1 / 15

Сериновые протеазы

Сериновые протеазы. Ковалентный катализ. Сериновые протеазы. В активном центре остаток Ser Система переноса заряда Ser …His …Asp Ковалентный механизм катализа, нуклеофил — O боковой цепи Ser

kevlyn
Download Presentation

Сериновые протеазы

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Сериновые протеазы Ковалентный катализ

  2. Сериновые протеазы • В активном центре остаток Ser • Система переноса заряда Ser …His …Asp • Ковалентный механизм катализа, нуклеофил — O боковой цепи Ser • Необратимо ингибируются:- диизопропилфторфосфатом (DFP)- фенилметансульфонилфторидом(PMSF)- хлорметилкетонами

  3. Каталитическая триада • His-Asp-Ser Химотрипсин • Asp-His-Ser Субтилизин • Ser-Asp-His Карбоксипептидаза Y • Ser-His-Asp Clp-протеаза • «нестандартные» сериновые протеазыSer-LysSer-His-GluSer-His

  4. Трехмерная структура • «Внешний вид» α-химотрипсина

  5. Трехмерная структура • Схема трехмерной структуры α-химотрипсина • Выделены остатки каталитической триадыSer195His57Asp102 • и фрагмент пептидного субстрата

  6. Каталитическая триада + + + + оксианионная впадина

  7. Субстрат-связывающий участок: карман S1 • Трипсин: Asp189, Gly216,Gly226 • Химотрипсин:Ser189 • Эластаза:Val216, Thr226 • Гранзим BArg226

  8. Активация профермента • Отрезается 15 остатков с N-конца • «Домен активации»:142-152184-193216-223меняет форму • Образуется солевой мостикIle16…Asp194 • Формируется субстрат-связывающий участок

  9. Активация профермента • Отрезается 15 остатков с N-конца • «Домен активации»:142-152184-193216-223меняет форму • Образуется солевой мостикIle16…Asp194 • Формируется субстрат-связывающий участок

  10. Механизм ковалентного катализа второй тетраэдрический аддукт первый тетраэдрический аддукт ацил-фермент

  11. Каталитический акт: накануне

  12. Тетраэдрический аддукт

  13. ацил-фермент • Нуклеофил — молекула воды

  14. Второй тетраэдрический аддукт • Расщепляется с образованием продуктов реакции

  15. Ацил-ферментможно наблюдать экспериментально • Светлый контур – pH 2 • Розовый контур – pH 10

More Related