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電子病歷相關編碼說明. 99 年度電子病歷標準維護暨推廣案 教育訓練系列課程 A 電子病歷編碼技術. 本投影片參考來源:行政院衛生署 97 及 98 年度電子病歷推動案之專案成果. 大綱. OID 概念 LOINC 編碼 CDA R2 文件類型說明 SNOMED CT 編碼. OID 概念. 物件識別碼 (OBJECT IDENTIFIER). 主要是用來做為資訊物件的唯一識別符號,讓資訊在 Internet 上傳遞更為方便與安全,目前許多技術規格都定義必須使用 OID (如: X509(v3) … 等)。
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電子病歷相關編碼說明 99年度電子病歷標準維護暨推廣案 教育訓練系列課程 A 電子病歷編碼技術 本投影片參考來源:行政院衛生署97及98年度電子病歷推動案之專案成果
大綱 • OID概念 • LOINC編碼 • CDA R2文件類型說明 • SNOMEDCT編碼
物件識別碼(OBJECT IDENTIFIER) • 主要是用來做為資訊物件的唯一識別符號,讓資訊在Internet上傳遞更為方便與安全,目前許多技術規格都定義必須使用OID(如:X509(v3) …等)。 • 電子化政府的長遠發展:物件OID化以統一識別及管理 • 在舊GCA所簽發憑證中的政府機關代碼,在新GCA所簽發憑證已改成為政府機關OID。 • 政府機關OID放在新憑證的用戶目錄屬性延伸欄位中,電子簽章所使用公鑰憑證格式中加解密演算法,擴充欄位皆需一組OID來識別。
重要網站 1. http://asn1.elibel.tm.fr:ASN.1(Abstract Syntax Notation One)網站。 2. http://www.oid-info.com/:OID註冊網站,可以查得所有OID註冊使用情形。有興趣者,可以去查-->1.2.886之結果。 3. http://www.alvestrand.no/objectid:簡單說明何謂OID。 4. OID說明:OID簡介投影片。 5. http://www.hl7.org/oid/index.cfm:HL7總會的OID註冊查詢系統。 6. http://oid.nat.gov.tw/OIDWeb/chmain.html:我國OID查詢網站。 7.http://xca.nat.gov.tw/index.htm: OID申請網站。
HL7之使用情形 • HL7標準中有使用到,尤其是在v3中更列為資料型態的一種。 • 2.14 ISO Object Identifier (OID) specializes UID • HL7總會的OID為:2.16.840.1.113883 • HL7總會亦提供給國際會員國登錄申請。目前有申請的國家有: • HL7 UK 2.16.840.1.113883.2.1 • HL7 Australia 2.16.840.1.113883.2.3 • HL7 Netherlands 2.16.840.1.113883.2.4 • HL7 Switzerland 2.16.840.1.113883.2.5 • HL7 Germany 2.16.840.1.113883.2.6 • HL7 France 2.16.840.1.113883.2.8 • HL7 Argentina 2.16.840.1.113883.2.10
HL7 之OID TREE 2.16.840.1.113883
HL7查詢網頁 可下載OID資料
WWW.LOINC.ORG 最新版本:2.29 下載須要帳號密碼 可免費申請
LOINC套件內含物 ACCESS 格式 文字檔格式 RELMA安裝程式 (對應工具後續介紹) 使用手冊需另行下載
使用手冊下載 注意:簡體版是舊版本
LOINC簡單說明 • Logical Observation Identifiers Names and Code • 在不同標準間(ASTM E1238, HL7, CEN TC251, DICOM)提供一致性的檢驗項目編碼表達方式。 • 屬HL7所維護的標準。 • CAP(College of American Pathologists)已贊同 (has endorsed) LOINC編碼。 • 已註冊在UMLS(Unified Medical Language System) • HIPAA也已註冊。 • 最新版本2.29,共計有57,475 項。
LOINC所涵蓋專業範圍 • 化學(Chemistry) • 治療藥物監測(Therapeutic Drug Monitoring) • 毒理學(Toxicology) • 血液學(Hematology) • 血清學(Serology) • 血庫(Blood Bank) • 微生物學(Microbiology) • 細胞學(Cytology) • 手術病理學(Surgical Pathology) • 生殖醫學(Fertility) • 獸醫學(Veterinary Medicine)
