80 likes | 194 Views
Desmanthus fruticosus 109/92. Govindarajulu et al.— American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. 2011. – Data Supplement S2 –page 1. Schleinitzia novoguineensis 57/84. 97. L. cuspidata 89/92.
E N D
Desmanthus fruticosus 109/92 Govindarajulu et al.—American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. 2011. – Data Supplement S2 –page 1 Schleinitzia novoguineensis 57/84 97 L. cuspidata 89/92 Govindarajulu, Rajanikanth, Colin E. Hughes, and C. Donovan Bailey. 2011. Node-specific branching and heterochronic changes underlie population-level differences in Mimulus guttatus (Phrymaceae) shoot architecture. American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. Appendix S2. Strict consensus trees derived from parsimony analysis of each data partition. Each gene tree includes bootstrap support values derived from 500 bootstrap replicates. (A) Simultaneous analysis of all three regions representing the cpDNA locus. (B) 23L. (C) 28. (D) A9. (E) PA1213. (F) A2. (G) A4A5. (H) nrDNA ITS. L. cuspidata 88/92 L. matudae 49/87 27 L. esculenta 47/87 L. matudae 2153 87 55 L. esculenta 48/87/01 L. esculenta 216 L. pueblana 125/92 58 7 65 L. pueblana 2140 100 Appendix S2A L. pueblana 2089 L. pulverulenta 83/87/02 97 L. pulverulenta 1611 58 L. pulverulenta 1593 L. pulverulenta 84/87 95 L. retusa 23/86 99 95 L. retusa 23/09/02 97 L. retusa 23/86/06 L. greggii 82/87 99 100 L. greggii 20/86/02 61 L. greggii 21/86/07 L. greggii 19/86/10 99 L. trichodes 61/88 L. trichodes 2/86/07 L. macrophyllamacrophylla 55/88 86 45 L. macrophyllaistmensis 47/85 L. macrophyllamacrophylla 2076 50 74 L. lempirana 5/91 L. lempirana 6/91/03 76 99 44 L. multicapitula 86/87 37 L. salvadorensis 7/91 L. multicapitula 81/87 40 40 L. salvadorensis 17/86 L. salvadorensis 34/88 L. magnifica 19/84 L. lanceolatalanceolata 46/85 14 L. shannonii 135/92 L. collinsiicollinsii 52/88 L. lanceolatalanceolata 913 L. shannonii 53/87 L. trichandra 128/92 L. trichandra 137/92 L. collinsiicollinsii 51/88 L. lanceolatalanceolata 90/92 L. collinsiizacapana 56/88 L. trichandra 53/88 29 L. magnifica 58/88/09 L. lanceolatalanceolata 134/92 L. lanceolatalanceolata 44/85 L. shannonii 141/92 L. collinsiizacapana 18/84 L. lanceolatalanceolata 43/85 L. shannonii 1/91 L. trichandra 2121 Concatenated cpDNA analysis. L= 387, CI=0.50, RI=0.79. L. collinsiizacapana 57/88/08 65 L. trichandra 140/92 L. trichandra 54/88 44 L. lanceolatasousae 50/87 L. lanceolata sousae 51/87
