Biogenouest

1. Biogenouest Avril 2014

2. Qu’est-ce que Biogenouest ? • Le réseau des plates-formes du Grand Ouest en sciences du vivant et de l’environnement • Réseau interrégional : Bretagne et Pays de la Loire Directeur: Christian Diot (Inra) Avec le soutien de :

3. Missions et objectifs • Mutualiser les ressourceset les compétences • Participer de manière collective à l’évolutiontechnologique • Soutenir la recherche en sciences du vivant et la création de nouvelles entreprises de biotechnologie • Participer à des programmes de recherche européens • Attirer des chercheurs

4. Petit historique… Création du Réseau National des Génopoles (RNG) via un appel d'offres dans le cadre du programme national "Génomique" : instituts régionaux 'sans murs' qui développent et gèrent des plates-formes technologiques associées à des projets à grande échelle. Ils intègrent un ou des programmes de formation en génomique, un fort pôle de bio-informatique et les structures de valorisation adéquates Labellisation par le Ministère de la recherche de OUEST-genopole® Signature de la convention du Groupement d’intérêt scientifique (GIS) OUEST-genopole® 2008 2009 2010 1999 2002 2007 2012 Dissolution du RNG qui fédérait les 8 génopoles françaises Création du GIS IBiSA "Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie", instance de coordination des plates-formes de recherche en sciences du vivant OUEST-genopole® devient la structure de relais du GIS IBiSA en régions pour la Bretagne et les Pays de la Loire OUEST-genopole® ouvre son dispositif aux plates-formes en Sciences du vivant et ne se restreint plus à la génomique et la post-génomique, et devient Biogenouest Biogenouest s’engage sur les questions liées à l’environnement Biogenouest fête ses 10 ans

5. Organisation juridique • Groupement d‘intérêt scientifique (GIS) créé en novembre 2002 par 11 membres fondateurs et des organismes associés • Anses • CNRS • Ifremer • Inra • Inria • Inserm • Université d'Angers • Université de Bretagne Occidentale • Université de Bretagne Sud • Université de Nantes • Université de Rennes 1 • Agrocampus Ouest • Irstea • CHU d’Angers, Brest, Nantes et Rennes • Ecole nationale supérieure Cachan Bretagne • Ecole nationale supérieure de chimie de Rennes (ENSCR) • Telecom Bretagne • Oniris • Groupe d'étude et de contrôle des variétéset des semences (Snes/Geves) • Université Pierre et Marie Curie (Paris VI)

6. Instances de Biogenouest Conseil de groupement Définit la stratégie, veille à la cohérence des actions mises en œuvre et approuve le programme des activités de Biogenouest. Instance d'évaluation et de conseil Comité d’experts extérieurs Comité directeur Assure la mise en oeuvre des décisions, le suivi permanent de l’activité du GIS et de ses différentes instances, etc. Comité des axes technologiques Cellule d'animationAnime et coordonne les activités de Biogenouest Commission valorisation Commission formation Conseil scientifique Propose la politique scientifique, les orientations à long terme et leur évolution, la déclinaison des moyens nécessaires à la mise en œuvre de ces orientations, etc.

7. Budget de Biogenouest • Fort soutien des 2 Régions depuis 2001 : env. 1 M€ / an / Région • Un soutien de l’Etat via IBiSA

8. Budget de Biogenouest 94% du budget à destination des plates-formes (Organismes et Universités) 6% pour le fonctionnement de Biogenouest(Postes communication et qualité, budget animation) • Budget global 2013 : 2 954 000 € (Régions Bretagne & Pays de la Loire, IBiSA)

9. Le réseau Biogenouest 4thématiques et près de 70 unités de recherche

10. Unités membres de Biogenouest • 68 unités de recherche en Sciences du vivant en Bretagne et Pays de la Loire • Accès privilégié au réseau des plates-formes technologiques • Destinataires des informations diffusées au sein du réseau • Visibilité grâce à l’annuaire en ligne sur www.biogenouest.org