LOINC所涵蓋臨床應用 • 血壓(Blood Pressure) • 心率(Heart Rates) • 呼吸頻率(Respiratory Rates) • 危重護理指標(Critical Care Measures) • 心輸出量(Cardiac Output) • 體型尺寸(Body Dimensions) • 體溫(Body Temperature) • 攝入(Intake)與排出(Output) • 心電圖(Electrocardiography) • 心臟迴授(Cardiac Echo) • 產科超音波(Obstetric Ultrasound) • 泌尿系統超音波(Urologic Ultrasound) • 胃腸道內視鏡(Gastrointestinal Endoscopy) • 呼吸機管理(Ventilator Management) • 牙科(Dental) • DEEDS急診科報告(DEEDS Emergency Department Reporting) • 放射診斷報告(Radiology Study Reporting) • 申報附件(claims attachment) • 主標題(Major Headings), • 病史(History) • 體格檢查(Physical) • 出院小結(Discharge Summary) • 手術記錄報告(Operative Note Reports) • 腫瘤登記指標(Tumor Registry Variables) • 臨床產科學(Clinical Obstetrics) • 護理觀測指標(Nursing Observations)
LOINC不適用範圍 • 檢測時所使用的儀器設備定義。 • 樣本或採樣部分的具體描述。 • 檢測的優先順序。(急診或常規) • 檢驗結果的審核者。 • 樣本的採集量。 • 採檢或檢驗的地點。 LOINC無法表達者,是放在HL7訊息中 注意:LOINC只有碼,沒有值。
LOINC文法結構 • LOINC的名稱是由六大軸度(或稱為組合、欄位)所形成。 <Analyte/component>: 血糖 <kind of property of observation or measurement>:濃度 <time aspect>: 飯後2小時 <system (sample)>: 血液 <scale>: 定量 <method>: 試紙 <分析物/成分>: (主名稱) <觀測指標或測量指標的屬性類型>: (提供量化屬性) <時間特徵>: (提供時間性資訊) <體系(樣本)>: (提供檢體來源定義) <尺規>: (提供資料之型態與格式定義) <方法> (取得此檢驗值所使用的工具與方法)
六軸編碼簡單說明 • 成分(Component;或分析物、受檢物,Analyte):如鉀(Potassium)、血紅蛋白(Hemoglobin)、C型肝炎抗原(Hepatitis C Antigen)。 • 受檢屬性(Property Measured):如品質濃度(Mass Concentration)、酶活性(Enzyme Activity);(催化速率,Catalytic Rate)。 • 時間特徵(Timing):也就是說,一個檢測指標(Measurement)是片刻或短時間的觀測結果,還是在更長時間段內進行綜合所獲得的觀測結果,如24小時尿液標本(24-hour Urine)。 • 樣本類型(Type of Sample):如尿液(Urine)、全血(Blood)。 • 尺規類型(Type of Scale):即一個檢測指標(Measurement)是定量型(Quantitative)、排序型(Ordinal;一套具有秩次的結果選項)、標題型(Nominal,如E. coli和Staphylococcus aureus),還是敘述型(Narrative,如X射線檢查的口述結果)等。 • 方法(Method):是指在獲得試驗結果或其他觀測結果時所採用的方法(適用情況下方使用的欄位,可選)。
第1軸:<ANALYTE/COMPONENT> • 主要標的物名稱。 • 可由三個子軸組合起來,分別為 • (1)主名(principal name)、 • (2)刺激或激發(challenge or provocation)、 • (3)其他標準化或調校(standardization or adjustment)。 • 文法結構 <[analyte].[subclass].[sub-subclass]> ^ <[time delay] post [amount] [substance] [route])> ^ <adjustment>
第1主軸的第1子軸 • <[analyte].[subclass].[sub-subclass]> • [analyte]:檢驗對象主名稱。 • [subclass]:子軸。若主名稱仍可進行分類時。 • [sub-subclass]:次子軸。更細的分類。 • 範例: • Calcium(鈣)本身即可成為主對象。 • Calcium.ionized(鈣離子)就成了另一個檢驗主對象。 • 常見子軸 • 結合型、游離型與生物可利用(bound, free, and bioavailable) • 離子型與非離子型(ionized and non-ionized) • 糖化(Glycated) • 糖醛酸化與非糖醛酸化(glucuronidated and non-glucuronidated ) • 抗體亞種修飾語: IgA、IgD、IgE、IgG和IgM。
第1主軸的第2子軸 • <[time delay] post [amount] [substance] [route])> • [time delay]:延後時間。可查手冊表4。 • [amount]:使用量。 • [substance]:藥物。 • [route]:途徑。(使用HL7 table 0162:Route of administration) • 範例 Aldosterone^1H post 25 mg captopril PO 口服25mg卡托普利1小時後的醛固酮
第1主軸的第3子軸 • <adjustment> • 調整或校正某一測定值的計算方法 • 範例 • pH調整至7.4的條件下,對患者血清或血漿標本中離子鈣的定量檢測 • Calcium.ionized^^adjusted to pH 7.4:SCnc:PT:Ser/Plas:Qn 其實有第四子軸,但只用於HL7訊息批次交換時,作為序號之用。
