110 likes | 534 Views
מוטציות מושרות Alkylating agents – מקבעים את הבסיסים הנורמלים במצב הנדיר שלהם, כך שנגרם זיווג שגוי של הבסיסים. למשל – EMS ( ethyl methanesulfonate ). אנלוגים לבסיסים - נכנסים ל- DNA ומחליפים את הבסיסים הנורמלים, וכך יוצרים קשרי מימן חלופיים הגורמים למוטציה.
E N D
מוטציות מושרות Alkylating agents– מקבעים את הבסיסים הנורמלים במצב הנדיר שלהם, כך שנגרם זיווג שגוי של הבסיסים. למשל – EMS (ethyl methanesulfonate). אנלוגים לבסיסים- נכנסים ל-DNA ומחליפים את הבסיסים הנורמלים, וכך יוצרים קשרי מימן חלופיים הגורמים למוטציה. דוגמה – BrU (5-bromouracil) – אנאלוג של טימין. במצב קטו שלו – מזווג עם A. במצב המיונן שלו מזווג עם G.
Intercatalating agents– חומרים בעלי 3 טבעות הנכנסים בין זוגות הבסיסים וגורמים למוטציות מסוג frame shift. קרינה מוטגנית: קרני X: גורמות לשברים ב-DNA. קצוות של DNA הם מאוד פעילים, ומסוגלים לתקוף גדילי DNA אחרים ולשבור אותם. קרני U.V.: יוצרות דימרים TT שיכולים לגרום למוטציות מסוגים שונים:
U A A U A A שאלה: מדוע אין זה אפשרי לגרום למוטציה nonsense (שגורמת להווצרות קודון-פסק במקום קודון לחומצה אמינית) ע"י טיפול במוטגנים שגורמים למוטציה מסוג A/T => G/C(Transition) ? A => G T => C קודוני- פסק הם: UAGUAAUGA U G A U A G תשובה: קודוני- פסק הם: UAG, UAA ו- UGA. מוטציות אפשריות לקבלת קודוני- פסק ע"י מוטגנים אלו הן :- UAA => UGA ו- UAA => UAG ומאחר ש-UAA היה מלכתחילה קודון-פסק, הרי שמוטציות אלו לא שינו דבר. (לעומת זאת, מוטגנים אלו יכולים להפוך קודון-פסק לקודון לחומצה אמינית. למשל UAA => CAA).
Sense (Gene) Anti-sense Anti- sense
5’ CTAGAAGATCTCGGGCAGCCCGCACTTGCCAATATCCGCGTAAGGCGACAAC 3’ GATCTTCTAGAGCCCGTCGGGCGTGAACGGTTATAGGCGCATTCCGCTGTTG CCTGCTGAATAATTCACCGA CAT ATATGCAGAGATAAGCGAACCCAGGCTT GGACGACTTATTAAGTGGCT GTA TATACGTCTCT ATT CGCTTGGGTCCGAA GGACTTTTGTGGATCAGAGCCAACCTGGTCAGTGTCTCCGAGCA 3’ CC TGAAAACACCTAGTCTCGGTTGGACCAGTCACAGAGGCTCGT 5’ לפניכם רצף דנ"א א. מצא את מסגרת הקריאה הארוכה ביותר המצויה ברצף זה ב.ציין מהו גדיל ה Sense ומהו גדיל ה Anti sense ג.כתוב את רצף הmRNA ואת רצף החלבון המתקבל STOP ATG - CAG - AGA - TAA Met - Gln - Arg - stop
5’ CTAGAAGATCTCGGGCAGCCCGCACTTGCCAATATCCGCGTAAGGCGACAAC 3’ GATCTTCTAGAGCCCGTCGGGCGTGAACGGTTATAGGCGCATTCCGCTGTTG CCTGCTGAATAATTCACCGA CAT ATATGCAGAGATAAGCGAACCCAGGCTT GGACGACTTATTAAGTGGCT GTA TATACGTCTCT ATT CGCTTGGGTCCGAA GGACTTTTGTGGATCAGAGCCAACCTGGTCAGTGTCTCCGAGCA 3’ CC TGAAAACACCTAGTCTCGGTTGGACCAGTCACAGAGGCTCGT 5’ STOP DNA-SENSE 5’ ATG-TCG-GTG-AAT-TAT-TCA-GCA-GGG-TTG-TCG-CCT-TAC-GCG-GAT-ATT- GGC-AAG-TGC-GGG-CTG-CCC-GAG-ATC-TTC-TAG 3’ mRNA 5’ AUG-UCG-GUG-AAU-UAU-UCA-GCA-GGG-UUG-UCG-CCU-UAC-GCG-GAU- AUU- GGC-AAG-UGC-GGG-CUG-CCC-GAG-AUC-UUC-UAG 3’
mRNA 5’ AUG-UCG-GUG-AAU-UAU-UCA-GCA-GGG-UUG-UCG-CCU-UAC-GCG-GAU- AUU- GGC-AAG-UGC-GGG-CUG-CCC-GAG-AUC-UUC-UAG 3’ PROTEIN - MSVNYSAGLSPYADKGKCGLPEIF N- C
5’ CTAGAAGATCTCGGGCAGCCCGCACTTGCCAATATCCGCGTAAGGCGACAAC 3’ GATCTTCTAGAGCCCGTCGGGCGTGAACGGTTATAGGCGCATTCCGCTGTTG CCTGCTGAATAATTCACCGA CAT ATATGCAGAGATAAGCGAACCCAGGCTT GGACGACTTATTAAGTGGCT GTA TATACGTCTCT ATT CGCTTGGGTCCGAA GGACTTTTGTGGATCAGAGCCAACCTGGTCAGTGTCTCCGAGCA 3’ CC TGAAAACACCTAGTCTCGGTTGGACCAGTCACAGAGGCTCGT 5’ A מה יקרה לחלבון בעקבות המוטציה הבאה: א.נוקלאוטידים AוT המסומנים יהפכו ל Tו A בהתאם? יווצר ה STOP CODONTAA:
חוקי Wobble– טבלת חוקי Wobble: משמעות: הקוד הגנטי, וגם חוקי Wobble, מותאמים אבולוציונית למוטציות transition, שהן המוטציות היותר נפוצות!
שאלה: איזה אנטיקודון ניתן להציע עבור tRNA הנושא איזו-לאוצין? האם יש מספר אפשרויות? UAG UAI UAA UAG UAI UAU UAI אנטי- קודונים GCAUI U or C G U A or G U,C or A AUU AUA AUC קודונים תשובה: הקודונים של איזולאוצין הם – AUU, AUC ו-AUA. אנטיקודונים: UAA– מתאים ל-AUU בלבד. UAG– מתאים ל-AUU ו-AUC. UAI – מתאים לשלושתם!ל- AUU, AUC ו-AUA UAU – מתאים ל-AUA אבל גם ל-AUG שהוא קודון למתיונין, כך שהוא עלול להכניס איזולאוצין במקום מתיונין. (ואכן – אנטי קודון זה הוא יחסית נדיר בהרבה אורגניזמים)