11. Le réseau Biogenouest 6axes technologiques et 29plates-formes 20plates-formes labellisées IBiSA 14plates-formes certifiées ISO 9001

12. Plates-formes technologiques Définition par Biogenouest • Une plate-forme est le regroupement sur un ou plusieurs sites des équipements et des moyens humains destinés à offrir à une communauté d’utilisateurs des ressources technologiques de haut niveau. La plate-forme s’engage à une ouverture large a minima au niveau inter-régional, non seulement aux équipes du site, mais aussi aux expérimentateurs extérieurs, quel que soit leur rattachement (organismes publics, entreprises…). • Critères essentiels : • Ouverture • Originalité et innovation (développement technologique) • Formation

13. Offres des plates-formes • Acquisition d'équipements collectifs de haute technologie • Recrutement de personnels hautement qualifiés : ingénieurs spécialisés dans plusieurs domaines des biotechnologies • Développement de compétences spécifiques (veille technologique, R&D…) • Organisation de journées d’animation et de formationsdestinées aux chercheurs (mini-colloques, rencontres, sessions technologiques…) • Ouverture au monde industriel : partenariats commerciaux, collaborations scientifiques, prestations de services… Règles pour une utilisation optimale : • Accessibilité garantie pour les unitésmembres de Biogenouest : min. 50% • Comité scientifique • Management de la qualité • Gestion de l'information (site web)…

14. Le réseau des plates-formes Génomique • Biogenouest Génomique- Nantes, Rennes & Roscoff Protéomique • Plate-forme Protéomique - Rennes • Impact- Nantes Exploration fonctionnelle Vectorisation virale et non virale • Production de vecteurs viraux- Nantes • SynNanoVect- Rennes & Brest Transgenèse et modèles animaux • Transgenèse Xénope- Rennes • TRIP- Nantes • LGA– Nantes Criblage et analyses fonctionnelles • Cardiex- Nantes • ImPACcell - Rennes • Biodimar - Brest • KISSf - Roscoff • CHEM-Symbiose - Nantes Bio-informatique • IFB Grand Ouest : GenOuest, BiRD et ABiMS Nantes, Rennes& Roscoff Bio-imagerie • MRic- Rennes • PRISM - Rennes • H2P2- Rennes • MicroPICell- Nantes • Cyclotron Arronax - Nantes • Neurinfo - Rennes • Cytogénétique moléculaire- Le Rheu • APEX - Nantes Analyse structurale et Métabolomique • BiBS- Nantes • Corsaire Angers, Brest, Nantes, Rennes& Roscoff

15. Management de la qualité • 14 plates-formes Biogenouest sont certifiées ISO 9001 • Biogenouest affirme une volonté d’excellence, de transparence et d’innovation vis-à-vis de la société et de l’ensemble de ses partenaires publics ou privés. • Sur 20 plates-formes Biogenouest labellisées IBiSA, 14 sont certifiées ISO 9001 soit 70% (contre 35% au niveau national) Mars 2014 14 plates-formes certifiées Novembre 2006 1èreplate-forme certifiée

16. Management de la qualité • Les missions de l’ingénieur Qualité de Biogenouest :

17. Animation scientifique • Projets fédérateurs : soutien de thèmes unificateurs et d’approches transdisciplinaires autour des plates-formes technologiques • Vectorisation non virale (2006 – 2008) • Génome, adaptation et environnement : effets d’un stress sur une large échelle évolutive (de la bactérie à l’homme) (2006 – 2008) • Biologie intégrative (2009 – 2011) • e-Biogenouest (2012 – 2014) : Olivier Collin et Yvan Le Bras Une initiative e-science de la communauté Biogenouest pour favoriser le développement de projets exploitant les nouvelles technologies de l'information et de la communication (calcul à haute performance, cloud, gestion et exploitation des données…). • Journées technologiques par les plates-formes • Conférences scientifiques (8 par an) • Gen2Bio, le congrès annuel Biotech organisé par Biogenouest

