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MINION MK1C

El MinION Mk1C es un equipo de secuenciaciu00f3n portu00e1til desarrollado por Oxford Nanopore Technologies, que pudimos ver en el laboratorio de biotecnologu00eda. Este dispositivo combina la tecnologu00eda del MinION Mk1B con un mu00f3dulo de anu00e1lisis y procesamiento, lo que lo hace muy compacto y fu00e1cil de usar.

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MINION MK1C

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  1. UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA Y ARQUITECTURA AMBIENTAL “RECONOCIMIENTO DEL SECUENCIADOR DE NANOPOROS (NANOPORE SEQUENCING) MinION MK1C” CURSO : BIOTECNOLOGIA DOCENTE :Dr. SOTO GONZALES, HEBERT HERNAN PRESENTADO POR: •Ramos Arohuanca, Jhon Brayan ILO-PERU 2024

  2. INDICE INTRODUCCION............................................................................. 3 I. II.OBJETIVO GENERAL ................................................................... 3 METODOLOGIA ......................................................................... 3 III. CARACTERISTICAS PRINCIPALES ...................................... 3 IV. KITS DE PREPARACIÓN DE MUESTRAS ................................. 5 V. APLICACIONES .......................................................................... 6 VI. CONCLUSION .............................................................................. 6 VII. VIII.BIBLIOGRAFIA ........................................................................... 7 2

  3. I. INTRODUCCION El MinION Mk1C es un equipo de secuenciación portátil desarrollado por Oxford Nanopore Technologies, que pudimos ver en el laboratorio de biotecnología. Este dispositivo combina la tecnología del MinION Mk1B con un módulo de análisis y procesamiento, lo que lo hace muy compacto y fácil de usar. II. OBJETIVO GENERAL Reconocer y entender el uso del MinION Mk1C, un equipo de secuenciación portátil III. METODOLOGIA Figura 1: Laboratorio de Biotecnología – UNAM IV. CARACTERISTICAS PRINCIPALES ✓Portátil y Ligero: El MinION Mk1C es pequeño y fácil de llevar, ideal para trabajar tanto en el laboratorio como en el campo. Tiene el tamaño de un libro pequeño y pesa menos de medio kilo. ✓Pantalla Táctil: Incluye una pantalla táctil de alta resolución que nos permite controlar el dispositivo y ver los resultados directamente. ✓Conectividad: Tiene Wi-Fi y puerto Ethernet, lo que facilita la conexión a internet y la transferencia de datos. 3

  4. ✓Análisis en Tiempo Real: Nos permite ver los resultados de la secuenciación en tiempo real, lo cual es muy útil para obtener datos rápidamente. ✓Gran Capacidad de Almacenamiento: Viene con un disco SSD de 1 TB, suficiente para almacenar una gran cantidad de datos de secuenciación.(Overview Device Information, n.d.) Figura 2: Vista completa del equipo. Figura 3: Conexiones y puertos que tiene el equipo foto referencial del manual de uso. 4

  5. Figura 4: Flujo de celdas contiene algo de 1500 poros. Figura 5: Kits que se utilizan en conjunto con el MinION para realizar secuenciaciones de ADN. V. KITS DE PREPARACIÓN DE MUESTRAS Los kits de preparación de muestras tienen como objetivo procesar el ADN o ARN de la muestra biológica de manera que esté listo para ser secuenciado por el MinION Mk1C. Este procesamiento incluye pasos como la fragmentación del ADN, la adición de adaptadores necesarios para la secuenciación y la purificación de la muestra. 5

  6. Componentes: ✓Enzimas: Utilizadas para fragmentar el ADN y facilitar la ligación de adaptadores. ✓Buffers: Soluciones que mantienen las condiciones óptimas de pH y salinidad para las reacciones enzimáticas. ✓Adaptadores: Secuencias cortas de ADN que se ligan a los fragmentos de ADN de la muestra, permitiendo que se unan al flujo de celdas del MinION. ✓Reactivos de Purificación: Productos químicos y columnas de purificación para limpiar y concentrar el ADN después de cada paso del protocolo. ✓Controles: Muestras de ADN conocidas que se utilizan para asegurar que el proceso de preparación y secuenciación esté funcionando correctamente. VI. APLICACIONES ✓Identificación de especies metagenómicas. ✓Perfilado de resistencia a antibióticos. ✓Ensamblaje de genomas microbianos. ✓Secuenciación de plásmidos. ✓Secuenciación dirigida y de baja cobertura de genomas grandes. ✓Transcriptómica a nivel de isoformas. VII. CONCLUSION En el laboratorio de biotecnología, tuvimos la oportunidad de conocer el equipo MinION Mk1C. Este dispositivo portátil de secuenciación de ADN nos mostró su gran capacidad para realizar análisis genéticos de manera rápida y eficiente, tanto en el laboratorio como en el campo. Para obtener toda la información detallada sobre el uso y manejo del MinION Mk1C, accedí al manual de usuario oficial. Creé una cuenta en la página principal de Oxford Nanopore Technologies, lo que me permitió descargar el manual y entender el proceso de preparación y secuenciación de muestras. 6

  7. Figura 6: Manual del MinION Mk1C. VIII. BIBLIOGRAFIA Community. (n.d.). Oxford Nanopore Support. Retrieved July 7, 2024, from https://community.nanoporetech.com/docs/prepare/library_prep_protocols/mi nion-mk1c-user-manual/v/mkc_2005_v1_revag_27nov2019 7

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