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多个样本均数比较的方差分析. 南方医科大学生物统计系 谭旭辉. 方差分析 analysis of variance (ANOVA). 英国统计学家 R.A.Fisher 1928 年首先提出的统计分析方法. 主要内容. 方差分析的基本思想和应用条件 完全随机设计的单因素方差分析 随机区组 / 配伍组设计资料的方差分析 多个均数间的两两比较.
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多个样本均数比较的方差分析 南方医科大学生物统计系 谭旭辉
方差分析 analysis of variance (ANOVA) • 英国统计学家R.A.Fisher • 1928年首先提出的统计分析方法 方差分析
主要内容 • 方差分析的基本思想和应用条件 • 完全随机设计的单因素方差分析 • 随机区组/配伍组设计资料的方差分析 • 多个均数间的两两比较 方差分析
例11-1为了解烫伤后不同时期切痂对肝脏三磷酸腺苷(ATP)含量的影响,将30只雄性大鼠随机分为3组,每组10只;A组为烫伤对照组,B组为24小时切痂组,C组为96小时切痂组。全部动物统一在烫伤后168小时处死,并测定其肝脏的ATP含量,结果如下表,问不同时期切痂对ATP含量有无影响?例11-1为了解烫伤后不同时期切痂对肝脏三磷酸腺苷(ATP)含量的影响,将30只雄性大鼠随机分为3组,每组10只;A组为烫伤对照组,B组为24小时切痂组,C组为96小时切痂组。全部动物统一在烫伤后168小时处死,并测定其肝脏的ATP含量,结果如下表,问不同时期切痂对ATP含量有无影响? 方差分析
分析资料的基本情况 • 实验设计:完全随机设计 • 处理因素:不同时期进行切痂 • 因素水平:24h切痂、96h切痂、对照 • 观测指标:ATP含量 • 目的:通过比较不同处理组肝ATP含量之间的差异是否具有统计学意义,从而判断不同时期进行切痂是否对肝ATP含量有影响。 方差分析
方差分析的基本思想 • 根据变异的来源,将全部观察值总的离均差平方和及自由度分解为两个或多个部分,除随机误差外,其余每个部分的变异可由某些特定因素的作用加以解释。 • 通过比较不同来源变异的方差(也叫均方MS),借助F分布做出统计推断,从而判断某因素对观察指标有无影响。 方差分析
推广:用A表示研究因素,用Ai表示它的第i个水平数,那上面的例子可以一般化以便推广:推广:用A表示研究因素,用Ai表示它的第i个水平数,那上面的例子可以一般化以便推广: 方差分析
目的:分析A因素的i个水平的处理效应是否有差异目的:分析A因素的i个水平的处理效应是否有差异 具体分析步骤: 1.建立假设检验 2.分析资料的变异 标准差: 方差: 方差分析
可以看出分子就是离均差平方和(用SS表示),而分母就是自由度。这样方差计算式就可以写成:可以看出分子就是离均差平方和(用SS表示),而分母就是自由度。这样方差计算式就可以写成: • 离均差平方和是可以分解的,对于总离均差平方和有:
对总离均差平方和 进行分解: 其中交叉项 : 因此 : 方差分析
即: • 而总自由度 也可以分解成 和 。 且有: 方差分析
方差 均方 方差分析
构造统计量F: • 若用T表示处理效应,用E表示随机误差,那么有 • 若H0成立即μ1= μ2 = μ3,则MS组间/MS组内应该接近于1。若处理因素的作用有效,则MS组间将明显大于MS组内,因此F值将明显大于1,要大到多少才有统计学意义呢? • 计算出统计量F,查F界值表得对应的P值,并与进行比较,以确定是否为小概率事件 方差分析
F值、P值与结论的关系 • F 分布是一种偏态分布,F 分布有两个自由度,即组间自由度 及组内自由度 又分别称为分子自由度 和分母自由度 。 • 由于方差分析是通过计算F 统计量来进行统计检验,所以方差分析又可以叫作F 检验。 方差分析
综上即是整个方差分析的基本思想,即方差分析就是根据资料设计的不同类型,将总变异按照变异的不同来源,分解为两个或多个部分,总自由度也分解为两个或多个部分,每个部分的变异可由某因素的作用来解释,通过比较可能由某因素所致的变异与随机误差(比如组内变异),计算F 统计量,并通过查F 界值表确定P 值,从而了解该因素是否对测定结果有影响。 方差分析
方差分析的应用条件 • 各样本是相互独立的随机样本 • 各样本来自正态分布 • 各样本所来自的总体方差相等,即方差齐同。 方差分析
一、完全随机设计 是将受试对象随机地分配到各个处理组中进行实验的一种实验设计 特点是简单易行,统计分析简单,各组例数可以不等,但要求实验单位有较好的同质性 方差分析
二、方差分析步骤 例11-2(续例11-1) 1、建立假设、确定显著性水准 α H0:μ1=μ2=μ3(三组大鼠肝脏的ATP含量值无差别) H1:μ1,μ2,μ3不全相等(三组大鼠肝脏的ATP含量值有差别) α=0.05 2、计算检验统计量F值 • 计算各组的 、 ∑Xi、 ∑X2i及总的 、∑X和∑X2。 方差分析
计算C 式中N为各组样本含量之和 本例C=300 .472/30=3009.4074 • 计算总的变异及总的自由度
计算组间变异及相应的自由度 方差分析
计算组内变异及相应的自由度 • 带入下表,求出相应的MS和 F 方差分析