18. Gen2Bio • Le rendez-vous annuel des chercheurs de l’Ouest et des entreprises biotech, pour : • Présenter les avancées scientifiques des travaux menés au sein de Biogenouest et les perspectives pour l'avenir • Accélérer les projets de développement en découvrant l’offre de services des laboratoires et plates-formes technologiques • Faire connaissance avec les entreprises innovantes du secteur • Elargir son offre en rencontrant ses futurs partenaires • Découvrir de nouveaux prospects, initier des alliances et des contacts privilégiés Gen2Bio 2015 le 26 mars à La Baule !

19. Valorisation • Favoriser le développement des biotechnologies à partir deslaboratoires de recherche et des plates-formes, en s’appuyantsur les structures existantes • Mutualiserles pratiques • Développer les projets de valorisation à l’aide d’un ensemble de services et moyens en réseau • Professionnaliser les plates-formes et en faciliter l’accès aux entreprises

20. Valorisation • Quelques exemple de partenariats industriels sur 2012 : • Affilogic, Amaxa, Artimmun, Atlab pharma, Atlantic BoneScreen, Berthold Technologies, Biofortis, BiogenIdec, Biopredic International , Bioprojet-Biotech, Biotrial , Bristol Myers-Squibb, C.Ris Pharma, Cameca, Cargill, Cerfac, Cisbio , Clean Cells, Codif , Cytoo, Diana Food, Effimune , Eli Lilly, Epsilon Chimie, ERI europe, genOway , Goémar, Guerbet, Hemarina (Roscoff), HTL Biotechnologies, In-Cell-Art, InVivo Nutrition et santé animale, Kelia , Lafarge, Les fromageries Bel, ManRosTherapeutics, MaunaKea technologies, Neovax, Neurokin , Noscira, Novartis, Nutrinov, OMT, Pasquier, Pellenc, Photonlines, Roche, Sanofi-Aventis, Sojasun, Sorin groupe, StebaBiotech S.A., Straticell, TCL pharma, Timac Agro international, Unilever, Vectalys, Végénov, Venometech, Xenoblis …

21. Formation • Fondateur et soutien depuis 2004 à l’Ecole de l’ADN des Pays de la Loire • Plus de 2500 stagiaires / an • Une centaine de professionnels / an (agents des EPST, associations de malades, enseignants de l’éducation nationale, commerciaux des équipementiers …) • Une offre de formation à l’année par les plates-formes • A destination des doctorants (écoles doctorales) • A destination de la communauté académique et des industriels • Organisée et proposée directement par les plates-formes • Proposée par les services de formation continue des universités

22. Formation • Chaque plate-forme propose des formations à ses utilisateurs :

23. Formation • 5 formations doctorales sont proposées en 2014 : • Formation bio-informatique • Formation à l’étude des interactions moléculaires • Formation en analyse de la structure des biopolymères aux différentes échelles • Formation à la microscopie  Formation au fonctionnement de la plate-forme TransgenèseRat (TRIP Nantes)

24. Communication • Communication interne • Fédérer les unités de recherche autour d’un réseau commun • Amener les équipes de recherche à mieux se connaître • Accompagner les plates-formes dans leurs actions en lien avec Biogenouest • Communication externe • Accroître la visibilité et la lisibilité de Biogenouest à l’extérieur • Faire connaître les activités et programmes de recherche de Biogenouest • Faire rayonner les biotechs du Grand Ouest

25. Outils de communicationRetrouvez-les sur www.biogenouest.org Livrets des plates-formes(Recherche et Entreprises) Annuaire en lignedes unités Biogenouest Plaquette Biogenouest Rapport d’activités 2012 Carte interactive des plates-formes Mais aussi : Agenda et actu, newsletter, communiqués de presse, conférences…

