1 / 30

cellbio.ebc.ee/rakubio/

http://www.cellbio.ebc.ee/rakubio/. RNA süntees e. transkriptsioon. Transkriptsiooni viib läbi ensüüm RNA-polümeraas. RNA-polümeraas. Kasutab RNA sünteesiks ribonukleosiid-trifosfaate, mis on sünteesil ka energia allikaks Sünteesib samuti 5’ → 3’ suunas Ei vaja alustamiseks praimerit

leala
Download Presentation

cellbio.ebc.ee/rakubio/

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. http://www.cellbio.ebc.ee/rakubio/

  2. RNA süntees e.transkriptsioon

  3. Transkriptsiooni viib läbi ensüüm RNA-polümeraas

  4. RNA-polümeraas • Kasutab RNA sünteesiks ribonukleosiid-trifosfaate, mis on sünteesil ka energia allikaks • Sünteesib samuti 5’ → 3’ suunas • Ei vaja alustamiseks praimerit • DNA polümeraas eksib kord 107 nukleotiidi kohta • RNA polümeraas eksib kord 104 nukleotiidi kohta

  5. Rakud toodavad kolme tüüpi RNAd: • mRNA e. messenger-RNA – kopeeritakse geenidest, mis määravad mōne valgu järjestuse. mRNA järjestuse alusel süntee-sitakse hiljem valku • Umbes 10% (pärmil) geenidest kopee-ritakse RNAna, mis ongi nende geenide jaoks lōpp-produktiks. Need on: • ribosomaalne e. rRNA • transport- e. tRNA

  6. Ühekorraga transkribeeritav RNA – transkriptsiooniühik • Eukarüootides üks üks RNA molekul/üks valk • Prokarüootides vōib üks transkriptsiooniühik sisaldada mitme valgu kodeeritvat järjestust

  7. Ühelt geenijärjestuselt vōib samaaegselt toimuda paljude RNA-molekulide transkriptsioon

  8. Transkriptsioon prokarüootidel • Transkptsioon algab kui RNA-polümeraasi σ-faktor seondub geeni promootoriga ja • lōpeb geeni terminaatorjärjes-tuse juures • Promootorjärjestus on asümmeetriline ja määrab RNA sünteesi suuna

  9. Transkriptsiooni algus ja lõpp prokarüoodil

  10. Prokarüootidel on üks RNA-polümeraas, mis sünteesib kōiki RNA tüüpe • Eukarüootidel on 3 tüüpi RNA-polümeraase: • RNA-polümeraas I (tRNA, rRNA, väikesed RNAd) • RNA-polümeraas II (mRNA) • RNA-polümeraas III (tRNA, rRNA, väikesed RNAd)

  11. RNA-polümeraas II • Erinevalt bakteriaalsest RNA-polümeraasist vajab RNA-polümeraas II sünteesi alustamiseks alati üldiseid transkriptsioonifaktoreid (valgud, TFII), mis peavad enne transkriptsiooni algust seonduma polümeraasi ja promootori piirkonnas asuva nn TATA-boksiga (umbes 25 nukleotiidi ülalpool transkriptsiooni alguspunkti)

  12. RNA polümeraas II transkriptsiooni initsieerimine eukarüootses rakus

  13. Polümeraas II vajab in vivo veel aktivaatoreid, mediaatoreid ja kromatiini modifitseerivaid valke

  14. Transkriptsiooni initsieerimine eukarüoodi promootoril - üksikute etappide järjekord: • geeni aktivaator-valk seondub kromatiiniga, seejärel seondub kromatiini ümberkujundavate valkude kompleks • modifitseeritakse (sageli atsüülitakse) histoonid, toimub kromatiini osaline lokaalne lahtipakkimine • geeni regulaator-piirkonnaga seonduvad täiendavad aktivaator-valgud • seonduvad üldised transkriptsioonifaktorid + RNA-polümeraas • esialgne initsiatsioonikompleksi kokkupanek promootoril: • lisandub veel aktivaator-valke • valkude ümberpaigutumine esialgses initsiatsioonikompleksis • algab transkriptsioon

  15. DNA ahela lokaalsel lahtitōmbamisel tekib ahelas pinge

  16. 5’ capi lisamine 3’ polüadenüleerimine mRNA splaissimine RNA protsessing eukarüoodis (ei esine prokarüootidel)

  17. Eukarüootse mRNA 5’ otsa lisatakse cap

  18. Transkriptsioon eukarüoodis

  19. mRNA splaissimine eukarüootides • Äsjasünteesitud mRNAst lōigatakse tuumas välja teatud osa mRNA järjestusest (intronid), allesjäävad, valku kodeerivad järjestused (eksonid) splaissitakse (liidetakse omavahel kokku)

  20. Näide alternatiivsest splaissimisest: roti α-tropomüosiini geen

  21. mRNA polüadenüleerimise sait on määratud konsensusjärjestusega (ca 30-40 nukleotiidi)

  22. Prokarüütse ja eukarüootse mRNA võrdlus

  23. Ribosomaalse RNA transkriptsioon

More Related