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Introduction

Introduction. Les transitions énergétiques se font entre les niveaux d’énergie de rotation et de vibration des molécules. Les transitions entre niveaux vibrationnels apparaissent de 1 à 20 µm (ou de 10 000 à 500 cm -1 ). Trois informations. Identification de molécules et groupes chimiques

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Presentation Transcript

  1. Introduction Les transitions énergétiques se font entre les niveaux d’énergie de rotation et de vibration des molécules. Les transitions entre niveaux vibrationnels apparaissent de 1 à 20 µm (ou de 10 000 à 500 cm-1).

  2. Trois informations • Identification de molécules et groupes chimiques • Information conformationnelle • Empreinte unique •  Qualitatif •  Quantitatif

  3. 1- Information on chemical groups

  4. Attenuated total reflection (ATR) Ge plates ATR and transmission

  5. Attenuated total reflection (ATR) The evanescent wave

  6. Introduction (suite)

  7. Introduction (suite) Pour les échantillons biologiques principalement composés de protéines, lipides, glucides et acides nucléiques: Spectres FTIR du glucose (à gauche) et du sérum (à droite). Le premier spectre peut être utilisé pour étudier les absorptions caractéristiques du glucose (spectre de produit pur); la bande centrée à 1033 cm-1 est utilisée pour déterminer la concentration de glucose.

  8. Trois informations • Identification de molécules et groupes chimiques • Information conformationnelle • Empreinte unique

  9. Trois informations • Identification de molécules et groupes chimiques • Information conformationnelle • Empreinte unique •  Qualitatif •  Quantitatif

  10. 1- Information on chemical groups + (-N(CH3)3) as(CH3) (CH=CH) The FTIR spectrum of a phospholipid PC as(CH2)

  11. 1- Information sur les groupes chimiques Ex: 4 lipides (4 phospatidylcholines) DOPC DSPC DPPC DMPC

  12. 1- Information sur les groupes chimiques Ex: 4 phospatidylcholines: longueur des chaînes DOPC DSPC DPPC DMPC

  13. 1- Information sur les groupes chimiques Ex: 4 phospatidylcholines: longueur des chaînes DOPC DSPC DPPC DMPC

  14. 1- Information sur les groupes chimiques Ex: 4 phospatidylcholines: longueur des chaînes Aire s(CH3)/s(CH2) DOPC DSPC DPPC DMPC [CH3]/[CH2]

  15. 1- Information sur les groupes chimiques Ex: 4 phospatidylcholines: insaturation des chaînes DOPC DSPC DPPC DMPC Mesures transition phase!

  16. Information on chemical groups Ex: 6 phospatidylcholines: chain lengths

  17. DPPC phase transition as(CH2) Temperature (°C)

  18. Information on chemical groups

  19. Structure secondaire d’une protéine

  20. The IR spectrum of a protein [-C=O-NH-] Amide I: (C=0) Amide II:  (N-H) Amide A: (N-H)

  21. 2- Information on conformation Proteins and lipids Protein Lipid

  22. -helix -sheet -helix The IR spectrum of a protein

  23. The IR spectrum of a protein

  24. 1700 1600 1500 Wavenumber (cm-1)

  25. Secondary structure Prediction -helix Predicted content others Actual content (%) Biophys J. (2006), 90, 2946.

  26. 2- Information on conformation Proteins and lipids Protein Lipid

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