26. Plus d'infos sur… www.biogenouest.org

27. Les clés du succès de Biogenouest • Une volonté de partager et de concourir à l’excellence scientifique • Un besoin de mutualiser les outils technologiques pour mieux répondre aux problématiques de recherche • Des plates-formes multi-sites et multi-activités • Des thématiques axées sur des secteurs économiques locaux forts : Mer - Agro - Santé • Un soutien fort des Régions • Une bonne coordination inter-régionale et une équipe d’animation opérationnelle

28. Equipe d’animation Christian Diot - Directeur • Véronique Blin - Ingénieur Qualité • Démarche qualité et certification • 02 23 48 54 07 - veronique.blin@biogenouest.org • Roxanne Amelot – Chargée de communication • Communication interne et externe • 02 23 48 54 07 - roxanne.amelot@biogenouest.org • Jocelyne Le Seyec - Chargée de mission • Animation des plates-formes et animation scientifique • 02 23 23 45 81 - jocelyne.leseyec@biogenouest.org • Eric Mathieu - Chargé de mission • Animation des volets Valorisation et Formation • 02 41 72 86 17 - eric.mathieu@biogenouest.org • Marilène Vallois - Secrétaire de direction • 02 23 48 50 51 - direction@biogenouest.org

29. Merci de votre attention !

30. ANNEXES Titre présentation | Nom de la réunion | Lieu, date

31. Plate-forme Biogenouest Génomique Biogenouest Génomique met à la disposition de la communauté scientifique les outils nécessaires pour mener à bien des projets de génomique structurale et/ou fonctionnelle dans les domaines de la mer, de l’agronomie, de l’environnement et de la santé. Elle fonctionne en étroite collaboration avec les plates-formes de bio-informatique de l’IFB Grand Ouest pour le traitement, l’analyse et le stockage des données. Genomer Génomique Santé Génomique environnementale et fonctionnelle Génomique Nantes EXPERTISE SCIENTIFIQUE Séquençage (classique et massif) ; Génotypage (classique et ultra haut débit) ; Analyses d'expression (par puce ou par séquençage massif) ; Analyses de méthylation ; Analyses CNA; Analyse de données (préliminaires ou expertes) pour ces différentes applications. Responsable : Philippe VANDENKOORNHUYSE

32. Plate-forme Protéomique • La plate-forme protéomiqueoffre un ensemble de technologies de pointe dédiées à l’analyse des protéomes, depuis l´identification de protéines jusqu'à la prise en charge complète de programmes protéomiques de grande ampleur. • EXPERTISE SCIENTIFIQUE • La plate-forme travaille sur tous les systèmes biologiques. Elle propose de répondre à vos questions biologiques grâce à la maîtrise d’un panel complémentaire de technologies et de savoir-faire spécifiques : • Préparation d'échantillons biologiques • Préfractionnement sur gel ou chromatographique • Electrophorèse 1D/2D • Protéomique Shotgun, Top-down, middle-down • Analyses différentielles (DIGE, ICPL) • Analyses de modifications post-traductionnelles • Imagerie MALDI Plate-forme Protéomique Responsable : Charles PINEAU

33. Plate-forme « Impact » La plate-forme IMPACT offre un ensemble de technologies de pointe dédiées à l'étude globale des interactions moléculaires depuis le criblage à haut débit jusqu'à leur caractérisation et l'analyse structure-fonction par un ensemble d'approches biophysiques. Plate-forme Impact • EXPERTISE SCIENTIFIQUE • Profiling: Etude du profil d’expression de protéines - Analyse de la modulation des modifications post-traductionnelles de protéines : phosphorylation, ubiquitination, SUMOylation glycosylation... Technologies associées : Puces à protéines, SPR Imaging, Alpha surefire. • Criblage: Criblage modèle dédié à l’étude de la fonctionnalité de récepteurs membranaires - Criblages de chimiothèques sur la base de modèles. Technologies associées : SPR, BRET FRET, Label free, Alpha screen. • Caractérisation - Validation : Validation de l’interaction protéine/ligand - Détermination de l’affinité - Etude des paramètres thermodynamiques. Technologies associées : SPR, iTC, Label free, fluorescence. • Contrôle qualité : Analyse de l’intégrité structurale ou de la fonctionnalité - Evaluation de la pureté des protéines. Responsable : Pierre WEIGEL

