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第 十 二 章. 蛋白质的生物合成 (翻译) Protein Biosynthesis , Translation. 蛋白质的生物合成 ,即 翻译 ,就是将核酸中由 4 种 核苷酸序列 编码的遗传信息,通过 遗传密码 破译的方式解读为蛋白质一级结构中 20 种 氨基酸的排列顺序 。. 蛋白质合成体系 Protein Biosynthesis System. 第 一 节. 参与蛋白质生物合成的物质包括. 20 种氨基酸 (AA) 作为原料 酶及众多蛋白因子,如 IF 、 eIF ATP 、 GTP 、无机离子. 三种 RNA
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第 十 二 章 蛋白质的生物合成(翻译)Protein Biosynthesis,Translation
蛋白质的生物合成,即翻译,就是将核酸中由 4 种核苷酸序列编码的遗传信息,通过遗传密码破译的方式解读为蛋白质一级结构中20种氨基酸的排列顺序 。
参与蛋白质生物合成的物质包括 • 20种氨基酸(AA)作为原料 • 酶及众多蛋白因子,如IF、eIF • ATP、GTP、无机离子 • 三种RNA • mRNA(messenger RNA, 信使RNA) • rRNA(ribosomal RNA, 核蛋白体RNA) • tRNA(transfer RNA, 转移RNA)
一、翻译模板mRNA及遗传密码 • mRNA是遗传信息的携带者 • 遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子(cistron)。
3 5 PPP 蛋白质 非编码序列 核蛋白体结合位点 编码序列 起始密码子 终止密码子 原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质,为多顺反子(polycistron)。
非编码序列 核蛋白体结合位点 编码序列 起始密码子 终止密码子 真核mRNA只编码一种蛋白质,为单顺反子(single cistron)。 3 mG - 5 PPP 蛋白质
mRNA上存在遗传密码 mRNA分子上从5至3方向,由AUG开始,每3个核苷酸为一组,决定肽链上某一个氨基酸或蛋白质合成的起始、终止信号,称为三联体密码(triplet coden)。 起始密码(initiation coden): AUG 终止密码(termination coden):UAA,UAG,UGA
从mRNA 5端起始密码子AUG到3端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架(open reading frame, ORF)。
遗传密码的特点 1. 连续性(commaless) 编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。
2. 简并性(degeneracy) 遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅有一个密码子外,其余氨基酸有2、3、4个或多至6个三联体为其编码。
3. 通用性(universal) • 蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到人类都通用。 • 已发现少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体。 • 密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。
4. 摆动性(wobble) 转运氨基酸的tRNA的反密码需要通过碱基互补与mRNA上的遗传密码反向配对结合,但反密码与密码间不严格遵守常见的碱基配对规律,称为摆动配对。
摆动配对 U
原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式: P位:肽酰位 (peptidyl site) A位:氨基酰位 (aminoacyl site) E位:排出位 (exit site)
三、tRNA与氨基酸的活化 氨基酸臂 反密码环
氨基酰-tRNA合成酶 氨基酸 + tRNA 氨基酰- tRNA ATP AMP+PPi • 氨基酸的活化 • (一)氨基酰-tRNA合成酶 • (aminoacyl-tRNA synthetase)
第一步反应 氨基酸 +ATP-E —→ 氨基酰-AMP-E+ AMP + PPi
第二步反应 氨基酰-AMP-E + tRNA ↓ 氨基酰-tRNA + AMP + E
