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见书上 19 、 20 章. 第一节 概述 第二节 生物能学 第三节 高能化合物. 第一章 代谢总论. 1 -概述( P 1-20 ). 第一节 概述. 了解代谢的全貌 , 了解糖、脂、蛋白质共同的代谢中枢途径. 一、概念 二、代谢特点 三、代谢研究方法. 代谢 ( metabolism) : 新陈代谢 狭义:生物体活细胞中所有 化学 变化的总称。每一变化均由 酶 催化。 广义:生物体与环境之间的物质和能量交换。 中间代谢 : 代谢中一系列 酶促反应 。 代谢物 : 代谢反应中任一反应物、中间代谢物或产物 .
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见书上19、20章 第一节 概述 第二节 生物能学 第三节 高能化合物 第一章 代谢总论
1-概述(P1-20) 第一节 概述 了解代谢的全貌,了解糖、脂、蛋白质共同的代谢中枢途径 一、概念 二、代谢特点 三、代谢研究方法
代谢(metabolism):新陈代谢 狭义:生物体活细胞中所有化学变化的总称。每一变化均由酶催化。 广义:生物体与环境之间的物质和能量交换。 中间代谢:代谢中一系列酶促反应。 代谢物:代谢反应中任一反应物、中间代谢物或产物. 代谢组:在某一时刻细胞内所有代谢物的集合. 代谢组学:是继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的,研究代谢组的一门学科。 代谢途径:一系列有序的反应通常称为一个途径。 有三种形式(图示) 1-概述-概念 一、 相关的概念
物质代谢:即生命物质的降解和建成,又分为分解代谢和合成代谢。它与能量代谢紧密偶联、互成因果物质代谢:即生命物质的降解和建成,又分为分解代谢和合成代谢。它与能量代谢紧密偶联、互成因果 合成代谢:由小分子合成生物大分子的过程。 耗能、还原;阶段性和趋异性;营养依赖性 分解代谢:将生物大分子分解成小分子的过程。 放能、氧化;阶段性和趋同性 能量代谢:生物体的合成代谢及分解代谢过程中伴随着能量的变化
1-概述-概念 代谢的概念及内涵 小分子 大分子 合成代谢(同化作用) 需要能量 释放能量 分解代谢(异化作用) 大分子 小分子 能量代谢 物质代谢 新陈代谢
1、严格的细胞内定位 2、特异的酶促反应 3、共同的代谢间关联 4、严谨的反应顺序 5、高效率的调控机构:分子水平、细胞水平、整体水平 1-概述-代谢特点 二、代谢特点:
体内与体外实验: 1.在活体内(in vivo): 生物体内:动物实验、组织细胞培养等。 2.在体外(in vitro): 在试管内进行:细胞切片、匀浆液、提 取液等。 1-概述-代谢研究方法 三、 代谢研究方法
整体方法 纯化合物 排泄物的化学分析 典型案例 脂肪酸的β氧化
组织提取法 典型例子 糖代谢、生物氧化等等 各类组织细胞 各种破碎方法 碎片置于试管中 向该试管中加入纯化合物(如葡萄糖)分析各类代谢中间产物及酶,逻辑推断。
放射性同位素: 原子量不同,衰变中有射线辐射的同位素。 常用的有:氚(3H)、14C、32P、34S、131I等 1-概述-代谢研究方法 (一)、同位素示踪法: • 仪器: 放射自显影、脉冲探测仪、γ-计数器、液体闪烁计数器等。 • 特点: 特异性强、灵敏度高、方法简便。注意个人防护。
γ β 高能化合物 ATP 同位素示踪法 细胞内P32迅速被无放射性的P代替,并传递给其它物质,这意味着什么?
