1 / 15

Peptiidsideme süntees ribosoomidel

Peptiidsideme süntees ribosoomidel. Peptiidsideme sünteesi aktiivsuse kui ribosoomi integraalse omaduse näitasid R. Traut ja Robin Monro (J. Mol. Biol. 1964) kasutades puromütsiini aktseptorina ja polüfenüülalaniini doonorina 50S kui PTaasse aktiivsuse kandja Monro, J. Mol. Biol. 1967.

adlai
Download Presentation

Peptiidsideme süntees ribosoomidel

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Peptiidsideme süntees ribosoomidel • Peptiidsideme sünteesi aktiivsuse kui ribosoomi integraalse omaduse näitasid R. Traut ja Robin Monro (J. Mol. Biol. 1964) kasutades puromütsiini aktseptorina ja polüfenüülalaniini doonorina • 50S kui PTaasse aktiivsuse kandja Monro, J. Mol. Biol. 1967

  2. PTC substraadid • Viimases töös kasutati doonorsubstraadina F-Met- (CACCA-) fragmenti • Minimaalne aktseptorsubstraat on puromütsiin (või vesi) • Minimaalne doonorsubstraat pA(fMet) • Pikendades nukleotiidset osa muutuvad mõlemad, nii doonor kui aktseptor, paremaks

  3. aa-tRNA 3’ ots ja puromütsiin

  4. Põhilised mudelsubstraadid • A-saidis: puromütsiin, Phe-tRNA või selle 3’ fragmendid (CACCA) • P (doonor) saidis: fMet-tRNA, (C,U)ACCA-Leu-Ac

  5. Katalüüsitavad reaktsioonid • Peptiid(amiid)sideme süntees • Peptidüül-estersideme hüdrolüüs • Ümberesterifitseerimine (substraat hüdroksü-puromütsiin) • Tioestersideme süntees • Tioamiidsideme süntees

  6. Reaktsiooni tingimused (E. coli ribosoomidel) • Ühevalentsed katioonid K ja NH4 • Na, Li ja Cs inhibeerivad reaktsiooni • Kahevalentsed katioonid: Mg>Mn. Ca ei sobi, ülejäänud inhibeerivad • pH optimum on >8

  7. Peptidüültransferaasne reaktsioon

  8. Valgud katalüütilise tsentri läheduses

  9. Katalüütiline tsenter

  10. tRNA interaktsioonid ribosoomi peptidüül-transferaasses tsentris

  11. Katalüüsi mehhanism I Nissen…Steitz, 2000

  12. Katalüüsi mehhanism II

  13. Katalüüsi mehhanism III

  14. Mutatsioonid katalüütilises tsentris

  15. Kokkuvõtte asemel • Ribosoomide katalüütiline aktiivsus tekib 50S subühiku assambleerimise käigus viimasena • Ajaliselt on limiteeriv pigem sbstraadi korrektne sidumine A saiti kui reaktsioon ise • Arvestades PTC madalat spetsiifikat katalüüsitavate reaktsioonide suhtes, aga väga kõrget stereospetsiifilisust, tuleb orientatsioonilist katalüüsi pidada väga oluliseks, aqga kas ka ainsaks?

More Related