L. cuspidata 89/92 L. cuspidata 88/92 6 Govindarajulu et al.—American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. 2011. – Data Supplement S2 –page 2 L. cuspidata 88/92 1 89 L. cuspidata 88/92 11 L. cuspidata 88/92 100 L. retusa 23/86 100 97 L. retusa 23/90 02 Appendix S2B L. greggii 82/87 100 L. greggii 20/86 02 99 66 L. greggii 19/86 10 L. greggii 21/86 07 L. pulverulenta 1593 90 L. pulverulenta 1611 1 L. pulverulenta 1611 2 3 4 100 L. pulverulenta 1866 2 L. pulverulenta 1866 1 4 65 L. pulverulenta 83/87/02 L. pulverulenta 84/87/02 L. esculenta 47/87 1 7 96 L. esculenta 47/87 8 L. esculenta 216 94 100 L. esculenta 48/87/01 L. matudae 49/87 40 L. matudae 2153 31 L. pueblana 2140 23b 58 L. pueblana 2089 71 L. pueblana 125 92 L. pueblana 2140 23a d L. trichandra 140/92 27 L. lanceolata sousae 51/87 2 3 L. lanceolata sousae 51/87 1 83 L. lanceolata lanceolata 43/85 5 73 L. lanceolata lanceolata 43/85 2 L. lanceolata lanceolata 43/85 3 L. trichandra 53/88 100 61 L. lempirana 5/91 L. lempirana 5/91 1 60 L. lempirana 5/91 6 L. magnifica 58/88/09 52 L. shannonii 135/92 4 L. lempirana 6/91 03 4 L. shannonii 1 91 72 L. shannonii 141/92 85 L. shannonii 53/87 98 L. shannonii 135/92 3 L. shannonii 135/92 2 93 L. magnifica 19/84 10 2 L. magnifica 19/84 3 6 27 L. collinsii zacapana 18/84 1 2 3 21 L. collinsii zacapana 57/88/08 79 L. collinsii zacapana 56/88 3 100 L. collinsii zacapana 56/88 1 1 L. collinsi zacapana 56/88 05 L. trichodes 2/86 07 L. trichodes 61/88 7 100 67 L. trichodes 61/88 3 5 1 L. trichodes 61/88 6 L. salvadorensis 34/88 1 2 4 66 1 L. salvadorensis 7/91 77 L. salvadorensis 7/91 2 66 L. salvadorensis 7/91 5 8 L. salvadorensis 17/86 2 L. lanceolata lanceolata 134/92 4 6 7 98 L. multicapitula 86/87 64 L. multicapitula 81/87 6 L. multicapitula 81/87 1 89 67 L. multicapitula 81/87 12 2 L. multicapitula 81/87 7 L. macrophylla macrophylla 1179 70 93 L. macrophylla istemensis 47/85/07 L. macrophylla macrophylla 2076 0 L. lanceolata lanceolata 90/92 1 2 3 L. lanceolata lanceolata 46/85 L. lanceolata lanceolata 44/85 0 L. trichandra 137/92 48 95 L. trichandra 128/92 3 28 23L. L=496, CI=0.54, RI=0.84. L. trichandra 128/92 6 24 L. trichandra 54/88 18 L. trichandra 2121 100 L. collinsii collinsii 51/88 1 2 3 L. collinsii collinsii 52/88 37 95 L. lanceolata lanceolata 913 1 L. lanceolata lanceolata 913 5 69 L. lanceolata sousae 872 31 L. lanceolata lanceolata 134/92 1 2 3 65 48 L. lanceolata lanceolata 913 3 L. lanceolata lanceolata 913 4
L. cuspidata 89/92 Govindarajulu et al.—American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. 2011. – Data Supplement S2 –page 3 L. cuspidata 88/92 L. pulverulenta 1593 L. pulverulenta 83/87/02 97 L. pulverulenta 84/87/02 Appendix S2C 78 L. pulverulenta 1611 45 L. pulverulenta 1866 L. retusa 23/86 92 78 L. retusa 23/09/02 93 L. retusa 23/86/06 L. greggii 82/87 58 L. greggii 20/86/02 74 L. greggii 21/86/07 100 L. greggii 19/86/10 L. matudae 2153 1 5 L. matudae 2153 4 85 L. matudae 49/87 2 L. matudae 49/87 4 L. matudae 49/87 5 L. matudae 49/87 6 93 88 L. pueblana 2140 51 L. pueblana 2140 83 L. pueblana 125/92 39 L. pueblana 