1 / 17

Baza danych KSIB

Baza danych KSIB. Krajowym Centrum Roślinnych Zasobów Genowych. w Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie. Krajowe Centrum Roślinnych Zasobów Genowych. Zadania Gromadzenie zasobów genowych Kolekcje hodowców Ekspedycje pozyskujące odmiany lokalne

dyami
Download Presentation

Baza danych KSIB

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Baza danych KSIB Krajowym Centrum Roślinnych Zasobów Genowych w Instytutu Hodowli i Aklimatyzacji Roślin w Radzikowie

  2. Krajowe Centrum Roślinnych Zasobów Genowych • Zadania • Gromadzenie zasobów genowych • Kolekcje hodowców • Ekspedycje pozyskujące odmiany lokalne • Ekspedycje poszukujące dzikich ekotypów • Przechowywanie długoterminowe • Dokumentacja zasobów genowych

  3. Baza KSIB w KCRZG IHARrozwiązania techniczne Koszt postawienia serwera KSIB z oprogramowaniem testowym (90 dniowym) wyniósł 0 zł. Finansowanie z programu KSIB pozwoliło na postawienie nowego serwera z Win2003 SBS Premium Internet GBIF router LAN IHAR Serwer KCRZG Novell Serwer internetowy ihar.edu.pl Linux Serwer KSIB/GBIF Procesor K2/333 Win2000Server gbif.ihar.edu.pl DiGIRProvider FoxPro MS SQL Bazy KCRZG Baza KSIB

  4. Baza KSIB w KCRZGoprogramowanie do obsługi baz danych Global Biodiversity Information Facility Bazy KCRZG Bazy KCRZG Baza pośrednia Bazy KCRZG Baza KSIB DiGIRProvider MS SQL FoxPro Program DiGIRProvider zapewnia łączność pomiędzy bazą KSIB oraz dokonuje odwzorowania pól bazy KSIB do standardu DarwinCore

  5. DateLastModified <- DateLastMo InstitutionCode <- Institutio CollectionCode <- Collection CatalogNumber <- CatalogNum ScientificName <- Scientific BasisOfRecord <- BasisOfRec Kingdom <- Kingdom Phylum <- Phylum Baza KSIB w KCRZGodwzorowanie pól bazy KSIB do standardu DarwinCorew interface DiGIRProvider Standard DarwinCore MS SQL MS SQL akceptuje 10 znakowe nazwy, DiGIR odwzorowuje je na dłuższe nazwy DarwinCore Baza KSIB DiGIRProvider

  6. Baza KSIB w KCRZGodwzorowanie pól bazy KSIB do standardu DarwinCorew interface DiGIRProvider Standard DarwinCore MS SQL Class <– Class Order <- bioOrder Family <- Family Genus <- Genus Species <- Species SubSpecies <- SubSpecies Country <- Country Notes <- Notes Słowo „order” jest słowem zastrzeżonym w MS SQL – można je zastąpić innym, a za pomocą DiGIR’a odwzorować je na nazwę „Order” Baza KSIB DiGIRProvider

  7. Powstanie bazy KSIB Baza KSIB powstała poprzez transfer i przekształcenie części danych z baz KCRZG Zboża, Trawy Bazy KCRZG Baza KSIB Baza KSIB Bazy KCRZG DiGIRProvider

  8. Bobik Bób Burak Chmiel Ekspedycje Groch Gryka Herbarium Kukurydza Len Proso Rzepak Seradela Topinambur Trzciny Trawy Tytoń Warzywa Winogrona Zboża Ziemniak Zioła Bazy danych KCRZG Bazy planowane do transferu w drugim etapie Bazy KCRZG przetransferowane do bazy KSIB Na następnych slajdach opis transferu bazy „Zboża” do bazy KSIB Bazy KCRZG

  9. GRUP, KOL, NUMINT, NUM, PL, NOR, AVA, NAZ, ROD, PRO, LOC, E_LATT, E_LONG, E_ALTIT, GAT, BOT, FORMA_BOT, DAT, KRP, TYP, TYP1, NRD, KRD, DONOR, INR, INR2, HOD, ODA, CH, RDZ, NOTES, OBS, RRO, HER, PRZ, PLL, ROZ, GAP, RRP, HAB, ZMIANA Baza „Zboża” w KCRZGdane paszportowe wykorzystane w KSIB Tablice bazy „Zboża” Lista pól w tablicy zboża.dbf Relacja przez pole BOT gatunki.dbf BOT, KodRdz, GENUS, GATUNEK, SUBSP, VARIETAS, FORMA, OPIS Kolorem pomarańczowym wyróżnione pola przeniesione do bazy KSIB Relacja przez pole KodRdz KodRdz,BotKin, BotPhy, BotCla, BotOrd, BotFam TabBot.dbf Baza KSIB Bazy KCRZG

