340 likes | 360 Views
Lékařská chemie Nukleové kyseliny. Nukleové kyseliny. - první izolace z buněčných jader kolem 1870 ( Friedrich Miescher ) - vlastnosti : kyselá povaha, velké množství fosforu !. - chemická struktura: polynukleotid. - složení nukleotidu: dusíkatá baze ( pyrimidin , purin)
E N D
Lékařská chemie Nukleové kyseliny
Nukleové kyseliny - první izolace z buněčných jader kolem 1870 (Friedrich Miescher) - vlastnosti: kyselá povaha, velké množství fosforu! - chemická struktura: polynukleotid - složení nukleotidu: dusíkatá baze(pyrimidin, purin) pentosa (k bazi připojena N-glykosidickou vazbou) kys. fosforečná(k cukru připojena esterovou vazbou) - typy: DEOXYRIBONUKLEOVÁ K. (DNA) - cukr: deoxyribosa - dvoušroubovice - uložení genetické informace RIBONUKLEOVÁ K. (RNA) - cukr: ribosa - většinou jednovláknový charakter - mnoho typů, vesměs se podílí na přenosu genetické informace z DNA na proteiny
Pyrimidinové baze pyrimidin uracil U thymin T cytosin C keto-enol tautomerie (v DNA jen ketoforma)
Purinové baze 9H - purin (b-purin) 7H - purin (α-purin) baze v nukleových kyselinách jsou deriváty β-purinů Purinové alkaloidy (methylxantiny) káva čaj kakao
Purinové baze adenin A guanin G
Tvorba nukleosidů a nukleotidů BAZE NUKLEOSID NUKLEOTID adenin adenosin AMP deoxynukleosid (deoxyadenosin) deoxynukleotid (dAMP)
Ribonukleotidy - "stavební kameny" RNA - v RNA přítomny: A, G, U, C
Deoxyribonukleotidy - "stavební kameny" DNA - v RNA přítomny: A, G, T, C
Nukleosid mono-, di- a trifosfáty Ribonukleosid 5' - fosfáty Deoxyribonukleosid 5' - fosfáty
Konfigurace "syn" x "anti" baze jsou v DNA orientovány v konfiguraci "anti"
"Makroergní sloučeniny" ATP = adenosine triphosphate esterová vazba fosfoanhydridové vazby
ATP ATP + H2O ADP + Pi DG = - 30,5 kJ/mol
ATP + H2O ADP + Pi ATP + H2O DG = - 30,5 kJ/mol ADP + Pi ATP vzniká při oxidační fosforylaci v mitochondriích, je hlavním zdrojem energie pro endergonické reakce (svalová kontrakce, aktivní transport, aktivace metabolitů, energ. náročné biosyntézy)
Polynukleotidy 5' konec 3' konec
5' konec 3' konec
Cesta k objevu struktury DNA Rentgenová difrakční analýza (1953) Rosalind Franklin Maurice Wilkins Chargaffova pravidla • množství A = množství T • množství G = množství C • puriny = pyrimidiny
Struktura DNA - Nobelova cena za fyziologii a lékařství 1962 • FrancisCrick JamesWatson MauriceWilkins
April 25, 1953 MOLECULAR STRUCTURE OF NUCLEIC ACIDS A Structure for Deoxyribose Nucleic Acid We wish to suggest a structure for the salt of deoxyribose nucleic acid (D.N.A.). This structure has novel features which are of considerable biological interest. … It has not escaped our notice that the specific pairing we have postulated immediately suggests a possible copying mechanism for the genetic material. … J. D. WATSON F. H. C. CRICK Medical Research Council Unit for the Study of Molecular Structure of Biological Systems, Cavendish Laboratory, Cambridge.
Struktura DNA 2 komplementární řetězce DNA opačné polarity šroubovicové stočení kolem společné osy deoxyriboso-fosfátové články jsou na povrchu baze uvnitř v rovinách kolmých na osu šroubovice
Princip komplementarity – párování bazí oba řetězce jsou drženy pohromadě systémem vodíkových vazeb komplementárních bazí adenin thymin baze jsou v DNA orientovány v konfiguraci "anti" guanin cytosin
Struktura DNA 1 otočka dvojšroubovice = 10 párů bazí = 3,4 nm 3000 párů bazí (3 kb) ~ 1 μm lidský genom 3 x 109 párů bazí~ 1 m
Typy RNA mRNA(messenger RNA) - vzniká transkripcí genů kódujících proteiny- základní funkcí je umožnit vznik proteinu rRNA(ribosomální RNA) - vzniká transkripcí specifických genů - strukturní a enzymatická úloha - spolu se specifickými proteiny tvoří ribosomy tRNA(transferová RNA) - vzniká transkripcí specifických genů - adaptor mezi mRNA a aminokyselinami v průběhu biosyntézy proteinu
ribosomální RNA (rRNA) - zaujímá 2/3 ribosomu, zbytek bílkoviny - ribosom je složen z větší a menší subjednotky velikosti vyjadřovány Svedbergovými jednotkami (S) prokaryotickýribosom eukaryotickýribosom
Genetický kód - soubor pravidel, jak ... (převést informaci zapsanou pořadím nukleotidů do sekvence aminokyselin) 1. písmeno kodonu 2. písmeno kodonu 3. písmeno kodonu
TRANSKRIPCE KODON ANTIKODON TRANSLACE
Další dnes známé typy RNA malé jaderné RNA - regulační, respektive enzymatická funkce - malé jaderné RNA (snRNA; odvozeno od smallnuclear RNA) - malé jadérkové RNA (snoRNA; odvozeno od smallnucleolar RNA) RNA v „SRP“ (signalrecognisingparticle) - rozpoznává „signal peptide“ v nově tvořeném proteinu a zajistí vstup proteinu do endoplasmatického retikula microRNA (miRNA) - velice krátké ( ~22 nt) - negativní regulátory genové exprese lncRNA - nekódující RNA delší než 200 nt - spousta důležitých struktur jsou "ribonukleoproteiny"