150 likes | 281 Views
Mutasi Pada Gal83 Glycogen-Binding Domain Mengaktifkan Snf1/Gal83 Kinase Pathway Dengan Mekanisme Glycogen-Independent. Dibawakan Oleh : Mastura (20504017) Merry (20504009). Pendahuluan. Glycogen Storage. Glikogen penyimpan karbohidrat Glikogen jika glukosa ( fase eksponensial )
E N D
Mutasi Pada Gal83 Glycogen-Binding Domain Mengaktifkan Snf1/Gal83 Kinase Pathway Dengan Mekanisme Glycogen-Independent Dibawakan Oleh : Mastura (20504017) Merry (20504009) 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Pendahuluan • Glycogen Storage 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Glikogen penyimpan karbohidrat • Glikogen jika glukosa ( fase eksponensial ) • Glikogen jika glukosa ( fase stationer ) • Saccharomyces cerevisiae Snf1 kinase homolog dengan mamalian AMP-activated protein kinase (AMPK) • Keduanya berperan dalam regulasi metabolisme glikogen 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Snf1 kinase dan AMPK • Catalytic subunit : -subunit • Regulatory subunit : -subunit • Mediates heterotrimer formation : -subunit • Snf1 kinase • -subunit : Snf1 • -subunit : Snf4 • -subunit : Gal83, Sip1, Sip2 • Gal83 -subunit memediasi interaksi Snf1 dan Sip4 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Latar Belakang • AMPK dan Snf1 kinase penting untuk regulasi metabolisme glikogen • -subunit AMPK terdiri dari N-isoamylase domain glikogen & enzim percabangan • Contoh : • Mutasi -subunit mempengaruhi glycogen storage glycogen storage disease 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Tujuan • Untuk menentukan peran glycogen-binding domain pada -subunit in vivo • Untuk mengetahui pengaruhnya terhadap regulasi metabolisme glikogen • Menentukan mekanisme yang terjadi antara glycogen-binding domain dengan aktivitas Snf1 kinase/ AMPK 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Metodologi Penelitian • Strains and genetic methods • Plasmids • Ekspresi GBD Gal83 & Sip2 pada bakteri • S. cerevisiae strains • Medium yeast extract-peptone-dextrose • pRT12, pHW33, pHW39, pHW40 Gal83 • pHW30, pHW35, pHW38 Sip2 • Kultur ditumbuhkan (OD 600 nm) ekspresi protein pengambilan sel (sentrifugasi) dilisis (PBS) lisat (sentrifugasi dan kromatografi pada Ni-agarose 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Uji Pengikatan Glikogen • Uji Kandungan Glikogen • Immunoblot analysis • Microscopy • Glycogen-binding domain Gal83 atau Sip2 murni diinkubasi sentrifugasi supernatan dihilangkan, pellet dicuci identifikasi fraksi dengan elektroforesis immunoblotting • Inokulasi kultur mid-log sentrifugasi resuspensi dlm sodium karbonat ditempatkan dalam heating block glukosa yang dilepaskan dihitung menggunakan oksidasi glukosa oksidase • Protein dipisahkan oleh SDS-Page dideteksi oleh anti-GFP antibodi • Nikon Eclipse E800 fluorescence microscope 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Sel ditumbuhkan dalam SC inkubasi filtrasi kromatografi uji aktivitas melalui fosforilasi SAMS peptide • Kinase assays • -Galactosidase assays • Preparation of RNA and Northern blot analysis • Transforman SC glukosa SC gliserol Aktivitas -Galactosidase diuji • RNA diendapkan dengan etanol elektroforesis dilacak dengan 32P-labeled DNA 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Hasil Penelitian • Mutasi Gal83 & Sip2 menghasilkan Gal83W184A,R214Q dan Sip2W186A,R216Q • Mutasi residu pada GBD meniadakan pengikatan glikogen 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Double mutasi sip2gal83 akumulasi glikogen • Mutasi Gal83 GBD akumulasi glikogen 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Level protein • Distribusi nukleoplasmik • Aktivitas katalitik Snf1 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Mutasi Gal83 meningkatkan ekspresi RNA yang mengkode Glycogen Synthase • Mutasi GBD mempengaruhi Snf1/Gal83 pada sel yang tidak mengandung glikogen 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Kesimpulan • Mutasi Gal83 GBD mempengaruhi secara positif fungsi Snf1/Gal83 kinase • GBD mengatur fungsi Snf1/Gal83 kinase dengan mekanisme yang tidak bergantung pada glikogen • Adanya kemungkinan bahwa domain mengikat molekul lain yang mirip glikogen yang dapat mengatur aktivitas katalitik 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)
Terima Kasih 27 April 2005/ Metabolisme Glikogen/ Kel I/ Mastura (20504017)-Merry (20504009)