2089 L. esculenta 47/87 99 37 L. esculenta 216 4 5 40 L. esculenta 216 2 L. esculenta 216 1 L. esculenta 48/87/01 L. trichandra 53/88 L. trichandra 140/92 79 L. trichandra 2121 L. trichandra 128/92 L. multicapitula 81/87 L. shannonii 53/87 L. magnifica 19/84 L. shannonii 141/92 L. lanceolata 134/92 L. shannonii 135/92 L. shannonii 1 91 38 45 L. lanceolata lanceolata 43/85 L. lanceolata sousae 50/87 10 L. lanceolata 51/87 99 L. lanceolata 913 40 L. trichandra 54/88 5 L. trichandra 54/88 1 14 L. multicapitula 86 87 22 L. lempirana 6/91/03 L. trichodes 2/86/07 L. salvadorensis 7/91 L. collinsii collinsii 51/88 L. trichandra 137/92 L. collinsii zacapana 57/88 L. macrophylla 2076 L. trichodes 61/88 L. lempirana 5/91 1 8 9 35 L. salvadorensis 17/86 28. L=2814, CI=0.44, RI=0.79. L. collinsii collinsii 52/88 L. collinsii zacapana 18 84 L. collinsii zacapana 56/88 L. macrophylla istemensis 47/85/07 L. macrophylla macrophylla 55/88 L. lempirana 5/91 4 L. lanceolata lanceolata 44/85 62 L. lanceolata 90/92 L. lanceolata lanceolata 46/85
L. cuspidata 88/92 Govindarajulu et al.—American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. 2011. – Data Supplement S2 –page 4 100 69 100 100 71 52 100 L. retusa 23/86/06 96 L. lempirana 6/91/03 45 100 48 90 46 56 48 63 29 97 56 65 60 100 41 74 43 87 L. greggii 19/86/10 61 100 99 62 32 L. retusa 23/09/02 L. greggii 21/86/07 100 30 8 100 99 62 59 <1 28 59 2 12 <1 40 28 99 32 68 13 82 77 87 61 L. esculenta 216 L. collinsii zacapana 18/84 2 100 L. shannonii 141/92 2 3 4 L. trichandra 54/88 1 2 4 5 43 91 Appendix S2D 64 L. shannonii 135/92 1 2 5 6 42 L. magnifica 58/88 L. cuspidata 89/92 98 L. trichandra 128/92 1 95 L. trichandra 128/92 2 5 L. lanceolata lanceolata 43/85 100 L. esculenta 47/87 L. pulverulenta 84/87 L. collinsii collinsii 52/88 L. greggii 82/87 100 L. pulverulenta 1593 L. retusa 23/86 L. trichandra 137/92 100 L. collinsii zacapana 18/84 6 50 L. pulverulenta 83/87/02 2 98 L. pulverulenta 83/87/02 1 L. greggii 20/86/02 L. lanceolata lanceolata 46/85/01 L. macrophylla macrophylla 2076 3 L. esculenta 48/87 L. trichandra 140/92 L. collinsii zacapana 56/88 2 L. salvadorensis 7/91 1 2 5 6 L. lanceolata lanceolata 134/92 2 3 L. lempirana 5/91 L. salvadorensis 34/88 4 L. salvadorensis 34/88 1 L. macrophylla macrophylla 2076 1 5 L. salvadorensis 34/88 5 L. matudae 49/87 L. lanceolata lanceolata 44/85 1 3 L. salvadorensis 17/86 L. trichandra 53/88 L. collinsii zacapana 56/88 3 6 L. lanceolata lanceolata 90/92 4 L. lanceolata sousae 50/87 L. lanceolata sousae 51/87 2 L. multicapitula 81 87 03 L. multicapitula 81 87 02 L. collinsii collinsii 51/88/05 L. trichodes 2/86/07 L. magnifica 19/84 L. trichodes 61/88 4 L. shannonii 141/92 5 L. pulverulenta 1866 2 3 L. pulverulenta 83/87/02 3 L. pueblana 2140 L. pulverulenta 1611 3 7 L. pueblana 2089 L. matudae 2153 L. pueblana 125/92 L. multicapitula 81 87 01 A9. L=853, CI=0.64, RI=0.88. L. multicapitula 81/87 8 L. lanceolata sousae 51/87 1 3 L. trichandra 2121 1 2 3 L. lanceolata lanceolata 44/85 2 L. collinsii zacapana 57/88 L. macrophylla macrophylla 55/88/09 L. shannonii 53/87 L. macrophylla istemensis 47/85/07 L. shannonii 1/91
