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Denise Raddatz Mota

Denise Raddatz Mota. Genome-Wide Analysis of the Core DNA Replication Machinery in the Higher Plants Arabidopsis and Rice Randall W. Shultz2, Vinaya M. Tatineni , Linda Hanley Bowdoin *, and William F. Thompson. Arabidopsis thaliana. Arroz ( Oryza sativa ).

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Presentation Transcript

  1. Denise Raddatz Mota Genome-WideAnalysis of theCore DNA Replication Machinery in theHigherPlantsArabidopsis and Rice Randall W. Shultz2, Vinaya M. Tatineni, Linda Hanley Bowdoin*, and William F. Thompson Arabidopsisthaliana Arroz (Oryza sativa)

  2. Replicación del ADN en Eucariontes • Numerosos complejos de multiproteínas. - Iniciación - Elongación - Maduración de los fragmentos de Okasaki

  3. ¿Qué se sabe sobre la Maquinaria de la Replicación del ADN? > Levaduras Modelo Animal Plantas • Combinación de información experimental publicada con análisis bioinformáticos de la secuencia genómica en Arabidopsis y arroz.

  4. Estrategia • Ensamblaje de base de datos a partir de las proteínas (maquinaria de replicación del ADN) de levadura y animal. • Se obtuvo la base de datos del genoma traducido de Arabidopsis con el algoritmo BLAST. • Las secuencias de Arabidopsis se utilizaron para encontrar homólogos en arroz. • Para el análisis filogenético de las proteínas se utilizó el programa ClustalW. • Para el alineamiento de las múltiples secuencias de complejos de proteína se utilizó el algoritmo ClustalW.

  5. Maquinaria de la Replicación del ADN en Eucariontes

  6. Pre-iniciación Complejo de pre-replicación (pre-RC): ORC1-6 + CDC6 + MCM2-7

  7. Iniciación Supercomplejo con función de helicasa: GINS + MCM2-7 +CDC45

  8. Elongación GINS + MCM2-7 +CDC4 5 + Pol E

  9. Maduración Fragmentos de Okasaki: Pol D + FEN1 + LIG 1 + PCNA

  10. Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN en la Pre-Iniciación

  11. Genes de la Maquinaria de Replicación de ADNen la Iniciación

  12. Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN en la Elongación

  13. Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN en la Elongación

  14. Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN en la Maduración

  15. Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína ORC6

  16. Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína PSF1

  17. Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína PSF2

  18. Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína PSF3

  19. Alineamientos de Secuencias Múltiples de proteína SLD5

  20. PSF1 PSF2 PSF3 SLD5

  21. Múltiples Copias de Genes de la Maquinaria de Replicación de ADN GENE Humano Levadura Arabidopsis Arroz ORC1 1 1 2 1 CDC6 11 2 1 CDT1 1 1 2 2 CDC451 1 1 2 TOPBP1 1 1 2 3 PSF3 1 1 2 1 POLD4 1 0 1 2 POLE1 1 1 2 1 POLE2 1 1 1 2 POLE3 1 1 GF GF POLE4 1 1 GF GF PCNA 1 1 2 1 RPA1 1 1 5 3 RPA2 2 1 2 3 RPA3 1 1 2 1 FEN1 1 1 1 2 LIG1 1 1 3 1

  22. Conclusiones • La maquinaria de replicación del ADN de animales y levaduras, está conservada en plantas, mostrando muchas características en común con otros eucariontes y otras que son únicas en plantas. • Las proteínas de replicación del ADN en plantas, son más similares a las del humano que a las de levaduras. • Los modelos animales pueden ser más importantes para el estudio de replicación del ADN en plantas que los de levadura.

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