第2軸:<KIND OF PROPERTY OF OBSERVATION OR MEASUREMENT> • 對主名進行屬性規範(量化比較多)。 • 主要屬性類別: • 質量(Mass):質量單位Milligrams, Grams。 • 物質(Substance):濃度單位莫爾或毫當量。 • 催化活性(Catalytic activity ):催化劑濃度。 • 任意(Arbitrary):任意測量單位(非上述者) • 數量(Number):計數型資料。 • 內容很多,需參考LOINC Table 8 : Example LOINC properties。
第3軸:<TIME ASPECT> • 說明測定此檢驗項目可能發生的時間點(Point)或時距(Time Interval)。 • 經由時間所衍生的平均速率(排泄率、清除率)。 • 經由時距衍生了取樣間隔(分晝/夜尿量)。 • (注意,有些需與第2軸一致,如Moles Per Day (Hours)。 • 持續性時間的表達,應參考LOINC Table 9: Example Duration Categories。 • 常用者: • PT: at a Point in Time. 隨機的某時點。 • Stdy: Duration of the study.檢查期間。 • Enctr:Duration of an encounter (hospital stay, visit). 就診期間。 • 可有第2子軸(Time Aspect Modifier),修飾前第1子軸。參考LOINC Table 10: Time Aspect Modifier Codes
範例 8H^max heart rate 8小时最大心率
第4軸:<SYSTEM (SAMPLE)> • 體系或樣本類型描述。又可分兩個子軸。 • 第一子軸:主要命名 • 體系大分類 • 血液(Blood)、尿液(Urine)、腦脊液(Cerebrospinal Fluid,CSF)、胸水(Pleural Fluid)、滑膜液(Synovial Fluid)、腹膜水(Peritoneal Fluid) • 詳細體系與樣本代碼,參考Table 11: Example Laboratory System/Sample Types 。若此檢驗項目含多個體系,則可用”+”連接。 • 第二子軸:超體系(Super System) • 一般體系或樣本都是來自預設的^Patient。假若不是則需進一步說明。如胚胎(fetus)、捐贈者(donor)、血品(BPU)、母親(mother)等。
第4軸:<SYSTEM (SAMPLE)> • 範例: A Ag:ACnc:Pt:RBC:Ord 與 A Ag:ACnc:Pt:RBC^BPU:Ord 分別取得病患與捐贈者的紅血球A型抗原。 A Ag:A型抗原 ACnc:任意濃度 Pt:某時點 RBC:紅血球^(病患) RBC^BPU:紅血球^捐贈者
第5軸:<SCALE> • 此為必要軸,用以說明此檢驗項的尺度(類似資料型態的概念) 數量形式 排序形式 前面兩種 標題形式 敘述形式 備忘形式 文檔形式
第6軸:<METHOD> • 相同成分(分析物)若使用不同檢測方法時,由此軸來區別。為可選軸。 • 檢測方法相當複雜,大分類: • DNA/RNA probes/measures (探針/量測) • 要參考表14A與14B • Immunofluorescence (免疫螢光) • Immune Stain (免疫染色) • Enzyme Immunoassay (酶免疫測定) • Coagulation (凝血測試) • Stains (染色測試) • Clinical measures (臨床評估) • Imaging studies (影像檢查)
LOINC資料庫欄位說明 附錄A說明資料庫欄位結構 其他欄位皆是管理用途
背景說明 • CDAR2的文件類型(Document Type)是採用LOINC編碼。 • 詳細內容,請參照LOINC 文件第7章(HL7 LOINC Document Type Vocabulary Domain)
CDAR2文件命名原則 • 原則 • 一定要有臨床文件類別(Note) • 再配合其他四軸(Axis)中的一個或以上。 <Subject Matter Domain> : <Training / Professional Level>: <Setting>: <Type> : Note 引用名稱 LOINC 中查表
KIND OF DOCUMENT • Note : 一般性的病摘 (also known as “Clinical Document”) • Administrative note • Against medical advice note • Agreement • Certificate • Consent • Contract • Advance directive • Diagram • Flow sheet • Legal • Letter • Note: 特殊性 • Adverse event note • Alert • Report
TYPE OF SERVICE (部分) • 溝通與交流(Communication) • 評估與管理(Evaluation and management) • 討論會(Conference) • 病例討論會(Case conference) • 會診(Consult) • 確證性會診(Confirmatory consultation) • 諮詢(Counseling) • 小組諮詢(Group counseling) • 教育(Education) • 病史與體格檢查(History & Physical,H & P) • 入院病史與體格檢查(Admission history and physical,Admission H & P) • 全面病史與體格檢查(Comprehensive history and physical,Comprehensive H & P) • 針對性的病史與體格檢查(Targeted