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HLA como un ejemplo de pruebas diagnòsticas en biologìa molecular. Presentado por: Dra. Irene A. Gómez Espinel. UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE NUEVO LEÓN DEPARTAMENTO DE PATOLOGÍA CLÍNICA. 2006. El ADN y su duplicaciòn. Componentes del ADN: Azúcar Bases Grupo fosfato. Azùcares.
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HLA como un ejemplo de pruebas diagnòsticas en biologìa molecular Presentado por: Dra. Irene A. Gómez Espinel UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE NUEVO LEÓN DEPARTAMENTO DE PATOLOGÍA CLÍNICA 2006
Componentes del ADN: Azúcar Bases Grupo fosfato
Tipificación • En el Laboratorio de Biología Molecular del departamento de patología clínica del HU. • A partir de ADN obtenido de sangre periférica. • La tipificación de los genes HLA (HLA-A, HLA-B, HLA-DR).
Comprobación cuantitativa de la presencia y pureza del ADN FORMULA: Ng/µl de ADN = (D.O 260 nm)(Factor de dilución)(50) Factor de dilución = volumen total de la celda (1005)/ volumen de muestra (5 µl) = 201 50 = factor para ADN de doble cadena 35 = factor para ADN de cadena sencilla 40 = factor para ARN
Reacciòn en Cadena de la Polimerasa (PCR) Técnica de laboratorio simple y rápida de amplificación del ADN que hace posible obtener múltiples copias y la identificación de secuencias específicas de ADN por medio de ciclos repetitivos utilizando el termociclador 1983
Historia de la PCR • 1983 Kary Mullis Inventa la PCR • 1985 Primera publicación científica • 1986 Cetus corparation y Perkin Elmer inician desarrollo de reactivos e instrumentos para PCR • 1988 Se publica el uso de la Taq para PCR (Saiki et al) • 1990-1993 Batalla de las compañías por los derechos de fabricación de reactivos. • 1993 Kary Mullis recibe el premio Nobel en Química.
Componentes de la PCR • DNA molde concentración de 25-200 ng/ml. • Iniciadores. (oligonucleotidos, primers, Cebadores). • dNTP´S. (dATP, dTTP, dGTP, dCTP) • DNA Polimerasa termoestable. (Taq, Tli, Pfu) • Reguladores (Mg+2) • Ciclos de temperatura (Termociclador)
Pasos de la PCR 1.- Desnaturalización del DNA (95 0C)
Pasos de la PCR 2.- Hibridación del Iniciador (50-70 0C)- Alineamiento
Pasos de la PCR 3.- Polimerización (72 0C)
Termocicladores MJ Research Dyad PTC-100 Opticon Tetrad
Tipos de PCR • PCR • PCR-RFLP • PCR in situ • RTPCR • PCR en tiempo real • PCR POR GRUPOS ALÉLICOS
IDENTIFICACIÒN DE ALELOS DE LOS GENES HLA-A y HLA-B EN POBLACIÒN DEL NORESTE DE MÈXICO
Sistema HLA Los Antígenos Leucocitarios Humanos – HLA: • Son moléculas que se encuentran en los leucocitos y en la superficie de casi todas las células de los tejidos de un individuo. • Reconocen lo propio y lo ajeno • Aseguran la inmunidad.
Sistema HLA • Transmitidas de padres a hijos • También denominado de Histocompatibilidad • Existen tres clases de antìgenos HLA I, II, III • Existen tres "lugares estratégicos": HLA-A, HLA-B y HLA-DR
Sistema HLA • El tipo de antígeno presente en A, B y DR es lo que determina la posibilidad de aceptación del tejido de un donante por el organismo de un receptor. • Para que dos personas sean compatibles, los antígenos presentes en cada uno de los tres lugares deben ser idénticos. • Análisis del ADN en sangre.
Genética • Los genes del Sistema HLA se heredan siempre en bloque. • Cada bloque se denomina haplotipo. • El padre aporta un haplotipo (=mitad del genotipo) y la madre otro, dando origen al genotipo, perfil genético propio o individualidad del nuevo ser.
Sistema HLA Padre Madre Haplotipo a Haplotipob Haplotipo c Haplotipo d Hijos Combinación 1 Combinación 2 Combinación 3 Combinación 4 Genotipo a-c Genotipo a-d Genotipo b-c Genotipo b-d Genética
Genética a b c bc ac ad bd d 25 % ac, 25% ad, 25% bc, 25% bd 25% de posibilidades de coincidir con un hermano
ELECTROFORÈSIS Es el movimiento de partículas eléctricamente cargadas, a través de un gas, líquido y en soportes sólidos o semisólidos (geles), como resultado de un campo eléctrico formado entre los electrodos sumergidos en el medio acuoso.
EXON 3 MPM EXON2 Corrimiento electroforético Carril de ejemplo Cátodo Apilado del gel Marco de plástico Corrimiento del gel Ánodo
Revelado de los geles • Pasos a seguir: 1.- Solución fijadora 10´ 2.- Colorante AgNO3 5´ 3.- Lavar de 2 a 3 veces con H2O. 4.- Solución reveladora. 5.- Solución fijadora
Estos se realizan observando el DNA teñido con bromuro de etidio en un gel de agarosa. Interpretación de resultados.
Enfermedades asociadas a genes HLA • Espondilitis anquilosante HLA-B27 • Síndrome de Reiter HLA-B27 • Enfermedad celìaca y hepatitis crónica activa HLA-B8 • Diabetes tipo 1 HLA-DR3 y DR4. • Artritis reumatoide con HLA-DR4. • Esclerosis múltiple HLA-DR2.
VENTAJAS ESTUDIO DE ADN 1. Se puede detectar una mayor información que con la serología 2. Los resultados pueden guardarse indefinidamente 3. Se pueden identificar todos los componentes del sistema HLA 4. más fiable en cuanto a la identificación de cada individuo. 5. Más exacto ya que se eliminan reacciones cruzadas 6. Rapidez en los resultados.
Puntos críticos en la técnica de PCR • Riesgo de contaminación: • ADN de la muestra • Moléculas de ADN previamente amplificadas • Alto costo de los reactivos y equipo • Espacio físico específico