34. Plate-forme de production de vecteurs viraux La plate-forme de production de vecteurs viraux a développé et validé des procédés de production et caractérisation de 2 types majeurs de vecteurs viraux de transfert de gènes : les adénovirus et les virus adéno-associés. Destinés à des applications in vitro et in vivo, ces vecteurs sont régulièrement utilisés pour évaluer ou moduler l'expression d'un gène dans un modèle cellulaire ou pour étudier des stratégies thérapeutiques en cancérologie, pour le traitement de maladies génétiques, acquises ou dégénératives. Le groupe R&D de la plate-forme développe des outils biologiques et des procédés de production et purification de vecteurs viraux compatibles avec une utilisation en clinique humaine (contraintes GMP). Plate-forme de production de vecteurs viraux Responsable : Philippe MOULLIER

35. Plate-forme SynNanoVect • La plate-forme « SynNanoVect » propose : • Une large gamme de vecteurs synthétiques efficaces aussi bien in vitro qu’in vivo pour le transfert de constructions d’acides nucléiques et de molécules thérapeutiques • Un service de caractérisation et de formulation des nanocomplexes • Un système d’imagerie du petit animal par bioluminescence et fluorescence • Des évaluations pré-cliniques (toxicité et inflammation) • Un plateau technique d’électroporation Plate-forme SynNanoVect Responsables : Tristan MONTIER et Thierry BENVEGNU

36. Plate-forme Transgenèse Xénopes • La plate-forme propose à toute équipe de recherche la possibilité d'utiliser les modèles xénopes (X. laeviset X. tropicalis) pour ses travaux. Les animaux adultes, embryons, têtards, ovocytes sont produits au centre. • Le plateau de recherche propose différentes prestations : • Création de lignées transgéniques • Mutagenèse • Criblage phénotypique • Microinjectiondans l'ovocyte et criblage électrophysiologique d'ovocytes microinjectés • Etc. Plate-forme Transgenèse Xénopes Responsable : Daniel BOUJARD

37. Plate-forme TRIP • La plate-forme « TransgenicRats and Immunophenomics Platform Nantes » (TRIP-Nantes) propose : • Production à façon et en routine de rats transgéniques par microinjection embryonnaire de fragments d’ADN ou de vecteurs lentiviraux • Génération de rats KO/KI par microinjection embryonnaire de nucléases spécifiques de gènes (Zinc-FingerNucleases, TALE nucléases, Méganucléases, CRISPR-Cas9 nucléases) • Génotypage(PCR, qPCR, southern blot, LAM-PCR) • Cryoconservation d’embryons transgéniques • Immunophénotypageet analyse de la réponse immune de rats génétiquement modifiés Plate-forme TRIP Responsable : Ignacio ANEGON

38. Plate-forme LGA Le LGA (laboratoire des grands animaux) est spécialisé dans la chirurgie expérimentale de modèles pré-cliniques de transplantation, ainsi que dans diverses procédures chirurgicales et/ou immunomonitorage sur porcs et primates. Le laboratoire est ouvert à la recherche, à l'enseignement mais également à des tests réglementaires in vivo. Il est spécialisé dans la chirurgie, en particulier d’allo et de xénotransplantation rénale dans des modèles pré-cliniques, mais également dans d’autres procédures chirurgicales (test de nouvelles techniques, nouveaux matériels, etc.) et enfin l'immunomonitorage des animaux en expérimentation. Plate-forme LGA Responsable : Gilles BLANCHO

