1 / 17

Глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа

Глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа. GLUCOSE-6-PHOSPHATE 1-DEHYDROGENASE. Характеристики Г6ФДГ:. EC 1.1.1.49 Оксидоредуктаза Длина полипептидной цепочки = 515 а. о. (полностью известна) Молекулярная масса = 59,3 Кда Катализируемая реакция: D-glucose 6-phosphate + NADP + =

dara
Download Presentation

Глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Глюкозо-6-фосфатдегидрогеназа GLUCOSE-6-PHOSPHATE 1-DEHYDROGENASE

  2. Характеристики Г6ФДГ: • EC 1.1.1.49 • Оксидоредуктаза • Длина полипептидной цепочки = 515 а. о. (полностью известна) • Молекулярная масса = 59,3Кда • Катализируемая реакция: • D-glucose 6-phosphate + NADP+ = • D-glucono-1,5-lactone 6-phosphate + NADPH • Локализована во внемитохондриальном пространстве клетки (цитозоле)

  3. Пространственная структура Рисунки составлены в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  4. Делится на два домена: Рисунки составлены в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  5. 1 домен Alpha – 11; Beta – 6. Рисунок составлен в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  6. 2 домен Alpha – 11; Beta – 9. Рисунок составлен в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  7. Глицерол (Glycerol) Лиганды Никотинамид – аденин – динуклеотид – фосфат 2 – монофосфатаденозин 5- дифосфорибоза. (Nadpnicotinamide-adenine-dinucleotide phosphate. 2'-monophosphoadenosine 5'-diphosphoribose) Рисунки с сайта http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/summary/summary.cgi?cid=753 Рисунки с сайта http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgi-bin/pdbsum/GetPage.pl?pdbcode=2bh9&template=ligands.html&l=1.1

  8. Как располагаются в молекуле? NAP799 NAP811 GOL1516 GOL1517 Рисунок составлен в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  9. Молекулярная поверхность Вклад - углерода; - кислорода; - азота; - серы. Рисунок составлен в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  10. Электростатический потенциал - «Плюс» - «Минус» Рисунок составлен в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  11. Карта Рамачандрана (Сасисекхаран) β δ пр αL лев 310 α ε Рисунок составлен в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  12. Ответ на Славин вопрос( с ферментативного катализа) Напоминаю: 1 , – 310 спираль 2 – αL спираль 1 2

  13. Активный центр Не входят в состав ац, но накладывают большие стерические ограничения: Glu 364 Lys 366 Arg 370 Gln 395 Arg 365 Glu 239 Asn 363 Lys 238 Pro 396 Arg 393 И Сейчас мы в этом убедимся Рисунок составлен в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  14. Мутации Заменим ARG370 →MET370 Видно, что влияние ВДВ взаимодействий на активный центр существенно изменяется, что может вызвать уменьшение специфичности фермента. Рисунки составлен в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  15. Мутации (2) Заменим LYS366 → ARG366 В следствии данной замены происходит формирование новых водородных связей с ако активного центра. Это полностью исключает связывание с исходным субстратом. Т.е. инактивация фермента. Рисунки составлен в SpdbW 4.01 по данным сайта: http://www.rcsb.org/pdb/explore.do?structureId=2BH9

  16. Биологический смысл Наибольшая активность фермента определяется в эритроцитах. Является важнейшим источником НАДФ.Н, который используется в дальнейшем для биосинтеза различных органических веществ, а также для поддержания нормальной концентрации глутатиона в его восстановленной SH-форме. Последняя защищает гемоглобин и эритроциты от денатурации и распада при действии различных агентов, обладающих окислительными свойствами. Обмен углеводов в эритроците (по McMurray в модификации) Рисунок с сайта http://medbook.medicina.ru/chapter.php?id_level=392

  17. Дефицит глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы • Ген, кодирующий глюкозо-6-фосфатдегидрогеназу, находится в дистальном отделе длинного плеча Х-хромосомы. Обнаружено более 400 мутаций, большинство мутаций происходят спорадически. • Диагностика дефицита Г6ФД осуществляется посредством количественного спектрофотометрического анализа или быстрого флуоресцентного капельного теста, обнаруживающего совокупность восстановленной формы (НАДФН) по сравнению с НАДФ. • Дефицит Г6ФД встречается с наибольшей частотой среди жителей Африки, Азии, Средиземноморья и Среднего Востока. Широкая распространённость дефицита Г6ФД коррелирует с географическим распространением малярии, что привело к возникновению теории, будто носительство дефицита Г6ФД обеспечивает частичную защиту от малярийной инфекции. • Данная ферментативная недостаточность является причиной целого спектра синдромов, включая гипербилирубинемиюноворождённых,гемолитическую анемию и повторные инфекции, характерные для патологии фагоцитарного звена. Е.А. Скорнякова, А.Ю. Щербина, А.П. Продеус, А.Г. Румянцев, «Трудный пациент», №2, 2007г.

More Related