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Informatique médicale et Technologies de Communication

Informatique médicale et Technologies de Communication. Pierre Le Beux Laboratoire Informatique Médicale. Informatique médicale et Technologies de communication. Informatique médicale Le traitement de l‘ information Matériels Logiciels

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Informatique médicale et Technologies de Communication

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  1. Informatique médicale et Technologies de Communication Pierre Le Beux Laboratoire Informatique Médicale

  2. Informatique médicale et Technologies de communication • Informatique médicale • Le traitement de l‘ information • Matériels • Logiciels • Nouvelles technologies de l Information et communication • Les réseaux

  3. Formation au C2I (certificat Informatique et internet) • Requis en médecine 2é et 3è année • PCEM2 a Rennes • 8H de cours • 20H de TD/TP Contrôle connaissances Evaluation pratique en TD Un examen sur table (QCM) en Mai Juin Modalités de notation et jury différents pour C2i

  4. Liaison au C2I (certificat Informatique et internet) • Savoir lire une documentation • Etre capable de comprendre concepts et vocabulaire • Commander ou étendre un système complet • Connaitre les principales Fonctions • Démarrer et arrêter • Sélection avec Souris ou pointeur • Gestion de fichiers • Connaissance des applications • Sécurité et éthique • Contrôle des périphériques • Langage de commande

  5. Informatique médicale • Informatique appliquée à médecine et santé • Contexte • Informatisation des hôpitaux • Laboratoires et imagerie médicale • Informatisation des médecins • Les réseaux et filières de soins • Dossier Médical Patient (Partagé) • Télémédecine et télésanté

  6. Informatique médicale • Laboratoires • Analyses etr informatisations • Biochimie, hemato, anapat .. • Résultats sous formes informatique (serveur labo) • Imagerie médicale • Tout Numérique • Scanner,IRM, Radio … Echo.. • Système informatisés (SIR) • Stockage et diffusion (PACS)

  7. Informatique médicale • Système d ’information hospitalier(SIH) • Admissions transfert et sortie • Dossiers médicaux informatisés • Production de soins(infirmiers) • Liaison Systèmes de Laboratoires • Liaison Système Information Imagerie • La communication d ’information • Réseaux intra et inter-établissements • Intranet Extranet Internet • Réseaux Sociaux (logiciels grand public)

  8. Informatique médicale • Médecine Libérale • Informatisation cabinets médicaux • Dossiers médicaux informatisés + DMP • Comptabilité • Aide à la décision diagnostique et thérapeutique • La communication d ’information • Accès Réseau santé social (Feuilles soins électroniques) • Accès réseau Internet

  9. Informatique médicale • Aide au diagnostic • Bases de données • Bases de connaissances • Modèles physiologiques virtuels • Aide à la thérapeutique • Base de médicaments • Prescription en ligne • Chirurgie assistée et Réalité virtuelle

  10. Informatique médicale • Formation initiale • Bases de cas cliniques, QCM, QROC ... • Réseau pédagogique • Portail Université (ENT) • Université médicale virtuelle (UMVF, UNF3S) • Bibliothèques numériques • Nouvelles technologies éducatives (APP,ARC) • La Formation continue • Multimédia + Interaction • Serveurs formation à distance

  11. Architecture d'un ordinateur • Généralités • Unité centrale • Mémoire centrale • Périphériques • Système d'exploitation • Langages de Programmation • Langage de bas niveau • Langage de haut niveau • Traduction en langage machine

  12. Architecture d’un ordinateur

  13. Architecture d’un ordinateur • Machine de Von Neumann Mémoire Centrale Unité Centrale Entrées sorties

  14. Unité Arithmétique et Logique (UAL) • Exécute les instructions (en binaire) • Arithmétiques (+ - x /) • Logiques (Et Ou Non) • Travaille sur les registres de données et les indicateurs • Langage Machine : • Liste des instructions que l'UC est capable de comprendre • Langage symbolique spécifique (Assembleur)

  15. Unité Centrale de Traitement (UC ou CPU) • Unité de ContrôleContrôle le transfert des donnéesDécode les instructionsTransmet les instruction à l'UALDécode les ordres venant de l'extérieur (I/0) • Contrôleurs de l'UCAssure la communication entre l'UC et l'extérieurGestions Entrées / SortiesCapacité de recevoir des signaux externes (clavier, souris ....)Envoyer des signaux à l'extérieur (écran, imprimante ...)