  10. CatalogNum<- PL Kingdom <- BotKin Phylum <- BotPhy Class <– BotCla bioOrder <- BotOrd Family <- BotFam Genus <- GENUS Species <- GATUNEK Baza „Zboża” w KCRZGdane paszportowe wykorzystane w KSIB Pole AVA zostało użyte do przesłania do bazy KSIB jedynie danych o obiektach dla których są dostępne nasiona Pole PL zawiera unikalny, w ramach banku genów, numer obiektu MS SQL FoxPro Baza KSIB Bazy KCRZG

  11. Baza „Zboża” w KCRZGdane paszportowe wykorzystane w KSIB MS SQL FoxPro Pole NAZ zawierające nazwę obiektu, najczęściej nazwę odmiany, rodu lub nazwę zwyczajową, zostało przypisane polu NOTES, gdyż w standardzie DarwinCore brakowało odpowiedniego pola Subspecies <- SUBSP Notes <- NAZ Country <- KRP DateLastMo <- ZMIANA Institutio <- ‘IHAR‘ BasisOfRec <- ‘G‘ Collection <- ‘POLIHAR‘ Przypisanie wszystkim rekordom wartości „G” oznacza, że wszystkie obiekty są przechowywane w postaci nasion. Na następnych slajdach opis zawartości bazy KSIB Baza KSIB Bazy KCRZG

  12. Baza KSIB w KCRZGzróżnicowanie pod względem botanicznym • Rodzina: Poacea - 40 459 obiektów - w tym rodzaje: (reprezentowane przez mniej niż 10 obiektów) • Agropyron • Alopecurus • Andropogon • Arrhenatherum • Avenula • Boissiera • Calamagrostis • Calamovilfa • Cenchrus • Desmazeria • Digitaria • Echinaria • Echinochloa • Eleusine • Elymus • Elytrigia • Eragrostis • Gastridium • Hystrix • Melica • Monerma • Muehlenbergia • Nardurus • Nardus • Phalaris • Polypogon • Psatyrostachys • Puccinellia • Sorghastrum • Trisetum • Vulpia Baza KSIB

  13. Baza KSIB w KCRZGzróżnicowanie pod względem botanicznym • Rodzina: Poacea - 40 459 obiektów - w tym rodzaje: • Aegilops 314 • Agrostis 53 • Avena 2 337 • Bromus 119 • Cynosurus 28 • Dactylis 5691 • Deschampsia 61 • Festuca 4612 • Hordeum 6 233 (reprezentowane przez więcej niż 10 obiektów) • Koeleria 32 • Lolium 2 574 • Panicum 369 • Phleum 2 460 • Poa 1 639 • Secale 2 324 • Setaria 92 • Triticum 11 454 Na następnych slajdach opis zróżnicowania rodzaju Titicum Baza KSIB

  14. Baza KSIB w KCRZGzróżnicowanie pod względem botanicznym • Rodzaj: Triticum, gatunki: • Triticum aestivum L. 8064 • Triticum aethiopicum Jakubz. 36 • Triticum araraticum Jakubz. 4 • Triticum boeoticum Boiss. 19 • Triticum carthlicum Nevski 1 • Triticum compactum Host 17 • Triticum dicoccoides (Koern.exAh.etGrae)Schweinf 7 • Triticum dicoccon Schrank 1 • Triticum dicoccum (Schrank) Schuebl. 44 • Triticum durum Desf. 1824 • Triticum karamyschevii Nevski 1 • Triticum kiharae Dorof. et Migusch. 1 Zachowywanie nazw gatunkowych w postaci użytej przez dawcę nasion, prowadzi do pojawiania się synonimów. Baza KSIB

  15. Baza KSIB w KCRZGzróżnicowanie pod względem botanicznym • Rodzaj: Triticum, gatunki: • Triticum macha Dekapr. et Menabde 6 • Triticum militinae Zhuk. et Migush. 2 • Triticum monococcum L. 19 • Triticum persicum Vav. 13 • Triticum polonicum L. 13 • Triticum sp. 1262 • Triticum spelta L. 61 • Triticum sphaerococcum Perciv. 5 • Triticum timopheevii (Zhuk.) Zhuk. 19 • Triticum turgidum L. 34 • Triticum vavilovii (Thum.) Jakubz 1 Baza KSIB

  16. Baza KSIB w KCRZGzróżnicowanie pod względem botanicznym • Gatunek: Triticum monococcum L. l. obiektów Lista numerów id. próbki nasion Varietas • HORNEMANNII (Clem.) Koern. 3 • MACEDONICUM Papag. 1 • NIGRICULTUM Flaksb. 1 • VULGARE Koern. 3 • - 10 22861,5007,5040 22860 5005 24067, 24068, 5006 20790,21011,21986,21985,21031,1195,5003,5004,24376, 20751 Każdemu numerowi odpowiada w przechowalni jeden pojemnik z nasionami. Jeśli w wyniku dystrybucji liczba nasion danego obiektu spada poniżej określonego minimum to są one wysiewane na poletkach rozmnożeniowych. Baza KSIB

  17. Dziękują za uwagę Wiesław Podyma Paweł Kolasiński Dorota Nowosielska Pszenica samopsza (Triticum monococcum)

More Related