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第2章 遗传物质的分子基础. 第2节 核酸的化学结构. DNA ( 27 %). 染色体. 组蛋白 (含量比较稳定,与 DNA 大致相等). 蛋白质 ( 66 %). 非组蛋白. RNA ( 6 %). 碱基结构. 核苷和核苷酸. 磷酸二脂键. DNA 分子结构和表示方法. DNA 双螺旋结构. 右手螺旋 反向平行( antiparallel) 内侧是扁平的盘状碱基 两条链的碱基以氢键( hydrogen bond) 与互补碱基相连 A = T;C ≡ G 上下碱基对相距0.34 nm 每个螺旋长3.4 nm ,10 bp, 直径2 nm
E N D
第2节 核酸的化学结构 DNA(27%) 染色体 组蛋白(含量比较稳定,与DNA大致相等) 蛋白质(66%) 非组蛋白 RNA(6%)
DNA双螺旋结构 • 右手螺旋 • 反向平行(antiparallel) • 内侧是扁平的盘状碱基 • 两条链的碱基以氢键(hydrogen bond)与互补碱基相连 • A=T;C≡ G • 上下碱基对相距0.34nm • 每个螺旋长3.4nm,10bp,直径2nm • 大沟(major groove)和小沟(minor groove)
碱基排列顺序的多样性 • DNA分子是由A-T和C-G两种bp连接起来的,每个DNA分子一般有成千上万个bp • 在每一个位置上只有4种可能: A、 T、C、G • 假设DNA分子长1000bp,就可能有41000种不同的排列形式,41000种不同的分子结构 • 反映出来的就可能是41000种不同性质的基因。
生物体的碱基顺序是稳定的 • 对特定的生物体来说, DNA分子中的碱基顺序通常是保持不变,这样才能保持该遗传特性的稳定 • 只有在特殊的条件下,改变其碱基顺序或用碱基类似物代替某一碱基时,才出现可遗传的变异(突变)
DNA复制的一般特点 • 原料:dNTP,互补配对原则 • 半保留复制 • 半不连续复制 • 需要引物 • 新链的延伸方向只能是5' →3'
复制起始点 • 复制起始点 replication origin,ori DNA分子的复制是在特定位置开始的,这个位点称为复制起始点。 • 原核生物DNA只有一个复制起始点。 • 真核生物DNA有多个复制起始点。
复制子 replicon • 一个复制起始点控制下复制的一段DNA • 原核生物DNA只有一个复制子 • 真核生物每条染色体上有多个复制子
复制叉 replication fork • 半不连续复制 • 先导链 • 随后链 • 冈崎片断 • 引物 primer
原核生物DNA复制 DNA复制所需要的酶 • 引物酶 primerase • DNA聚合酶 DNA polymerase • DNA连接酶 DNA ligase • 解旋酶 helicase • 拓扑异构酶
DNA复制过程 • 起始 • 延伸 • 终止
真核生物DNA的复制特点 • 细胞周期的特定时期复制 • 多起点复制 • 冈崎片断较原核生物短 • 核小体全保留复制 • 染色体端粒的复制
细胞周期的特定时期复制 • 原核生物在整个细胞生长过程中都可以进行DNA复制 • 真核生物DNA在S期复制
RNA的复制 • 有些病毒不含DNA,以RNA为遗传物质 • RNA在RNA聚合酶作用下先合成“-”链 • “-”链从“+”链模板上释放出来 • “-”链作为模板再合成“+”链
端粒DNA的复制 • 真核生物DNA是线性的 • 线性DNA末端不能复制 • 每复制一次DNA序列就要缩短一节!
端粒酶 telomerase • 端粒酶是一种核糖核蛋白,含有一个RNA分子 • 这个RNA分子就是合成端粒序列的模板 • 在体细胞中,端粒酶是没有活性的,胚胎细胞和肿瘤细胞中有端粒酶活性
第4节 RNA转录与加工 • 转录 transcription:以DNA为模板,在RNA聚合酶的催化下,以ATP、CTP、GTP和UTP为原料,合成RNA的过程。 • 转录是基因表达的中心环节
RNA分类 • mRNA,messenger RNA • tRNA,transfer RNA • rRNA,ribosomal RNA
rRNA的类型 • 原核生物有3种rRNA:5S、16S、23S • 真核生物有4种rRNA:5S、5.8S、18S、28S
RNA合成的一般特点 • 不需要引物 • 原料为rNTP,不是dNTP • 只有一条DNA链用作模板
有关概念 • 模板链 template strand • 非模板链 nontemplate strand • 编码链 coding strand(有意义链) • 非编码链 nocoding strand
RNA聚合酶 • 在E.coli中 • 全酶holoenzyme α2ββ'σ • σ亚基的功能是识别转录起始点 • 核心酶 core enzyme α2ββ' • RNA链的延伸由核心酶催化
启动子 promotor • DNA分子上RNA聚合酶最先结合部位 • Promotor在转录起始点的上游
原核生物启动子由2个元件3个要素组成 • 1、-10序列(Pribnow box) 转录起始点上游-10位置,consensus sequence是TATAPuATG • 2、-35序列(Sextama box) RNA聚合酶所覆盖的区域,共有序列是TTGACA,位于-35位置。 是RNA聚合酶对转录模板的初始识别位点,决定启动子的强度。 • 3、-10区和-35区间的距离 两个元件之间的距离却至关重要;相距17bp时,转录效率最高。
终止子 terminator • 提供转录终止信号的DNA序列 • 内在终止子,不依赖ρ因子 • 依赖ρ因子的终止子
终止子的结构特征 • 发夹结构 • polyU序列 • 真正起终止作用的不是DNA序列,而是转录生成的RNA结构
RNA的合成 • 起始 • 延伸 • 终止和释放
转录和翻译同时进行 • 在原核生物中,转录、翻译以及mRNA的降解通常是同时进行的。 • 因为在原核生物中不存在核膜包裹的细胞核。 • RNA的转录和多肽链的合成都是从5′→3′,只要mRNA的5′端合成后,即可开始翻译。 • 在原核生物中mRNA的寿命一般只有几分钟。 • 往往在3′端mRNA的转录还没有最后结束,5′端mRNA在完成多肽链的合成后,已经开始降解。
真核生物RNA合成的特点1: • 真核生物RNA的转录在细胞核内进行 • 转录完成后需要运送到核外,因此寿命较长
真核生物RNA合成的特点2: • 真核生物一个mRNA分子一般只含有一个基因 • 单顺反子mRNA • 原核生物中称为多顺反子mRNA