Desmanthus fruticosus 109/92 13 Govindarajulu et al.—American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. 2011. – Data Supplement S2 –page 5 Desmanthus fruticosus 109/92 8 Desmanthus fruticosus 109/92 4 79 Desmanthus fruticosus 109/92 11 Desmanthus fruticosus 109/92 12 98 L. cuspidata 89/92 Appendix S2E L. cuspidata 88/92 L. pulverulenta 1611 2 L. pulverulenta 1593 100 L. pulverulenta 1611 1 100 L. pulverulenta 84/87 L. pulverulenta 83/87/02 L. pulverulenta 1611 3 L. esculenta 216 4 L. esculenta 216 1 100 L. esculenta 216 3 L. esculenta 216 2 94 63 L. esculenta 47/87 L. esculenta 48/87 L. retusa 23/86 65 91 L. retusa 23/09/02 L. retusa 23/86/06 59 L. greggii 20/86/02 100 L. greggii 19/86/10 62 L. greggii 82/87 L. greggii 21/86/07 L. pueblana 2089 3 83 59 L. pueblana 2089 2 L. pueblana 2089 1 95 100 L. matudae 2153 1 4 L. matudae 2153 2 72 L. matudae 49/87 75 L. esculenta 2114 45 L. esculenta 2143 L. pueblana 2140 1 2 57 L. pueblana 125/92 2 54 L. pueblana 2140 6 100 L. pueblana 125/92 1 3 L. shannonii 135/92 L. multicapitula 81/87 L. salvadorensis 7/91 L. shanonii 53/87 L. lempirana 5/91 L. multicapitula 86/87 L. trichodes 61/88 L. collinsi zacapana 18/84 3 L. lanceolata lanceolata 90/92 L. lanceolata lanceolata 44/85 L. lanceolata lanceolata 46/85 L. collinsii zacapana 56/88 L. shannonii 141/92 L. shannonii 1 91 5 L. shannonii 1 91 4 L. shannonii 1 91 7 L. lanceolata lanceolata 43/85 1 2 L. lempirana 6/91/03 L. trichodes 2/86/07 L. collinsii zacapana 57/88/08 99 25 L. collinsii collinsii 51/88 L. magnifica 19/84 4 35 L. collinsii collinsii 52/88 2 L. collinsii zacapana 18/84 2 77 L. salvadorensis 34/88 L. salvadorensis 17/86 81 L. magnifica 19/84 5 L. magnifica 58/88/09 L. macrophylla istmensis 47/85/07 58 92 L. macrophylla macrophylla 55/88 L. macrophylla macrophylla 2076 L. trichandra 128/92 L. trichandra 137/92 71 L. trichandra 54/88 PA1213. L=535, CI=0.53, RI=0.84. L. trichandra 2121 L. trichandra 53/88 L. trichandra 140/92 84 L. lanceolata lanceolata 134/92 1 L. lanceolata lanceolata 134/92 2 90 L. lanceolata sousae 51/87 4 5 L. lanceolata sousae 50/87 62 L. lanceolata sousae 51/87 1 L. lanceolata lanceolata 2180 54 L. lanceolata lanceolata 913 L. lanceolata lanceolata 34/92 3 L. lanceolata lanceolata 43/85 3
