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PubMed 入门使用

PubMed 入门使用. 内容纲要. 一、 PubMed 及相关数据库简介 二、 PubMed 数据范围 三、 PubMed 主页 四、 PubMed 检索方法以及检索结果的处理 五、 PubMed Central. PubMed 及相关数据库简介.

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PubMed 入门使用

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Presentation Transcript

  1. PubMed入门使用

  2. 内容纲要 • 一、PubMed及相关数据库简介 • 二、PubMed数据范围三、PubMed主页 • 四、PubMed检索方法以及检索结果的处理 • 五、PubMed Central

  3. PubMed及相关数据库简介 Pubmed是美国国家医学图书馆 (NLM) 所属的国家生物技术信息中心 (NCBI) 开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。该系统通过网络途径免费提供包括MEDLINE在内的自1950年以来全世界70多个国家4300多种主要生物医学文献的书目索引和摘要，并提供部分免费和付费全文链接服务。PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。 • ◦PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。 • ◦PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务，MEDLINE是一个拥有1亿字条以上的巨大数据库。 • ◦PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物 学数据，序列中心的数据等等。 • ◦PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。

  4. PubMed数据范围 • 数据类型：期刊论文、综述、以及与其他数据资源链接。 • 特点： • 免费提供题录和文摘 • 提供与原文的网址链接(部分免费获取） • 提供检索词自动转换匹配 • 操作简便、快捷

  5. PubMed数据范围 • MEDLINE • 4800余种生物医学期刊，内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科。这些期刊来源于美国和世界上70多个国家和地区。 • 文献量达1千2百多万条记录，并回溯到1966年。 • 记录中用[indexed for MEDLINE]标记表示

  6. PubMed主页

  7. PubMed 基本检索规则 • 在检索栏中输入: • 一个或多个检索词(系统默认空格为AND检索）如：placenta growth oxygen genbacev o • 著者姓名,姓在前,名首字母在后。 如: smith ab • 刊名输全称或MEDLINE认可的标准缩写形式 如：clin exp immunol • 布尔逻辑运算式： (运算符须大写） 如 ：Stem [ti] AND neuroscience

  8. 基本检索框 多个检索词输入 Moore AM撰写的有关接触性皮炎的文章

  9. PubMed 基本检索规则 • 截词检索：treat* • 强迫短语检索：“brca 1”（不再自动转换匹配和扩展检索）

  10. PubMed 基本检索规则 • 自动转换检索词 （automatic term mapping） • 自动对照规范词表,期刊名表，短语，著者名索引, 依次寻找转 • 短语寻找转换 • 单词转换 单词在上述四个字段寻找转换在所有字段中转换

  11. 如：输入stem[ti] AND neuroscience • Details显示： stem[ti] AND (("neurosciences"[TIAB] NOT Medline[SB]) OR "neurosciences"[MeSH Terms] OR neuroscience[Text Word])

  12. 自动扩展检索 • 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索，如：输入“hypertension therapy,系统自动将高血压的药物治疗、饮食疗法，

  13. Pubmed高级检索 • 1.在PubMed主页的搜索框旁点击”Advanced Search（高级选项）” • 2.输入作者名、杂志名等，选择其它的限定条件 • 3.点击search

  14. 著者检索 moore am[au]

  15. PubMed的辅助检索 • Limits（检索限制选择） • 字段限制：著者、刊名、篇名、滤过（filter原文收藏处）等 • 数据输入时间：默认检索可回溯到1950年，限制选择30天-10年 • 7种文献类型限制 • 7种语种限制 • 12种子文档：(01年新增2种Space Life Sciences and Bioethics ）

  16. 编制检索式 • 主题词型 • 哮喘的药物治疗（asthma, drug therapy） asthma/drug therapy • 手损伤的治疗（hand injuries, surgery, therapy） hand injuries/surgery OR hand injuries/therapy • 阿司匹林治疗心肌梗死（aspirin, therapeutic use, myocardial infarction, drug therapy） aspirin/therapeutic use AND myocardial infarction/drug therapy

  17. 编制检索式 • 混合型 • 检索舌根肿瘤的病理学(tongue neoplasms, pathology, tongue base, base of the tongue) tongue neoplasms/pathology AND (“tongue base” OR “base of the tongue”)

  18. 编制检索式 • 字段限制 查找闻玉梅教授的文献 Wen ym[au] 查找 Jhon Adorn Williams 撰写的文章 Williams JA[AU] 查找英语综述文献 english[la] AND review[pt]

  19. Previw/index（检索策略预览） • 浏览检索式 • 改变检索式 • （可用检索式编号#1 OR #2） • 浏览索引（index）

  20. Index（索引字顺表） • 选择限制字段 • 输入检索词（词根） • 在字顺表中选择检索词 • 选用逻辑算符建立检索式 • 点击GO

  21. History（检索史） • 检索式回顾 • 编辑检索式 • 如#3 AND child

  22. 检索式 检索历史

  23. Search details 数据库匹配过程

  24. PubMed搜索后的结果怎样看 • 搜索后的结果以summary format显示，默认情况下每页显示20条结果，最近提交的文章将优先显示的前面

  25. 五.检索结果输出 • 显示检索结果 • 保存检索结果 • 保存检索策略

  26. 显示字段选择（Display) • Abstract report:来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。 • Citation Report: 显示除上述内容外，加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。 • MEDLINE Report: (最完整，有标识符）

  27. 显示记录选择 • 单一记录：著者姓名 • 所有记录：选display旁的格式，及每页显示记录数 • 选定记录: 方框内打钩

  28. Pubmed中的免费全文 • PubMed上约有5％的文献是可以免费看到全文的，通常这些文献的左上角会有一个Free Full Text的小标记（ ）。你只要点击这个图标，系统就自动链接入该文献的全文。但有两点值得注意的是，第一，很多时候，这个图标在PubMed处于显示简要（summary)状态下并不出现，而只有在选择显示摘要（abstract)时才出现。因此，如果你不只是泛泛浏览，而希望看到全文的话，我强烈建议你在display下拉菜单中选择摘要（abstract)状态。第二，有些时候，小图标上仅标着Full Text，而并没有Free字样，但仍然可以链接入全文，不妨一试。

  29. 可获电子全文的链接

  30. 输出格式选择（send to） 选中题录（或文摘）后 • Text当前网页文本格式，用浏览器文件保存 • File所有记录纯文本格式保存，用对话框保存 • Clipboad 剪贴板，暂存需下载记录，多项检索后一起保存。 最多允许存储500条，保留8小时。 • Email: 通过邮件发送 • RSS Feed：检索结果的RSS订阅，通过安装网络聚合器可接收最新检索结果，不必再次检索。 • Other：全文传递服务等申请，需帐号、收费

  31. 保存检索策略 • Details 中的URL ，可以让检索匹配的详细策略放入检索框，该检索页面可以存储入浏览器收藏夹。 • My NCBI（Cubby）灰色栏中的功能按钮，存储在数据库的个人文档中。

  32. PMC (PubMed Central) • 生命科学期刊资源中心 • 免费提供130多种期刊的10多万篇全文 • （不包括PubMed动态免费全文）

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