39. Plate-forme Cardiex • Cardiex est une plate-forme d'exploration fonctionnelle sur le petit animal. Elle offre les moyens techniques et l’expertise pour l’analyse de nouvelles voies thérapeutiques ou nutritionnelles, depuis la validation de cibles d’intérêt jusqu’à l’évaluation de molécules en pharmacologie de sécurité: • Exploration fonctionnelle des pathologies cardiovasculaires, métaboliques, musculaires, digestives, respiratoires et cancéreuses sur le petit animal • Validation à un niveau pré-clinique de nouvelles cibles d’intérêt thérapeutique • Evaluation des effets thérapeutiques ou protecteurs de molécules ou de composés alimentaires • Caractérisation des effets d’un produit : identification de son action, des organes cibles, des doses actives Plate-forme Cardiex Responsable : Flavien CHARPENTIER

40. Plate-forme ImPACcell • La plate-forme ImPACcell propose un service d’analyse du contenu cellulaire par l'image (HCS/HCA) pour détecter, analyser et quantifier des phénomènes biologiques tels que la toxicité, la motilité cellulaire, le cycle cellulaire, l'apoptose, la perturbation de voies de signalisation au niveau cellulaire et dans des petits organismes. • Elle est configurée autour de 3 plateaux : • Plateau automatisé de cultures et de tests cellulaires • Plateau de microscopie automatisée pour l'analyse multifactorielle et multiparamétrique d'images • Plateau de bioscreening de molécules exogènes basé sur l'étude de différentes lignées cellulaires adhérentes sur support pour culture cellulaire (plaques de 6 à 384 puits). Plate-forme ImPACcell Responsable : Anne CORLU

41. Plate-forme Biodimar • BIODIMAR offre un savoir-faire en extraction, purification et analyses de biomolécules d'origine marine : • Collecte d’échantillons ou d’organismes marins et mise à disposition de biomasse ou d’extraits • Purification de molécules • Screening d’activités biologiques • Lyophilisation, broyage, extraction, concentration • Analyses physico-chimiques • Détermination d'activités enzymatiques spécifiques Plate-forme Biodimar Chargée de projets : Elise PETIT-RODAT

42. Plate-forme KISSf La plate-forme spécialisée de criblage d’inhibiteurs de protéines kinases « KISSf » (pour Kinase inhibitorspecialized screening facility) offre un service d'évaluation à moyen débit (2500 composés/jour) de la bioactivité de composés chimiques. En utilisant un panel de kinases, les analyses réalisées permettent d'évaluer les propriétés thérapeutiques de molécules d'intérêt. Plate-forme KISSf Responsable : Sandrine RUCHAUD

43. Plate-forme CHEM-Symbiose La plate-forme CHEM-Symbiose est compétente pour la synthèse de molécules organiques à différentes échelles allant du milligramme à la dizaine de grammes. CHEM-Symbiose vous propose la préparation de molécules non commerciales (ou trop onéreuses) décrites dans la littérature, ou d’analogues, répondant à une nécessité de recherche ponctuelle. Cette plate-forme a aussi pour objectif d’accompagner des projets de recherche collaboratifs en préparant des molécules originales pour l’innovation thérapeutique ou la validation de concept. Plate-forme CHEM-Symbiose Responsable : Jacques LEBRETON

44. Plate-forme MRic • La plate-forme d’imagerie MRic s'articule autour de 3 plateaux techniques : • MRic-Photonics: microscopie de fluorescence pour le vivant, FRAP, FRET, FLIM, FCS • MRic-TEM: cytologie ultrastructurale, immunomicroscopie électronique, coloration négative, cryo-microscopie électronique • MRic-NANO: imagerie chimique et isotopique à haute résolution Plate-forme MRic Responsable : Claude PRIGENT

