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微生物的分类与命名

微生物的分类与命名. 微生物的范围. 细菌 支原体 螺旋体 立克次体 衣原体 放线菌 真菌 病毒. 原核型单细胞. 真核型单细胞. 非细胞形态. 分类等级. 界 (kingkom) 门 (divisions) 纲 (classes) 目 (orders) 科 (families) 属 (genera) 种 (species). 原核生物和真核生物的比较. 第二节 细菌的分类单位、 系统和命名. 一、细菌的分类单位和命名. 种 : 是细菌分类的基本单位。形态学和生理学性状相同的细菌群体构成一个菌种。

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微生物的分类与命名

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Presentation Transcript

  1. 微生物的分类与命名

  2. 微生物的范围 • 细菌 • 支原体 • 螺旋体 • 立克次体 • 衣原体 • 放线菌 • 真菌 • 病毒 原核型单细胞 真核型单细胞 非细胞形态

  3. 分类等级 • 界(kingkom) • 门(divisions) • 纲(classes) • 目(orders) • 科(families) • 属(genera) • 种(species)

  4. 原核生物和真核生物的比较

  5. 第二节 细菌的分类单位、系统和命名

  6. 一、细菌的分类单位和命名 • 种: 是细菌分类的基本单位。形态学和生理学性状相同的细菌群体构成一个菌种。 • 属：性状相近、关系密切的若干菌种组成属。 • 科：相近的属归为一个科 。

  7. 菌株：同一种不同来源的细菌称为该菌的不同菌株。菌株：同一种不同来源的细菌称为该菌的不同菌株。 • 标准株（standard strain：具有某种细菌典型特征的菌株称为该菌的标准株。

  8. 细菌种的科学命名法： • 1、英文名 • 拉丁文双命名法 • 属名在前：为名词，首字母大写 • 种名在后：为形容词，首字母小写斜体 • 例 ：结核分枝杆菌 Mycobacterium tuberculosis • 2、中文译名 • 种名在前、属名在后 • 亚种以上分类按命名法规的规定，亚种以下命不受法规约束。

  9. 《国际细菌命名法规》（International Code of Nomenclature of Bacteria，简称ICNB）：决定细菌的命名。 • 《国际系统菌学杂志》(International Journal of Systematic Bacteriology;IJSB)：发表新细菌命名提案。

  10. 二、细菌的分类系统 • 1、《伯杰系统细菌学手册》 • （Bergey’s Manual of Systemic Bacteriology）

  11. 自1923年《伯杰鉴定细菌学手册》（Bergey’s mannual of determinative bacteriology）第一版问世以来，每隔四五年修订一次，至1974年已出版至第八版。 • 1984年将其易版为《伯杰系统细菌学手册》（Bergey’s manual of systemic bacteriology），共分4卷。在此新版中，对细菌的高级分类作了重新安排，以细菌细胞壁的结构特点，将原核生物界分为4个菌门：薄壁菌门（Gracilicutes）、厚壁菌门（Firmicutes）、软壁菌门（Tenericutes）和疵壁菌门（Mendosicutes）。

  12. 伯杰系统细菌学手册第1卷（1984年）登载医学、工业和普通微生物中重要革兰阴性细菌；第2卷（1986年）为放线菌外的革兰阳性菌，第3卷为古细菌、蓝藻菌和其他革兰阴性菌；第4卷为放线菌。伯杰系统细菌学手册第1卷（1984年）登载医学、工业和普通微生物中重要革兰阴性细菌；第2卷（1986年）为放线菌外的革兰阳性菌，第3卷为古细菌、蓝藻菌和其他革兰阴性菌；第4卷为放线菌。

  13. 2、CDC（center for disease control and prevention）分类 • 该系统由美国疾病控制和预防中心（center for disease control and prevention，CDC）使用核酸杂交和核酸序列分析结果编排 。

  14. 三、细菌的分类方法

  15. 一、生理学与生物化学分类法 • 1、传统分类法 • 19世纪以来，以细菌的形态、生理特征为依据的分类奠定了传统的分类基础。 • 选择一些较为稳定的生物学性状，如细菌的形态结构、染色体、培养特性、生化反应、抗原性作为分类依据，然后按主次顺序逐级区分。 • 这种方法使用方便，分类亦较为明确，但往往带有一定程度的盲目性。

  16. 2、数值分类法 • 20世纪60年代，随计算机的应用而发展的细菌分类方法。它对细菌的各种生物学性状按“等重要原则”进行分类，一般需选用50项以上的生理、生化指标逐一进行比较，通过计算机分析各菌间相似度，划分细菌的属和种，并确定它们的亲缘关系。

  17. 二、遗传学分类法 • 1、DNA G+C mol%测定 • DNA分子两条链上4种碱基的总分子量为100，测定其中G+G或A+T摩尔百分比，能反映出细菌间DNA分子同源程度，习惯上以G+C作为细菌分类标记。 • 不同菌属间的G+Cmol%范围很大，在25%~75%之间，但同一种细菌G+Cmol%相当稳定，不受菌龄、培养条件和其他外界因素影响，亲缘关系越近的细菌，它们G+C mol/%越相近。 • 目前测定的技术多用加热变性法。

  18. 加热变性的DNA由于双链DNA分开，使A 260紫外吸收度增加。紫外吸收度的增加与解链程度成正比。用Tm表示DNA分子中50%解链时的温度，Tm随G+Cmol%的含量线性增加。在通常条件下，G+Cmol%为40的DNA其Tm约为87℃，每增加1%G+Cmol含量，Tm约增加0.4℃，因而通过Tm可测出G+Cmol%含量。

  19. 2、核酸同源值测定 • 利用DNA分子杂交技术测定DNA分子的相似度，此办法较精确。 • 其基本步骤均是先提取菌株的DNA，加热变性解链，然后将两种变性的DNA（其中一种为标记DNA或rRNA）混合液在一定的温度下保温复性，重新得到杂交的双螺旋DNA分子，鉴定其双螺旋结合率。结合率的大小反映了DNA碱基序列的相似程度和菌种之间的亲缘关系的亲疏。 • DNA/DNA杂交时，同一菌的结合率为100%，80%~90%的同源为同一种内、同一亚种的细菌，60%~70%的同源性为同一种内不同亚种的细菌，20%~60%则认为是同一属中的不同菌种。

  20. 3、核蛋白体RNA碱基序列测定 • 细菌核蛋白体RNA序列比较保守，其变化十分缓慢。分离细菌16SrRNA，用T1核酸酶消化，分析寡核苷酸的碱基序列可测出rRNA的相关性。目前，由细菌16SrRNA序列分析已分出了真细菌和古细菌，前者包括；后者主要为伯杰手册中疵壁菌门内的细菌。

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