120 likes | 385 Views
Extrakcia DNA z ovocia. Kanisová Katarína II.B , GSF v Žiline. Pomôcky: Šampón s EDTA Kuchynská solˇ Destilovaná voda Banán Papierová vreckovka Podchladený lieh Odmerný valec, váhy, striekačka, skúmavky, lyžička, kadičky a nádobky. Pracovný postup.
E N D
Extrakcia DNA z ovocia Kanisová Katarína II.B, GSF v Žiline
Pomôcky: • Šampón s EDTA • Kuchynská solˇ • Destilovaná voda • Banán • Papierová vreckovka • Podchladený lieh • Odmerný valec, • váhy, striekačka, • skúmavky, lyžička, • kadičky a nádobky
Pracovný postup • Odkrojím 2 kolieska banánu • Rozpučím ich v miske lyžičkou • V nádobke zmiešam • 20-25ml vody, 2g • (1/2 lyž.) soli spolu • s 10ml šampónu , • aby sa všetko dobre • rozpustilo ale • nevytvorila sa pena
Kašovitú hmotu z banána • rozdelím do 2 skúmaviek • Vzniknutý roztok • nelejem do skúmaviek • a dôkladne premiešam • Nechám približne • 10 minút odstáť
Následne zmes • prefiltrujem • pomocou • vreckovky do • čistej nádoby • Vzniknutý filtrát rozdelím do dvoch • skúmaviek • Zalejem približne štvornásobkom • podchladeného liehu • Po krátkej dobe začne zo zakaleného • filtrátu na spodu skúmavky stúpať • k hladine biela vláknitá zrazenina
Táto zrazenina obsahuje niektoré • proteíny z jadra buniek banánu, • prípadne iné molekuly s podobnými • chemickými vlastnosťami ako DNA
DNA je umiestnená v jadre bunky A teda je od okolitého prostredia oddelená viacerými fosfolipidovými membránami. Tu je na ňu naviazaných množstvo proteínov a iných molekúl (transkripčné faktory, polymerázy). Táto makromolekula obsahuje dva komplementárne reťazce pripútané k sebe vodíkovými mostíkmi Nesie náboj, a teda je rozpustná vo vode a môže byť z vodného roztoku vyzrážaná etanolom.
Voda -tvorí reakčné prostredie -DNA je v nej rozpustná Soľ -udržuje osmotický tlak roztoku -urýchľuje lepšie uvoľňovanie Šampón -detergenty prederavia bunkovú membránu a vyzrážajú niektoré proteíny -EDTA inhibuje tie proteíny, ktoré obsahujú kovy schopné poškodiť DNA
Následnou filtráciou sa odstránia všetky látky nerozpustné vo vode. Podchladený lieh sa prilieva preto, že sa menej zmiešava s vodou. DNA sa vyzráža a „vypláva“ do hornej časti skúmavky ku hladine. Týmto sa však nezbavíme väčšiny proteínov viazaných na DNA, takže výsledná „hmota“ obsahuje najmä DNA, čo ale v bežných podmienkach nevieme 100% dokázať. V laboratóriu sa dokazuje látkou Ethydiumbromid alebo DAPI.