L. cuspidata 89/92 Govindarajulu et al.—American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. 2011. – Data Supplement S2 –page 6 L. cuspidata 88/92 L. retusa 23/86 L. greggii 82/87 Appendix S2F L. greggii 19/86 L. greggii 19/86/10 L. greggii 21/86/07 L. retusa 23/09/02 100 L. greggii 20/86/02 L. retusa 23/86/06 L. pulverulenta 1593 95 80 L. pulverulenta 83/87 L. pulverulenta 84/87/02 L. esculenta 47/87 L. pueblana 2140 97 L. matudae 49/87 84 L. matudae 2153 L. pueblana 125/92 L. pueblana 2089 L. esculenta 216 L. esculenta 48/87/01 L. trichodes 61/88 L. trichandra 4/91 L. shannonii 135/92 L. shannonii 141/92 L. trichodes 2/86/07 92 L. collinsii collinsii 51/88 L. collinsii collinsii 52/88 68 90 L. lempirana 5/91 L. lempirana 6/91/03 55 L. lanceolata lanceolata 134/92 L. macrophylla istmensis 47/85/07 L. collinsii zacapana 18/84 79 L. collinsii zacapana 56/88 L. collinsii zacapana 57/88/08 L. salvadorensis 34/88 100 L. multicapitula 86/87 94 L. multicapitula 81/87 94 L. magnifica 19/84 55 L. magnifica 58/88/09 83 L. shannonii 53/87 L. shannonii 1/91 62 L. lanceolata sousae 51/87 96 L. lanceolata lanceolata 913 64 L. lanceolata lanceolata 43/85 L. lanceolata sousae 50/87 L. lanceolata lanceolata 90/92 L. lanceolata lanceolata 44/85 75 L. lanceolata lanceolata 46/85 A2. L=237, CI=0.50, RI=0.79. 54 L. macrophylla macrophylla 55/88 L. macrophylla macrophylla 2076 L. trichandra 137/92 L. trichandra 54/88 46 L. trichandra 53/88 L. trichandra 140/92 61 L. trichandra 128/92 L. trichandra 2121
L. cuspidata 1580 Govindarajulu et al.—American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. 2011. – Data Supplement S2 –page 7 L. retusa 23/86 L. greggii 19/86 L. confertiflora adenotheloidea 1730 L. confertiflora adenotheloidea 1152 3 79 L. cuspidata 88/92 Appendix S2G L. greggii 82/87 100 L. cuspidata 1580 3 5ori L. cuspidata 89/92 63 L. esculenta 216 4 L. esculenta 47/87 2 100 L. esculenta 47/87 1 61 L. esculenta 47/87 4 100 L. esculenta 48/87/01 70 L. esculenta 48 87 04 05 L. esculenta 48/87 1 100 L. esculenta 48/87 2 3 6 65 L. esculenta 47/87 1 2ori 73 L. esculenta 47/87 3 L. esculenta 216 3 100 L. pueblana 2089 2 83 L. pueblana 2089 1 2ori 94 L. pueblana 2089 3 86 L. pueblana 125/92 L. pueblana 2140 L. pulverulenta 83/87/02 1 75 L. pulverulenta 1593 1 100 L. pulverulenta 83/87/02 2 3 L. pulverulenta 1593 2 L. pulverulenta 83 87 02 02 84 L. pulverulenta 83/87 6 76 L. pulverulenta 83/87 5 L. pulverulenta 1611 L. matudae 49/87 100 58 L. matudae 49 87 pl 3 ori 80 L. matudae 49/87 2 100 L. matudae 49/87 5 L. matudae 2153 82 61 L. matudae 49/87 1 L. matudae 49/87 4 L. matudae 2153 99 L. pulverulenta 84/87/02 4 L. pulverulenta 84/87/02 5 L. trichodes 61/88 100 89 L. collinsii zacapana 18/84 L. collinsii zacapana 56/88 L. multicapitula 86/87 L. multicapitula 81/87 98 L. shannoni 53/87 L. lanceolata lanceolata 44/85 L. shannonii 1 91 L. salvadorensis 17/86 90 L. lanceolata lanceolata 46/85 17 L. lanceolata lanceolata 90/92 36 41 L. lanceolata