用抗代谢物或酶抑制剂阻抑中间代谢的某一环节,使中间物积累,便于分析和推测代谢情况。 1-概述-代谢研究方法 (二)酶抑制剂使用法 (三)气体测量法 研究包含气体变化的代谢。 常用仪器: 瓦氏呼吸仪。
1-概述-代谢研究方法 (四)利用遗传欠缺症 (五)核磁共振波谱法 测定特殊同位素1H、13C、31P、15N的核自旋,
一、热力学定律 生物化学反应与普通的化学反应一样,也服从热力学的规律。 热力学第一定律:能量守恒定律 热力学第二定律:熵定律 2-生物能 第二节 生物能学简介 熟悉标准自由能变化以及ΔG°ˊ计算
1、自由能(Gibbs,G)的概念: 生物体(恒温恒压下)用以作功的能或生物氧化所提供的能。 自由能是生物化学中主要的热力学函数。 ΔG(自由能变)表示产物和反应物自由能之间的差值. ΔG =G产物-G反应物 物理意义:-ΔG=W*(体系中能对环境作功的能量) 意义:用来判断机体内某一过程能否自发进行; 利用自由能这个函数来计算反应的其它有用参数。 2-生物能-自由能 二、自由能及应用
ΔG与反应途径、反应机理无关。任何反应,当:ΔG与反应途径、反应机理无关。任何反应,当: ΔG<0 反应可自发进行,为放能不可逆反应; ΔG >0反应不能自发进行,为吸能反应; ΔG =0 体系处于平衡状态,反应可逆。 2-生物能-自由能 2、自由能和化学反应的关系
2-生物能-自由能 3、自由能的变化和平衡常数的关系 假设有一个化学反应式:aA + bB = cC + dD ΔG=ΔG°+ RTlnQc ΔG°(标准自由能变)—标准条件(T=298OK,大气压为1atm,反应物和生成物浓度为1mol/L)下,化学反应自由能的变化。 ΔG(自由能变) —某一化学反应随参加化学反应物质的浓度、发生化学反应的pH和温度而改变的自由能变化。 Qc - 浓度商: ΔG和ΔG°是两个不同的值,自发进行的反应中ΔG总是负值,而ΔG°可正可负或为零。对活细胞中的不可逆反应ΔG不仅是负值,而且其绝对值数值应当很大。 代谢途径中的调控部位一般都是代谢中的不可逆反应,催化这些反应的酶都受到某种方式的调控。
2-生物能-自由能 生物化学反应(恒温恒压下)中: ΔG=ΔG°′+ RTlnQc 式中:ΔG°′= - RTlnK’eq ΔG°′ —标准条件(T=298OK,大气压为1atm,反应物和生成物浓度为1mol/L,pH=7.0)下,化学反应自由能的变化。 R:气体常数 R=1.98×10-3 Kcal/mol 或R=8.31×10-3 KJ/mol T为绝对温度 K’eq - 平衡常数: 例题 练习
2-生物能-自由能 3、ΔG°′的可加性 在偶联的化学反应中,各反应的标准自由能变化是可以相加的:例: A = B+C ΔG°′= + 20.92 KJ/mol B = D ΔG°′= - 33.47 KJ/mol 则A = C + D ΔG°′= - 12.55 KJ/mol 该规则表明一个在热力学上不利的反应,可以与热力学有利的反应偶联进行,即不利的反应可以被热力学有利的反应所驱动而进行
2-生物能-自由能 4、能量学用于生物化学反应中的一些规定 (1)、在稀的水溶液系统中,如果有水作为反应物或产物时,水的浓度(近似的即活度)为1.0。 (2)、生物体标准状况的pH规定为7.0。 (3)、ΔG°’是 pH为7.0时的标准状况下的的标准自由能。 (4)、根据国际单位制,热和能量的单位用焦耳/摩尔(J/mol)或KJ/mol。
3-高能化合物 第三节 高能化合物 熟悉生物体内的高能化合物 生化反应中,在水解时或基团转移反应中可释放出大量自由能(>5千卡或21千焦/摩尔,即△G < -5千卡/mol)的化合物称为高能化合物。 生物体内的放能反应与吸能反应偶联,最基本的形式是通过高能化合物实现的
1、磷氧键型:如ATP等 2、氮磷键型:如磷酸肌酸等 3、硫酯键型:如脂酰CoA等 4、甲硫键型:S-腺苷甲硫氨酸 3-高能化合物-类型 一、高能化合物的类型