在此反应中,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酸tRNA,从而使活化氨基酸能够被搬运至核蛋白体上参与多肽链的合成。在此反应中,特异的tRNA3’端CCA上的2’或3’位自由羟基与相应的活化氨基酸以酯键相连接,形成氨基酸tRNA,从而使活化氨基酸能够被搬运至核蛋白体上参与多肽链的合成。 • 氨基酸tRNA的合成,可使氨基酸①活化;②搬运;③定位。
氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性,这是保证tRNA能够携带正确的氨基酸对号入座的必要条件。。氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性,这是保证tRNA能够携带正确的氨基酸对号入座的必要条件。。 • 氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性。 • 氨基酰-tRNA的表示方法: Ala-tRNAAla Ser-tRNASer Met-tRNAMet
(二)起始肽链合成的氨基酰-tRNA 真核生物: Met-tRNAiMet 原核生物: fMet-tRNAifMet 原核生物起始密码子需要在Met-tRNAmetf上进行甲酰化,而真核生物不需要。
蛋白质生物合成过程The Process of Protein Biosynthesis 第 二 节
翻译的起始(initiation) • 翻译的延长(elongation) • 翻译的终止(termination ) 翻译过程从阅读框架的5´-AUG开始,按mRNA模板三联体密码的顺序延长肽链,直至终止密码出现。 整个翻译过程可分为 :
一、肽链合成起始 指mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核蛋白体结合而形成翻译起始复合物(translational initiation complex)。 多种蛋白质因子参与这个过程,称为起始因子(initiation factor,IF)
(一)原核生物翻译起始复合物形成 • 核蛋白体大小亚基分离; • mRNA在小亚基定位结合; • 起始氨基酰-tRNA的结合; • 核蛋白体大亚基结合。
1. 核蛋白体大小亚基分离 IF-1 IF-3
5' 3' A U G 2. mRNA在小亚基定位结合 IF-1 IF-3
S-D序列:在原核生物mRNA的起始密码前8~13核苷酸的位置,有一非常保守的序列,与核糖体小亚基上的16S-rRNA结合,引导mRNA进入核糖体,这样的序列称为S-D序列。S-D序列:在原核生物mRNA的起始密码前8~13核苷酸的位置,有一非常保守的序列,与核糖体小亚基上的16S-rRNA结合,引导mRNA进入核糖体,这样的序列称为S-D序列。
IF-2 GTP 5' 3' A U G 3、起始氨基酰tRNA( fMet-tRNAimet )结合到小亚基 IF-1 IF-3
5' 3' A U G 4. 核蛋白体大亚基结合 IF-2 GTP Pi GDP IF-1 IF-3
IF-2 GTP 5' 3' A U G IF-2 Pi -GTP GDP IF-3 IF-1
(二)真核生物翻译起始复合物形成 • 核蛋白体大小亚基分离; • 起始氨基酰-tRNA结合; • mRNA在核蛋白体小亚基就位; • 核蛋白体大亚基结合。
40S elF-3 40S mRNA ② ATP met elF4E, elF4G, elF4A, elF4B,PAB ③ Met Met-tRNAiMet-elF-2-GTP ADP+Pi 60S Met elF-5 各种elF释放 eIF-2B、eIF-3、eIF-6 ④ ① GDP+Pi 60S Met 真核生物翻译起始复合物形成过程
二、肽链合成延长 指根据mRNA密码序列的指导,依次添加氨基酸从N端向C端延伸肽链,直到合成终止的过程。 • 肽链延长在核蛋白体上连续性循环式进行,又称为核蛋白体循环(ribosomal cycle),每次循环增加一个氨基酸,包括以下三步: • 进位(entrance) • 成肽(peptide bond formation) • 转位(translocation)
延伸过程所需蛋白因子称为延长因子(elongation factor, EF) 原核生物:EF-T (EF-Tu, EF-Ts) EF-G 真核生物:EF-1 、EF-2
又称注册(registration) (一)进位 指根据mRNA下一组遗传密码指导,使相应氨基酰-tRNA进入核蛋白体A位。
延长因子EF-T催化进位(原核生物) EF-Tu促进氨基酰-tRNA进入A位 (活性) Tu有两种形式: Tu-GTP 和 Tu-GDP (失活) Ts为调节亚基
5' 3' A U G GTP Tu Ts Ts Tu GDP GTP
(二)成肽 是由转肽酶(transpeptidase)催化的肽键形成过程。