history and physical (Targeted H & P) • 初步評估(Initial evaluation) • 入院評估(Admission evaluation) • 入院病史與體格檢查(Admission history and physical,Admission H & P) • 術前評估與管理(Pre-operative evaluation and management) • 後續評估(Subsequent evaluation) • 事件摘要(Summarization of episode) • 轉院摘要(Transfer summarization) • 出院摘要(Discharge summarization) • 死亡摘要(Summary of death) • 轉診介紹(Transfer of care referral) • 監督指導(Supervisory direction) • 電話接診(Telephone encounter) • 干預操作(Interventional Procedure) • 手術性(Operative) • 病理學操作(Pathology Procedure) • 屍體剖驗(Autopsy)
SETTING (部分) • 家庭(Home) • 非自理生活(Assisted Living) • 家庭衛生保健(Home Health Care) • 醫院(住院)環境(Hospital (Inpatient) Setting) • 緊急救護型醫院(Acute care hospital) • 醫院單元(Hospital Unit) • 危重護理單元(Critical Care Unit) • 急診科(Emergency Department) • 觀察病房(Observation Ward) • 康復治療型醫院(Rehabilitation hospital) • 療養院(Nursing Home) • 高級護理設施(Skilled Nursing Facility) • 門診(辦公室/診室)(Outpatient (Office / Clinic))
SUBJECT MATTER DOMAIN(部分) 麻醉(Anesthesia) 病例管理者(Case Manager) 心臟病學(Cardiology) 牧師(Chaplain) 牙科學(Dentistry) 糖尿病學(Diabetology) 內分泌學(Endocrinology) 腸胃病學(Gastroenterology) 普通內科學(General Medicine) 普通外科學(General Surgery) 婦科學(Gynecology) 多樣學科(Multidisciplinary) 神經外科學(Neurosurgery) 產科學(Obstetrics) 腫瘤學(Oncology) 眼科學[Ophthalmology (EYE)] 視力測定/驗光(Optometry) 矯形外科學(Orthopedics) 耳鼻喉科學[Otorhinolaryngology (ENT)] 病理學(Pathology) 藥劑學(Pharmacy) 物理治療學(Physical Medicine) 整形外科學(Plastic Surgery) 足病學(Podiatry) 精神病學(Psychiatry) 肺部疾病(Pulmonary) 甲狀腺病學(Thyroidology) 腫瘤委員會(Tumor Board) 泌尿科學(Urology) 獸醫學(Veterinary Medicine)
ROLE (部分) 主治醫師(Attending) 病例管理者(Case Manager) 牧師(Chaplain) 牙科衛生學家(Dental Hygienist) 牙科醫師(Dentist) 學者/研究員(Fellow) 實習醫師(Intern) 醫科學生(Medical Student) 護士(Nurse) 正式護士(Nurse Practitioner) 護理學生(Nursing Student) 職業治療師(Occupational Therapist) 藥劑師(Pharmacist) 醫師(Physician ) 助理醫師(Physician Assistant) 物理治療師(Physical Therapist) 住院醫師(Resident) 呼吸治療師(Respiratory Therapist) 社會工作者(Social Worker) 下級實習醫師(Sub-intern) 獸醫(Veterinarian)
文件名稱範例 • Cardiology note(心臟病學記錄) • Cardiology attending note(心臟病學主治醫師記錄) • Cardiology attending hospital admission note(心臟病學主治醫師醫院入院記錄) • Cardiology nurse hospital admission note(心臟病學護士醫院入院記錄) • Cardiology fellow admission note(心臟病學者入院記錄) • Pulmonary note(肺部記錄) • Consult note(會診記錄) • Nurse note(護理記錄) • Hospital admission H&P note(醫院入院病史與體格檢查記錄) **中文部分僅供參考
SNOMED CT簡介 • 主要是透過Concept、Description與Relationship三個重要元素建構Term之描述。 • concept:(概念) • 具有臨床上意義者,有唯一辨識碼(ConceptID)。 • 文字表現上是以人可閱讀之描述,此名稱特殊定義為Fully Specified Name(FSN) • 每個concept會與其他的concept有關連。 • Concept Granularity: (概念尺度):如右圖