310 likes | 467 Views
CHROMOSOME WALKING. BARDZO TREŚCIWY SKRÓT. PIĘĆ WYBRANYCH METOD SPACEROWANIA PO CHROMOSOMIE. T- LINKER PCR. SITE FINDING PCR. BD GENOME WALKER PCR. INVERSE PCR. TAIL PCR. T -LINKER PCR. PRZYKŁAD – NIE MÓJ. SITE FINDER PCR. STRUKTURA PRZYKŁADOWEGO SITE FINDERA. Site finder. Site finder.
E N D
CHROMOSOME WALKING BARDZO TREŚCIWY SKRÓT
PIĘĆ WYBRANYCH METOD SPACEROWANIA PO CHROMOSOMIE T- LINKER PCR SITE FINDING PCR BD GENOME WALKER PCR INVERSE PCR TAIL PCR
Site finder Site finder Site finder UNKNOWN SEQUENCE UNKNOWN SEQUENCE UNKNOWN SEQUENCE KNOWN SEQUENCE KNOWN SEQUENCE KNOWN SEQUENCE GSP 3 GSP 3 GSP 3 GSP 2 GSP 2 GSP 2 GSP 1 GSP 1 GSP 1 AATCTTG AATCTTG AATCTTG TTAGAAC TTAGAAC TTAGAAC GCGC GCGC GCGC NNNNNNNNNCGCGNNNNNNN NNNNNNNNNCGCGNNNNNNN NNNNNNNNNCGCGNNNNNNN KNOWN SEQUENCE KNOWN SEQUENCE KNOWN SEQUENCE GSP 3 GSP 3 GSP 3 GSP 2 GSP 2 GSP 2 GSP 1 GSP 1 GSP 1 SITE FINDING PCR
TEMPERATURA [ oC ] CZAS [ s ] Denaturacja wstępna 98 120 Denaturacja właściwa 98 30 Annealing/polimeryzacja 72 180 Denaturacja 98 30 Annealing/ Amplifikacja 67 180 Wydłużanie końcowe 67 300 Pauza 4 ∞ 7X 32X
CO ZROBIĆ Z OTRZYMANĄ SEKWENCJĄ ? BLAST ALIGNMENT ANALIZY LABORATORYJNE
HI – TAIL PCR (High-efficiency thermal asymmetric interlaced )
SITE FINDING PCR Low temp. Annealing Site finding primer - High 90%> 0-4kb low PODSUMOWANIE