45. Plate-forme PRISM • La plate-forme rennaise d’imagerie et spectroscopie structurale et métabolique (PRISM) propose : • Imagerie fonctionnelle et morphologique in vivo pour le petit animal et l’animal moyen • Chirurgie interventionnelle guidée par l’image • Imagerie appliquée à la physiologie animale • Imagerie des bio-produits par Résonance magnétique • Spectrométrie RMN haute résolution et HR-MAS : structures et interactions moléculaires • Diffusion moléculaire par RMN à gradient de champ appliquée aux milieux poreux Plate-forme PRISM • La plate-forme PRISM est articulée en 4 composantes : • Ani-Scans- Imagerie multi-modalité appliquée au modèle porc • Agro-Scans- IRM multi-échelle et RMN en agronomie et agro-alimentaire • Bio-Scans- IRM et SRM du petit animal et applications cliniques • Bio-RMN - Spectroscopie RMN structurale et biologique Responsable : François MARIETTE

46. Plate-forme H2P2 • La plate-forme d’histopathologie H2P2 • met à disposition de la communauté scientifique les outils d’histologie • classiques : • Congélation, fixation, inclusion de tissus, coupes fines au microtome et cryostat, coloration, immuno-histochimie, hybridation in situ sur coupes de tissus, etc. • Et des technologies plus innovantes telles que : • La microdissection laser • Le tissue multi array (TMA) Plate-forme H2P2 Responsable : Alain FAUTREL

47. Plate-forme MicroPICell • La plate-forme MicroPICell propose un ensemble de prestations axées autour de l’imagerie cellulaire à fluorescence et de l’histologie. • La plate-forme propose : • La visualisation et quantification de fluorescence sur cellules adhérentes ou tissus • Des mesures intracellulaires de flux ionique • L’évaluation de l’interaction protéine/protéine • Le criblage à haut débit (HCS) • Le Tissue micro array • Des techniques histologiques Plate-forme MicroPICell Responsable : Jacques LE PENDU

48. Cyclotron Arronax Le cyclotron ARRONAX est un accélérateur de particules qui produit de radioisotopes innovants, mais également de médicaments radioactifs à finalités diagnostique (imagerie TEP) et thérapeutique (radiothérapie vectorisée). Cyclotron ARRONAX Responsable : Jacques BARBET

49. Plate-forme Neurinfo La plate-forme d'imagerie et de neuroinformatique (Neurinfo) offre des ressources d'acquisition, de gestion et de traitement d'images pour le développement et la valorisation d'activités de recherche clinique, méthodologique et technologique : Plate-forme NEURINFO • Réalisation, suivi et coordination du volet imagerie IRM d’études de recherche clinique et de recherche fondamentale menées sur la plate-forme • Mise au point des protocoles d’acquisition IRM et optimisation des séquences • Acquisition des données • Mise au point d’outils de traitement de données et exploitation des données • Gestion des données, etc. Responsable : Christian BARILLOT

50. Plate-forme Cytogénétique moléculaire L’outil principal de la plate-forme est l’Hybridation in situ en fluorescence (FISH) sur préparation chromosomique en mitose, méiose et fibres d’ADN. Le pouvoir de résolution de la FISH permet une analyse fine de la structure des chromosomes. Plate-forme Cytogénétique moléculaire • La plate-forme met à disposition un savoir-faire en matière • d'hybridation in situ fluorescente (FISH) sur chromosomes en mitose • et en méiose : • Localisation sur les chromosomes de séquences d'ADN répétée (FISH) • Hybridation génomique in situ (GISH) qui permet la différentiation des chromosomes parentaux chez des structures hybrides interspécifiques ou polyploïdes • Localisation et organisation physique de clones BAC sur les chromosomes (BAC-FISH) sur chromosomes en mitose et en méiose (stade pachytène) pour une résolution plus fine • Le BAC-Fiber-FISH sur fibres d'ADN peignées permet l'analyse d'arrangements de séquences et l’identification de la longueur physique en kilobases. Responsable : Olivier CORITON