240 likes | 937 Views
Viruslarda Enfeksiyozite Ölçümü. Titrasyon. Titrasyon. Bir virusun enfeksiyozite gücünün hesaplanmasına o virusun titrasyon u, enfeksiyozite gücüne ise o virusun titre si adı verilir. Titrasyonun Kullanım Alanları. -Nötralizasyon testinde kullanılan virusun standardizasyonunda
E N D
ViruslardaEnfeksiyozite Ölçümü Titrasyon
Titrasyon Bir virusun enfeksiyozite gücünün hesaplanmasına o virusun titrasyonu, enfeksiyozite gücüne ise o virusun titresi adı verilir. Titrasyonun Kullanım Alanları -Nötralizasyon testinde kullanılan virusun standardizasyonunda -İnaktivasyon kinetiğinde -Aşı hazırlamada -Virus saflaştırmada -Virus izolatlarının identifikasyonu ve klasifikasyonunda..
TİTRASYON (kullanılan konakçı sisteme göre) İn-vitro titrasyon İn-vivo titrasyon • - Makro titrasyon (DKID50) - Deneme hayvanlarında (LD50, MID50) • - Mikro titrasyon (DKID50) - ETY’lerde (YID50) • - Plak titrasyon (plak test) (POU)
Makrotitrasyon Mikrotitrasyon Plak titrasyon
1 ml TİTRASYON 1 ml 1 ml 1 ml 1 ml 1ml 1 ml 1 ml 1 ml Virus 9 ml PBS 10-110-210-3 10-410-510-610-710-8
Log10 DKID 50 = [ Xo - d/2 + d x (r/n) ] Xo = Tüm gözlerde CPE görülen en son sulandırma değerinin log10’u d = Sulandırma faktörünün log10’u r = Xo ve daha sonraki sulandırmalarda tespit edilen CPE pozitif gözlerin toplamı n = Her sulandırma basamağı için kullanılan konakçı sistem sayısı
Log10 DKID 50 = [ Xo - d/2 + d x (r/n) ] Sulandırma Basamağı CPE/Göz sayısı 10-14/4 10-2 4/4 10-3 4/4 10-43 / 4 10-52/4 10-60/4 HK 0/4 VK 4/4 log10 DKID 50 = [ ( 3 – ½ + 1 x (9 / 4)] log10 DKID 50 = - 4,75 DKID 50 =10-4,75 / 0.1 ml 100DKID 50 =10-2,75 / 0.1 ml
DKID50 ne demek? • İnokule edildiği in vitro sistemlerin EN AZ yarısında cpe oluşturan virus sulandırma değeri. • Hangi virusuntitresi daha büyük? • DKID50 : 10-4,25/0.1 mL • DKID50 : 10-5,30/0.1 mL
Plak Titrasyon (Plak Test) • Enfekte hücre kültüründe virus çoğalması nedeniyle oluşan etrafı sınırlı • boşluklara Plak adı verilir. • Plaklar oluşumlarına göre; • Litik Plaklar: Ortalarının boş olması ile, • Dejeneratif Plaklar: Ortalarınında dejenere olmuş hücrelerin bulunması • Proliferatif Plaklar: Ortalarında yoğun hücre proliferasyonunun bulunması.
Ne amaçla kullanılır? • Virusların enfeksiyoziteleri hakkında bilgi sahibi olmak, • Virusları klonlamak-saflaştırmak, • Virusları konsantre etmek
Sağlıklı bir Plak Testte: • Enfekte edilmemiş kontrollerde Plak oluşmamalı, • İnokule edilen virusun Plak oluşturma özelliği olmalı, • Plak sayısı virus dozu ile paralel olarak atış göstermeli, • Plak oluşumları spesifik immun serumlarla durdurulabilmeli, • Aynı virusla yapılan Plak Testler aynı sonucu vermelidir.
Testin Yapılışı: • Virus log10’a göre tüplerde sulandırılır, • Her sulandırma basamağı için 2’şer petri kullanılır, • Petri kutusundaki hücrelere adsorbsiyonlu metod ile virus inokulasyonu • yapılır, • 37oC’lik CO2’li etüvlerde 1 saat bekledikten sonra, • 2xEarle + % 1.8-2’lik Noble agar karışımı virus üretme vasatı olarak • kullanılır, • Petriler CO2’i etüvlere kaldırılır, her gün DK mikroskobunda incelenir, • Plakların daha iyi görülebilmesi için canlı hücreler Nötral Red ile boyanır. • Plaklar sayılarak PFU (Plak Formation Unit) tespit edilir.
Virus Üretme Vasatı Olarak; 2xEarle + %1,8-2’lik Noble Agar Oluşan Pakların daha iyi görülebilmesi için hücreler üzerine; Nötral Red + 2xEarle + %1,8-2’lik Noble Agar kullanılır.
Değerlendirme; Sulandırma / Plak sayısı 10-1 : çok 10-2 : çok 10-3 : çok 10-4 : çok 10-5 : 100 den fazla 10-6 : 81 10-7 : 2 10-8 : 0 PFU: 81x10-6
Viral Enfeksiyonlarda Teşhis Direkt Teşhis İndirek Teşhis (Virus/Antijen tespiti) (Antikor tespiti) Virusu Üretmeksizin Virusu Üreterek AGID KFT ELISA SN TPHA NIF NPLA RIA • Virusun eldesi • Tiplendirme • Fiziksel (ısı-pH) • Kimyasal • (eter, kloroform, • 5IDUR, 5BDUR) • Biyolojik Özellikleri • (Hemadsorbsiyon, • Hücre spektrumu, • Konakçı spektrumu) - Morfolojik Tanı (EM) - Histopatoloji (İnkluzyon cisimciği tespiti) - Bilinen İmmun serum kullanarak Ag tespiti - PCR - PAGE
Fiziksel – Kimyasal İdentifikasyon Kriteleri 1- Nükleik asit tayini 2- Filtrasyon ile yaklaşık virus büyüklüğünün tespiti 3- Isı hassasiyet testi 4- Tripsin hassasiyet testi 5- pH hassasiyet testi 6- Çift değerli katyonlarla muamele 7- Lipit eritici maddelerle muamele 8- Hemaglutininlerin tespiti 9- Elektron mikroskopi
Virusların İdentifikasyonunda kullanılan Fiziksel ve Kimyasal testler • Nükleik asit tayini (DNA-RNA) • Virusların yağ eriticilerine karşı duyarlılığı • Virusların asit ve alkali değerlere duyarlılığı • Virusların ısıya dayanıklılık testleri • İki değerli katyonlarla ısı hassasiyet testi