完全随机设计的方差分析表 方差分析
列出方差分析表 方差分析
3、确定P值、下结论 从上表得F=14.32,查附表4(方差分析界值表,单侧),自由度相同时, F界值越大,P值越小 。 因F0.05, 2,27= 3.35;故P<0.05,按=0.05水准拒绝H0,接受H1,可认为三个不同时期 切痂对ATP含量的影响有差别。 • 方差分析的结果只能总的来说多组间是否有差别,具体哪些组间有差别需要进一步做两两比较 方差分析
随机区组设计/配伍组设计资料的方差分析(two-way ANOVA) 方差分析
一、随机区组设计 相当于配对设计的扩大。具体做法是将受试对象按性质相同或相近者组成b个单位组(配伍组),每个单位组中有k个受试对象,分别随机地分配到k个处理组。这种设计使得各处理组受试对象数量相同,生物学特点也较为均衡。由于减少了误差,试验效率提高了 方差分析
例A:为研究注射不同剂量雌激素对大白鼠子宫重量的影响,取4窝不同种系的大白鼠(b=4),每窝3只,随机地分配到3个组内(k=3)接受不同剂量的雌激素的注射,然后测定其子宫重量,问注射不同剂量的雌激素对大白鼠子宫重量是否有影响?例A:为研究注射不同剂量雌激素对大白鼠子宫重量的影响,取4窝不同种系的大白鼠(b=4),每窝3只,随机地分配到3个组内(k=3)接受不同剂量的雌激素的注射,然后测定其子宫重量,问注射不同剂量的雌激素对大白鼠子宫重量是否有影响? 方差分析
大白鼠注射不同剂量雌激素后的子宫重量 方差分析
配伍组设计的变异分解 组间变异 处理?+随机 总变异 配伍?+随机 配伍组变异 误差变异(随机)
建立假设、确定检验水准 H0:1= 2= 3雌激素对大白子宫重量无影响 H1: 1、 2、 3不相等或 不全相等 =0.01 • 计算检验统计量F 方差分析
随机单位组设计的方差分析表 方差分析
随机单位组设计的方差分析表 方差分析
确定P 值、下结论 • 处理间差别的推断:v处理 = 2,v误差 = 6,查表得F0.01,2,6=10.92,因P <0.01,按 =0.01水准拒绝H0,故可认为三个剂量组对大白鼠子宫重量有影响。 • 配伍组间差别推断:F0.01,3,6=9.78,配伍组间P<0.01,按=0.01水准拒绝H0,故认为各配伍组间的总体均数有差别。此设计将配伍组间变异从组内变异中分解出来,减少了误差,较之完全随机设计,试验效率提高了。 方差分析
配伍组设计的基本思想 组间变异 总变异 配伍组变异 组内变异 误差变异 方差分析
如果F配伍<1 , MS配伍<MS误差 , 配伍设计无效(或曰无必要进行配伍设计) • 应将SS配伍与SS误差合并, v配伍与 v误差合并,计算出新的MS误差’,并计算新的F值,再查F 界值表,下结论。 F处理=MS处理/MS误差 F处理’= MS处理/ MS误差’ 方差分析
多个样本均数间的两两比较 方差分析
当方差分析结果为P<0.05时,只能说明比较的几个组间总的来说有差别,尚不能说明具体哪两个组间有差别。当方差分析结果为P<0.05时,只能说明比较的几个组间总的来说有差别,尚不能说明具体哪两个组间有差别。 • 进行组间的两两比较。若采用两均数间比较的t检验进行两两比较,则会增大犯一类错误的概率。 • 若有3个组比较,设α=0.05,则其不犯一类错误的概率为1-0.05=0.95,比较三次则其不犯一类错误的概率为 ,此时犯一类错误的概率为1-0.8574=0.1426,远大于预先设定的0.05。 方差分析
SNK检验(Student-Newman-Keuls)q检验 • 适用于多个均数间的两两比较。 • 建立假设、确定检验水准 H0:μi= μj H1:μi≠μj α=0.05 • 计算检验统计量(q值 ) 将3个样本均数从小到大顺序排列,并编上秩次 方差分析
均数8.04 9.25 12.76 组别 对照组 96h组 24h组 秩次 1 2 3 列出两两比较计算表,共进行3 次两两比较 方差分析
查q值表,确定P值,下结论 已知v误差=27,查附表5,按α =0.05水准,认为24小时切痂组的ATP含量明显高于烫伤对照组和96小时切痂组。而96小时切痂组和烫伤对照组的ATP含量差别无统计学意义。提示:休克期切痂有助于肝脏ATP含量的回升。 方差分析
LSD-t检验( 最小显著差异t检验,Least significant difference) • 适用于某一对或几对在专业上有特殊价值的均数间的比较。 方差分析
比较:24小时切痂组和对照组 • 建立假设并确定检验水准 H0:24h= 0 H1:24h ≠ 0 =0.05 • 求LSD-t值 方差分析
查表,下结论 v误差=27,查 t界值表,P<0.001,按=0.05水准,拒绝H0,接受H1,两组差别有统计学意义,可以认为24小时切痂组比对照组的ATP的含量高。 方差分析
Dunnett-t检验 • 适用于k-1个实验组与一个对照组均数差别的多重比较。 方差分析
建立假设并确定检验水准 H0:i= 0 H1:i≠ 0 =0.05 • 求Dunnett-t值 方差分析
查表,下结论 以ν误差=27,实验组数T=k-1=3-1=2和 =0.05 查附表 6,q’0.05/2,2,27≈q’0.05/2,2,24=2.35,在=0.05水准, 24小时切痂组和对照组的APT含量有显著性差别 ,96小时切痂组和对照组的APT含量无显著性差别。 方差分析