sousae 51/87 L. lanceolata sousae 50/87 L. shannoni 141/92 L. salvadorensis 34/88 L. collinsii collinsii 51/88 73 L. lanceolata lanceolata 913 L. magnifica 19/84 55 L. lanceolata lanceolata 134/92 L. trichandra 137/92 L. salvadorensis 7 91 L. lempirana 5 91 A4A5. L=787, CI=0.56, RI=.090. L. shannoni 135/92 39 L. magnifica 58/88/09 L. trichandra 53/88 L. lanceolata lanceolata 43/85 L. trichandra 140/92 58 L. collinsii collinsii 52/88 L. collinsii zacapana 57/88 L. macrophylla macrophylla 2076 84 L. trichandra 2121 L. macrophylla macrophylla 55/88 65 L. trichandra 128/92 L. macrophylla istemensis 47/85 07
Desmanthus fruticosus 109/92 Govindarajulu et al.—American Journal of Botany 98(12): 2049-2063. 2011. – Data Supplement S2 –page 8 Schleinitzia novoguineensis 57/84 100 L. cuspidata 89/92 L. cuspidata 88/92 L. esculenta 47/87 1 100 Appendix S2H L. pueblana 125/92 1 L. matudae 49/87 L. retusa 23/86 100 L. pulverulenta 1593 3a L. pulverulenta 84/87 06 L. greggii 82/97 100 L. greggii 21/86 07 100 61 30 L. greggii 19/86 10 L. greggii 20/86 02 L. pulverulenta 22/86 2b 100 L. pulverulenta 83/87/02 99 L. pulverulenta 22/86 2a L. pulverulenta 1611 1a 72 L. pulverulenta 1866 5a L. lanceolata lanceolata 43/85 9LF 100 L. lanceolata lanceolata 134/92 10LF 82 L. lanceolata lanceolata 134/92 14LF 100 99 L. lanceolata lanceolata 134/92 12LR 99 L. lanceolata lanceolata 43/85 Lar L. lanceolata lanceolata 134/92 lar L. salvadorensis 34/88 20 L. trichandra 140/92 37 L. lanceolata lanceolata 43/85 small 100 100 L. lanceolata lanceolata 43/85 01 L. lanceolata lanceolata 43/85 02 3 L. lanceolata lanceolata 134/92 02 82 L. lanceolata sousae 51/87 67 L. lanceolata lanceolata 134/92 03 92 37 L. lanceolata lanceolata 134/92 small 12 L. lanceolata lanceolata 134/92 01 100 L. collinsii collinsii 51/88/05 1 2 L. collinsii collinsii 51/88/05 3 100 L. trichandra 54/88 19 24 L. salvadorensis 17/86 100 L. magnifica 58/88 L. lempirana 6/91 03 12 100 L. esculenta 216 19 L. esculenta 48/87/01 3 32 L. matudae 2153 100 L. esculenta 48/87/01 1 2 84 88 L. pueblana 2089 L. pueblana 2089 1 3 L. lempirana 5/91 02 L. trichodes 61/88 01 14 76 L. lanceolata lanceolata 913 6a L. lanceolata sousae 50/87 01 L. collinsii collinsii 52/88 L. collinsii zacapana 57/88 L. macrophylla istmensis 47/85 02 42 L. macrophylla macrophylla 55/88 L. multicapitula 81/87 02 L. salvadorensis 7/91 05 L. shannonii 1/91 03 L. shannonii 53/87 01 L. trichandra 53/88 04 12 L. trichandra 128/92 03 L. trichandra 137/92 01 L. shannonii 135/92 02 ITS. L=895, CI=0.50, RI=0.79. 62 L. shannonii 141/92 05 L. shannonii 26/84 4a L. lanceolata lanceolata 44/85 04 29 L. lanceolata lanceolata 90/92 05 L. lanceolata lanceolata 46/85 01 L. collinsii zacapana 18/84 97 L. collinsii zacapana 56/88 L. magnifica 19/84 01 L. magnifica 58/88 02