  16. Mémoire Centrale • Mémoire • Interprétation de la valeur d'une cellule d'information définit le codage de l'information (en binaire) • Ex: Fichier texte • En mémoire c'est un suite d'octets = correctement interprété c'est une suite de caractères • 1 octet = 1 caractères (à afficher, a imprimer ...) • Codage ASCII 'a' = 20 • ASCII: American Standard Communication Information Interchange

  17. Mémoire Centrale • Programme • Réalise un algorithme • En mémoire c'est une suite de mots machine (suite de bits ou d'octets ) • Correctement interprété c'est une suite de commandes (instructions) • Données • Fournies par utilisateur • Utilisées par programmes

  18. Mémoire centrale • La mémoire centrale contient le programme et les données au moment de l'exécution. • Mémoire Vive (RAM) • Rapide • Capacité limitée (méga Octets • Volatile • Mémoire Vive Flash (SSD) • Mémoire réinscriptible non volatile • Mémoire Morte (ROM) • Programmes figés (lancement) • Préprogrammée au cours de la fabrication

  19. Catégories d’ ordinateur • Gros ordinateur (mainframe) • Gestion et calculs • Serveurs • Un ou plusieurs • Ferme , coopération, parallelisation • Virtualisation + Nuages de calculs(Cloud Computing) • Ordinateurs de bureau • Tour + écran • intégrés • Ordinateurs portables + Tablettes • Ordinateurs de poche • Assistants et téléphones 4e G

  20. Caractéristiques d ’un ordinateur • Puissance d'un ordinateur • Longueur du mot machine • Longueurs courantes: 4, 8, 12, 16, 32 bits,64 bits • Vitesse d ’exécution • Cycle Horloge (de 1 à 4 GHz) • 1 instruction / micro-seconde ...nano-seconde • Capacité de la mémoire centrale • nombre total d ’octets que celle-ci peut contenir • Capacitéss: 512 Méga, 1giga…. • Bus • Correspond liaisons(fils) entre composant • Technologies (MOS, CMOS)

  21. Mémoires secondaires • Mémoires Périphériques • Accès Lents • Grande capacité • Non volatile • Mémoires vives • Disques durs • Disquettes , Zip,Flash,clés USB • Mémoires mortes • CD/ROM DVD

  22. Périphériques • Entrées • Clavier • Souris • Reconnaissance vocale • Scanner • Capteurs (stylet,doigts,voix,automates…) • Sorties • Écrans (Vidéo, Cristaux liquides .,plasma..) • Imprimantes

  23. Périphériques • Communication • Réseau filaires • Ethernet (cables) • Modems(Modulateur/Démodulateur) • Réseaux infra rouge (télécommandes + Hauts débits) • Réseaux Hertziens • Sans fil • Wifi • Bluetooth • Satellite

  24. Traitement Information • Quantum d ’information • élément binaire (0 ou 1) • Bit (Binary digit) • Octet = 8 bits • Mot machine (8, 16, 32, 64 bits) • Numération binaire (base 2) • Calculs numériques • Logique • Vrai =1 Faux =0 • Raisonnement

  25. Codage de l ’information • n bits permettent de coder • 2n objets • 8 bits (28 =256 objets) • 16 bits (216 = 65 536 objets) • Pour N Objets Combien de bits ? • Entier supérieur à log2 (N) • 1000 objets (log2 (1000) = 10 bits) • 128objets (log2 (128) = 7 bits)

  26. Codage de l ’information • Caractères • 26 lettres + blanc => 5 bits • 26 lettres + 10 Chiffres => 6 bits • Majuscules + Minuscules + chiffres =>7 bits • Caractères spéciaux => 8 bits = code ASCII • Unicode sur 16 bits • 65536 objets • Tous les alphabets + idéogrammes

  27. Codage de l ’information • Nombres entiers • 8 bits (-128 à +127) • 16 bits (-32768 à + 32767) • 32 bits • Nombres réels • Mantisse Exposant • 32 bits ( 8 bits exposant + 24 bits mantisse) • 64 bits

  28. Codage de l ’information • Image Statique • Image Bitmap: 1 bit par pixel (Noir/Blanc) • 1024 X 1024 points : 1 M de Bits :128 K Octets • Image 512 X 512 X 8 bits (256 Niveaux de gris) 256 K Octets • Image 1024 X 1024 X 8 bits (256 Couleurs) 1 M Octets • Image 1024 X 1024 X 16 bits (65000 Couleurs) 2 M Octets

