1 / 12

Вход на ферму ЛИТ с машин вне кластера: ssh -2a <user>@lxpub01.jinr.ru

Вход на ферму ЛИТ с машин вне кластера: ssh -2a <user>@lxpub01.jinr.ru SW/ATLAS lxpub[xx].jinr.ru: /afs/.jinr.ru/atlas: dist: 10.0.4, 12.0.6 12.0.31 12.5.0 13.0.30 /opt/exp_soft/atlas: software : 11.0.42 11.0.5

espen
Download Presentation

Вход на ферму ЛИТ с машин вне кластера: ssh -2a <user>@lxpub01.jinr.ru

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Вход на ферму ЛИТ с машин вне кластера: ssh -2a <user>@lxpub01.jinr.ru SW/ATLAS lxpub[xx].jinr.ru: /afs/.jinr.ru/atlas: dist: 10.0.4, 12.0.6 12.0.31 12.5.0 13.0.30 /opt/exp_soft/atlas: software : 11.0.42 11.0.5 12.0.31 12.0.6 12.0.7 12.0.8 13.0.20 13.0.30 13.0.40

  2. Доступ в ATLAS CVS. export CVSROOT=:kserver:atlas-sw.cern.ch:/atlascvs klog -cell cern.ch -principal username -tmp

  3. Компиляция пакета UserAnalysis Конфигурационный файл "requirements": #-------------Athena requerements file --------------------------- #-------------------------------------------------------------------------------------- set CMTSITE STANDALONE set SITEROOT /afs/.jinr.ru/atlas/12.0.x macro ATLAS_DIST_AREA /afs/.jinr.ru/atlas/12.0.x macro ATLAS_TEST_AREA /afs/jinr.ru/user/g/grom/testarea apply_tag projectArea macro SITE_PROJECT_AREA ${SITEROOT} macro EXTERNAL_PROJECT_AREA ${SITEROOT} apply_tag setup apply_tag simpleTest use AtlasLogin AtlasLogin-* $(ATLAS_DIST_AREA) set CMTCONFIG i686-slc3-gcc323-opt set DBRELEASE_INSTALLED 3.1.1 #--------------------------------------------------------------------------------

  4. ~/testarea >source afs/.jinr.ru/atlas/12.0.x/CMT/v1r19/mgr/setup.sh (requerements, CMT готов к работе) > cmt config; ls Makefile cleanup.csh cleanup.sh requirements setup.csh setup.sh (setup.sh файл конфигурации ATHENA) > . setup.sh -tag=12.0.6 > export CVSROOT=:kserver:atlas-sw.cern.ch:/atlascvs > cd 12.0.6/ > klog -cell cern.ch -principal username -tmp > ~/testarea >source afs/.jinr.ru/atlas/12.0.x/CMT/v1r19/mgr/setup.sh (requerements, CMT готов к работе) > cmt config; ls Makefile cleanup.csh cleanup.sh requirements setup.csh setup.sh (setup.sh файл конфигурации ATHENA) > . setup.sh -tag=12.0.6 > export CVSROOT=:kserver:atlas-sw.cern.ch:/atlascvs > cd 12.0.6/ > klog -cell cern.ch -principal username -tmp > cmt co -r UserAnalysis-00-09-10 /Physics/AnalysisCommon/UserAnalysis > mkdir -p $HOME/tesrarea; cd testarea ~/testarea >source afs/.jinr.ru/atlas/12.0.x/CMT/v1r19/mgr/setup.sh (requerements, CMT готов к работе) > cmt config; ls Makefile cleanup.csh cleanup.sh requirements setup.csh setup.sh (setup.sh файл конфигурации ATHENA) > . setup.sh -tag=12.0.6 > export CVSROOT=:kserver:atlas-sw.cern.ch:/atlascvs > cd 12.0.6/ > klog -cell cern.ch -principal username -tmp

  5. # =====working on package UserAnalysis version UserAnalysis -00-09-10 path PhysicsAnalysis/AnalysisCommon in /afs/jinr.ru/user/g/grom/testarea/12.0.6/PhysicsAnalysis/AnalysisCommon/ UserAnalysis # get top files ... ... cvs update: [13:40:57] obtained lock in /atlascvs/CVSROOT cvs update: Updating . Creating setup scripts. Creating cleanup scripts.

  6. Работа с SW ATLAS. Запуск ATHENA интерактивный. ~/testarea/12.0.6 > cd PhysicsAnalysis/AnalysisCommon/UserAnalysis/cmt > make > which athena alias athena='athena.py' /afs/.jinr.ru/atlas/12.0.x/AtlasCore/2.0.6/InstallArea/share/bin/ athena.py > cd ../run > cp ../share/AnalysisSkeleton_topOptions.py . > athena UserAnalysis/AnalysisSkeleton_topOptions.py

  7. Запуск ATHENA в PBS edit myjob chmod +x myjob ------------------------------------------------------------------------------------ #!/bin/bash #PBS -m b #PBS -m e source ~/tesrarea/setup.sh -tag=12.0.6 cd ~/testarea/12.0.6/PhysicsAnalysis/AnalysisCommon/UserAnalysis/run athena.py AnalysisSkeleton_topOptions.py ------------------------------------------------------------------------------------ qsub myjob qstat -a

  8. Ganga /afs/.jinr.ru/atlas/ganga 4.3.9 4.4.1 Работаем на UI (lxpub04.jinr.ru ) иначе создаем grid environment : source /opt/ui/external/etc/profile.d/grid-env.sh export LD_LIBRIRY_PATH=$QTDIR/lib:$LD_LIBRARY_PATH export PATH=/afs/.jinr.ru/atlas/ganga/install/4.4.1/bin ganga -g vi $HOME/.gangarc [Configuration]: RUNTIME_PATH = GangaAtlas [LCG]: VirtualOrganisation = atlas [Athena]: /afs/.jinr.ru/atlas ganga --gui

  9. Данные для ATLAS dCache (Server lxfs07.jinr.ru) Для пользоватлей на ферме ЛИТ: lxpub[XX].jinr.ru: /pnfs/jinr.ru/atlas /pnfs/jinr.ru/user/x/x_user Доступные команды : ls,pwd,find,rm,rmdir,cd,mkdir,ln,chown,chmod Недоступные команды : cp,mv,cat,more,less,grep,head, tail,wc,od,file

  10. Доступ с персонального компьютера : PNFS смонтирована mkdir -p /pnfs/jinr.ru mount -o intr,rw,noac,hard lxfs07.jinr.ru:/pnfs /pnfs/jinr.ru /pnfs/jinr.ru/atlas /pnfs/jinr.ru/user/x/x_user После монтирования работают команды LINUX ls, mv, rm. Доступ по dccp (Disk Cache Copy Program) dccp $HOME/file /pnfs/jinr.ru/user/x/x_user/file PNFS не смонтирована. Доступ по url-dcap dccp dcap://lxfs07.jinr.ru:22125/pnf/jinr.ru/data/atlas/file $HOME/data/.

  11. GRID : Лучше всего работать в формате GRID: использовать команды SRM и gFTP : gsi-ftp, srmcp globus-url-copy file:/tmp/test \ gsiftp://lxfs07.jinr.ru:2811/pnfs/jinr.ru/data/atlas/file2 srmcp srm://lxfs07.jinr.ru:8443/pnfs/jinr.ru/data/dteam/testfile2 \ file:////tmp/backtest *** url-dcap lxfs07.jinr.ru:22125 gsiftp lxfs07.jinr.ru:22128 srm lxfs07.jinr.ru:22127

More Related