3-高能化合物-类型 O O O O - O P C O - - O C H C O P O 3 C H O H O - O - O C H O P 2 - O 1、磷氧键型(—O~P) (1)酰基磷酸化合物 乙酰磷酸 3-磷酸甘油酸磷酸 -10.1千卡/摩尔 -11.8千卡/摩尔
3-高能化合物-类型 酰基腺苷酸 氨甲酰磷酸 氨酰基腺苷酸
3-高能化合物-类型 (2)焦磷酸化合物 焦磷酸 ATP(三磷酸腺苷) -7.3千卡/摩尔
3-高能化合物-类型 (3)烯醇式磷酸化合物 磷酸烯醇式丙酮酸 -14.8千卡/摩尔
3-高能化合物-类型 2、 氮磷键型 磷酸精氨酸 磷酸肌酸 -10.3千卡/摩尔 -7.7千卡/摩尔 这两种高能化合物在生物体内起储存能量的作用。
3-高能化合物-类型 3、硫酯键型 酰基辅酶A 腺苷-5’-磷酸硫酸
3-高能化合物-类型 4、甲硫键型 S-腺苷甲硫氨酸
3-高能化合物-ATP + + + 腺嘌呤—核糖— O — P — O — P — O — P — O- O- O- O- Mg2+ O O O 二、ATP 1、 在pH=7环境中,ATP分子中的三个磷酸基团完全解离成带4个负电荷的离子形式(ATP4-),具有较大势能,加之水解产物稳定,因而水解自由能很大(如ΔG°′=-30.5千焦/摩尔)。 ATP4- + H2O = ADP3- + Pi2- + H+ ΔG°’=-30.5kJ.mol-1
3-高能化合物-ATP ATP的高能磷酸键
3-高能化合物-ATP 磷酸烯醇式丙酮酸 14 12 磷酸基团转移能 磷酸肌酸(磷酸基团储备物) ~P 10 3-磷酸甘油酸磷酸 ~P ~P 8 ATP ~P 6 ~P 6-磷酸葡萄糖 4 2 3-磷酸甘油 0 2、ATP在能量转运中地位 ★ ATP是细胞内磷酸基团转移的中间载体★ATP是细胞内的“能量通货”
作为能量载体,提供合成代谢或分解代谢初始阶段所需的能量;作为能量载体,提供合成代谢或分解代谢初始阶段所需的能量; 3-高能化合物-ATP G+ATP → G-6-P+ADP 脂酸+CoA+ATP →脂酰CoA+AMP+PPi 氨基酸+ATP →氨基酰~AMP+PPi • 供给机体生命活动所需的能量; 例如:一个静卧的人24小时内消耗约40公斤ATP。
ATP+H2O AMP+PPi ΔG0 ’=-7.7(Kcal/mol)=-32.19(KJ/mol) -61.028 KJ/mol • PPi +H2O 2Pi ΔG0 ’=-6.9(Kcal/mol)=-28.842(KJ/mol) 意义:萤火虫发光物质的形成:由ATP降解为AMP+PPi来提供腺苷酸;为一些接近平衡的反应提供驱动力: ATP+RCOOH+CoA-SH AMP+PPi+RCO-CoA ΔG0 ’=0.2(Kcal/mol)=0.836(KJ/mol)
3-高能化合物-ATP • 将高能磷酸键转移给肌酸以磷酸肌酸形式储存。
[ATP]+1/2[ADP] [ATP]+[ADP]+[AMP] 3、能荷 • ATP是生命活动中能量的主要直接供体,因此ATP不断产生又不断消耗, ATP、ADP和AMP的转换率非常高。但他们在机体内总能保持相应的平衡状态,以适应细胞对能量的需求。 • 细胞所处的能量状态用ATP、 ADP和AMP之间的关系式来表示,称为能荷,公式如下: • 能荷= 腺苷酸库
能荷是细胞所处能量状态的一个指标,当细胞内的ATP全部转变为AMP时能荷值为0,当AMP全部转变为ATP时,能荷值为1。能荷是细胞所处能量状态的一个指标,当细胞内的ATP全部转变为AMP时能荷值为0,当AMP全部转变为ATP时,能荷值为1。 • 高能荷抑制ATP的生成,促进ATP的应用,即促进机体内的合成代谢。 • 大多数细胞的能荷处于0.8-0.95之间。说明细胞内ATP的产生和利用都处于一个相对稳定的状态。(同位素实验)
新陈代谢的概念: 合成代谢、分解代谢、 物质代谢、能量代谢、代谢物 生物能学: ΔG 、ΔG0’的计算 主要的高能化合物 本 章 重 点