  29. Codage de l ’information • Séquence d’images • Endoscopie • Angiographie + coronarographie+ échographie • Images 512x512 à 8 niveaux de gris (256 K octets) • 18 images/s 4.5 M octets • 5 secondes 22 M octets • Vidéo 24 images par seconde • 6 M octets /seconde • 1 minute = 36 M octets • Possibilité de Compression • De facteur 4 (sans perte) à 10 (avec perte d ’information)

  30. Codage de l ’information • Signaux Numériques • ECG EEG EMG ... • Taille mémoire dépend de la fréquence d'échantillonnage • 1 Point tous les 1/100 s • 200 à 400 Octets par seconde • 12 Ko à 24 Ko par minute • 1.44 Mega octets pour 1 H

  31. Système d ’exploitation • Logiciels (partie en ROM) • Sur le disque dur DOS (Disk operating system) • Fonctions • Gestion des ressources de l'ordinateur • Gestion de la mémoire (mémoire virtuelle) • Gestion des périphériques • Gestion des fichiers • Protection et gestion des erreurs • Contrôle des programmes • Langage de commande

  32. Système d ’exploitation • Gestion Unité Centrale • Plusieurs programmes/utilisateurs • Interruptions (temps réel) • Gestion mémoire centrale • Partitions ou mémoire virtuelle • Charger un programme en mémoire • Libérer de la mémoire • Partage de mémoire entre plusieurs applications • Partition fixe, partition dynamique - Swapping • Mémoire virtuelle

  33. Système d ’exploitation • Gestion des Périphériques • Ecran • Plusieurs fenêtres • Menus… • Clavier • (Type + touches fonctions) • Souris (1 clic 2 clics ..)/Mécanisme de sélection • Imprimante • partage de l'imprimante entre plusieurs utilisateurs

  34. Système d ’exploitation • Gestion des disques • Disque dur , Flash, USB , ZIP /Disquette • CD/ROM ou DVD • Gestion des fichiers • Hiérarchie • Droits & Partage • Langage de commande • Interpréteur de commande • Mode terminal (Clavier) • mode iconographique (icônes,menus ,Souris)

  35. Système d ’exploitation • Gestion du Temps • Temps Partagé • Temps Réel • Modèle Organisationnel • Maître - Esclave.. • Client - Serveur • Ouverture / Fermeture • Portabilité des applications • Interopérabilité

  36. Système d ’exploitation • Mono-Utilisateur - Monotâche • PC MS/DOS (historique) • Mono-Utilisateur - Multitâches • Macintosh 9 et X • Windows 95 98 00 XP 7 • Multi-Utilisateurs - Multitâches • Unix Linux Mac Os X • Windows NT XP pro Windows Serveur 2003/2008 • Vista • Systèmes propriétaires

  37. Système d ’exploitation • Interface Homme Machine • Mono-fenêtre (PC MS/DOS) • Multifenêtres • Mac /OS 9 et X • Windows 95 98 2000 XP Vista • Windows 7 • X Windows (Unix linux) • Multimédia • Son (musique + voix) • Images Haute résolution • Vidéo

  38. Système d ’exploitation • Système de fichiers • Base du système exploitation • Contenu: suite de bits • Type de fichiers • Texte, binaire,executable… • Lié a une application • Structuré, format :html,doc, xls .. • Protégé, modifiable ou non, crypté • Visualisation • Communication • Réseaux : Locaux … Ethernet .. Wifi • Réseaux nationaux …mondiaux

  39. Applications • Logiciels Utilitaires • Liés au système exploitation • Configuration, compacteurs,tests • Liés aux périphériques:scanners, OCR • Liés aux langages • Progiciels • Traitement texte, tableurs, • PréAO • Navigateurs • Spécifiques • Statistiques • Gestion Cabinet • Dossiers médicaux

  40. Liaison au C2I (certificat Informatique et internet) • Savoir lire une documentation • Etre capable de commander ou étendre un système complet • Connaitre les principales Fonctions • Démarrer et arrêter • Sélection avec Souris ou pointeur • Gestion de fichiers • Connaissance des applications • Sécurité et éthique • Contrôle des périphériques • Langage de commande

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