码表，可在表上找到有关短语。

  29. 三、pubmed检索方式 (一) 词语检索 (二) 著者检索 (三) 刊名检索 (四) 布尔逻辑检索 （五）主题检索

  30. （一）词语检索 在pubmed主页的检索输入框键入英文单词或短语（不分大小写）后回车或点击【serch】,Pubmed即进行检索，并将检索结果显示在主页下方。 例：键入”cancer”后回车，Pubmed开始检索并将检索结果显示出来。

  31. cancer

  32. 检索结果数 结果显示目录 检索结果题录显示页 检索内容

  33. 备注： 如果检索结果不符合要求，需删除检索框中的检索词或者检索式，可直接点击“clear”清除。也可在Details状态下修改检索式，也可以用Limits（参见Limits键的用法）选择限定条件后再检索。此外，用户可以根据需要使用通配符*或者“”进行截词检索或强制检索

  34. （二）著者检索 在检索输入框中键入著者姓氏全称和名字首字母缩写，格式为：著者姓+空格+名字首字母缩写。 例：查找黄燮南发表的文章,可以输入： huang xn或huang x n 或huang xn[au]。 如果在检索框中只输入姓而没限制在[au]字段里查找，则系统将在MeSH和文本词以及著者索引中进行匹配。

  35. Huang x n[au]

  36. 作者检索三种不同方法结果显示

  37. (三)刊名检索 一、在提问框中输入刊名全称或MEDLINE形式的刊名简称，或ISSN号，然后回车或者点击【search】 二：将检索入口上方search的下拉选择 Journal,然后输入刊名后点击【search】可查出刊名的简称和全称。

  38. 方法一

  39. 方法二 刊名简称 刊名全称

  40. 备注： 如果刊名与MeSH词表中的词相同，例如（ gene therapy ），必须用刊名字段标识[ta],写成gene therapy [ta] 单个词的刊名也需要用[ta]限定，否则，系统将在全部字段中检索，如Science [ta]。

  41. gene therapy

  42. gene therapy [ta]

  43. gene therapy [journal]

  44. 检索结果比较 检索式gene therapy 结果106673 检索式gene therapy [ta] 结果3288 检索式gene therapy [journal] 结果3288

  45. 备注： 若刊名有括号，填写检索式时应将括号省略，如J Hand Surg[Am]应键为： J Hand Surg Am 使用刊名全称或简称均可查到数据库中的全部记录，但用ISSN号检索，不能保证一定能检索检索到数据库中较早的记录

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