Инициация транскрипции у эукариот и ее регуляция

1. Инициация транскрипции у эукариот и ее регуляция

2. Какие бывают РНК полимеразы. За что они отвечают. У эукариот есть три различные РНК полимеразы - I, II и III, ответственные за транскрипцию с соответствующих промоторов класс I =гены, кодирующие рибосомальные РНК II =гены, кодирующие матричные РНК и некоторые малые ядерные РНК III =гены, кодирующие транспортные РНК и оставшиеся малые ядерные РНК.

3. Эукариотические РНК полимеразы не способны сами по себе инициировать транскрипцию. Для этого им необходимы вспомогательные белки - факторы инициации, формирующие совместно с полимеразами преинициаторные комплексы.

4. Типы транскрипционных факторов • Базальные - включают Pol II + GTFs • Ко-факторы -взаимодействуют с регуляторами • Специфические - связываются с промоторами, энхансерами и сайленсерами - регулируют транскрипцию отдельных генов

5. БазальныефакторыСтруктура промотора эукариот • ТАТА – содержащие • ТАТА – не содержащие

6. БазальныефакторыИнициация на ТАТА • TFII (Transcription Factors of RNA polymerase II) • TFIID (TBP+TAFs) • TBP (TATA Binding Protein) • TAFs (TATA associated proteins) • TFIIA • TFIIB • TFIIF + RNA polym II • TFIIE – activates TFIIH • TFIIH – helicase + kinase

7. Инициация на ТАТА-less промотерах Схемы инициации для ТАТА содержащих и ТАТА-несодержащих промотеров В ТАТА-несодержащихпромотерахинициация идет при помощи белков TAFs комплекса TFIID

8. Базальные факторы

9. Базальная регуляция TAF1 может связываться с ТАТА узнающей областью TBP Еще один из примеров мимикрии белков TFIIA конкурирует в связывании TBP с TAF1 Также TFIIA стабилизирует комплекс ТBP-ТАТА

10. Базальная регуляция TBP могут объединяться в гомодимеры, что препятствует их взаимодействию с ДНК TFIIA провоцирует диссоциацию таких TBP-гомодимеров на мономеры

11. Базальная регуляция Аналогично TAF1, BTAF1мимикрирует ТАТА, не ингибируя связывание TBP c ДНК ОсобенностьюBTAF1является способность одного из его доменов индуцировать диссоциацию комплекса TBP-ДНК

12. NC2 • NC2 cостоит из 2 субъединиц • Образует кольцо, блокирующее преинициаторный комплекс • Также может быть коактиватором для TATA-несодержащих промоторов • По отдельности субъединицы могут быть вовлечены в специфическую транскрипцию

13. Адаптеры Модификаторы хроматина HATs и HDACs Ремоделируют нуклеосомы Ко-репрессоры Ко-активаторы Regulator-assotiated co-factors

14. Медиатор. Кто это? Медиатор – мультибелковый комплекс из 20 белков -Роль медиатора – перенос сигнала (как положительного, так и отрицательного) от специфического фактора транскрипции, связанного с энхансером, к РНК-полимеразе II.

15. Роджер Д. Корнберг Нобелевская премия по химии за 2006 год присуждена Роджеру Д. Корнбергу “за фундаментальные исследования молекулярных основ транскрипции у эукариот”.

16. Медиатор.(MED) MED взаимодействует с не фосфорелированной формой С-концевого Домена полимеразы-2.(СTD) MED+СTD=holoenzyme MED взаимодействует с РНК-полимеразой2 Только на стадии инициации. Затем MED отсоединяется. Одна из причин этого – фосфорелирование CTD. Отличается высокой консервативностью От дрожжей до человека.

17. Структурные части медиатора. Голова(Head)- образует наибольшее количество контактов с полимеразой. Самая консервативная часть. Хвост(Tail) – платформа для взаимодействия с ген-специфическими активаторами.Наименее консервативная часть. Тело(Middle)- соединительная функция