1 / 38

HYBRIDIZACE A HYBRIDN Í ZÓNY

HYBRIDIZACE A HYBRIDN Í ZÓNY. Chorthippus parallelus. Sekundární kontakt. kruhové druhy:. postgl a ci ální expanze. budníček zelený ( Philloscopus trochiloides ). Ensatina eschscholtzii - klauberi. A. hybridn í taxon. A. . C. . B. B. A. hybridn í roj (hybrid swarm).

lewis-dixon
Download Presentation

HYBRIDIZACE A HYBRIDN Í ZÓNY

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. HYBRIDIZACE A HYBRIDNÍ ZÓNY

  2. Chorthippus parallelus Sekundární kontakt kruhové druhy: postglaciální expanze budníček zelený (Philloscopus trochiloides) Ensatina eschscholtzii - klauberi

  3. A hybridní taxon A  C  B B A hybridníroj (hybrid swarm)      B hybridnízóna Možné výsledky hybridizace

  4. Hybridní zóna = oblast, ve které se dvě geneticky odlišné populacesetkávají, kříží a dávají vzniknout alespoň nějakému hybridnímu potomstvu (Barton a Hewitt 1985) Hybridní zóny mohou být • primární • sekundární • mosaic, staggered, mottled, tension, ... • extrinsic selection • intrinsic selection (prezygotic, postzygotic)

  5. Mozaiková hybridní zóna: • vliv vnějšího prostředí • vlastně soubor několika hybridních zón • př.: kuňka obecná (Bombina bombina) a k. žlutobřichá (B. variegata)

  6. Bombina: B. variegata:hory, pahorkatinyterestrickározmn. v loužíchtlustá kůže neteritoriální580 Hzkratší vývoj B. bombina:nížinypřevážně ve voděvětší vodní plochy tenčí kůžeteritoriální530 Hzdelší vývoj v Chorvatsku mozaiková HZ, v Polsku ne

  7. Tenzní zóna je když… Mr. Lightbelly Miss Darkback

  8. Tenzní zóna je když… Mr. Lightbelly Miss Darkback disperze  rozšiřování zóny

  9. Tenzní zóna je když… Mr. Lightbelly Miss Darkback  ♂ ♀ selekce proti hybridům!  zužování zóny Tenzní zóna udržována dynamickou rovnováhou („tenzí“) mezi disperzí a selekcí

  10. “population trough” Tenzní zóna není závislá na vnějších podmínkách (intrinsic selection) její pozice se ustálí na místě geografické překážky nebo nejnižší populační hustoty („population trough“)

  11. Teorie klin: sekundární kontakt: koincidentní a konkordantníkliny

  12. koincidence = souhlasná pozice středů konkordance = souhlasný tvar klin (v praxi většinou souhlasné šířky)

  13. Teorie klin: neutrální vs. selektované lokusy lokus 1 lokus 2

  14. Teorie klin: neutrální vs. selektované lokusy s postupujícím časem konkordance mizí ... lokus 1 lokus 2 ... ale (u tenzní zóny) selekce tlačí kliny pro jednotlivé lokusy k sobě  udržuje koincidenci

  15. Teorie klin: občas ... lokus 1 lokus 2 ... ale kliny stále paralelní

  16. průběh hybridní zóny může být komplikovaný.... ... navíc předem většinou neznáme, nebo extrapolujeme z globálního směru

  17. Cline interpolated from widescale survey Real local cline

  18. 2D  1D kliny

  19. šířka (w) = 1/max. slope střed (c) Příklad: Mpi • proložení: např. logistická regrese  modely založené na teorii klin • sigmoidní model: hyperbolická tangenciální funkce:

  20. 1.0 0.8 0.6 Frequency p 0.4 0.2 0.0 c 0 20 40 60 80 100 120 140 Distance along transect Více genů: „stepped“ model (symetrický, asymetrický) • vazbová nerovnováha v důsledku přílivu rodičovských kombinací  • zesílení selekce ve středu zóny  centrální schod • introgresní „ocasy“ vypovídají o selekci na jednotlivé lokusy

  21. Z hodnot LD a klinálních parametrů můžeme odhadnout některé další klíčové evoluční parametry: • dispersal: • effective selection: • selection on marker loci: • selection on selected loci: • fitness of hybrids: • number of loci under selection:

  22. srovnání modelů: LRT (jsou nestované); d.f. = rozdíl počtu parametrů • likelihood profiles: jeden parametr fixován, zbytek: Metropolis-Hastings ...

  23. šířka kliny vzdálenost na chromosomu molekulární markery centromera hybridní zóna oblasti pod selekcí

  24. Teorie klin: cline models (diffusion approximation etc.), linkage disequilibrium, evolutionary parameters ?? problém, jak analyzovat

  25. Frequency of marker Distance along transect Pooled Adjacent Violators Algorithm (PAVA) non-monotonic  “adjacent violators” Frequency of marker Brunk (1955) Barlow et al. (1972) Macholán et al. (2008) Distance along transect

  26. PAVA for different orientations • No. orientations = N(N – 1) • 3 sites: 6 different directions  20 sites: 380 directions accuracy  1 most likely direction

  27. Zfy2 Btk Abpa Es1 Gpd1 Idh1 Mpi Np Sod1 Consensus Y

  28. Monotonic clines – consensus orientation Y

  29. X and Y monotonic clines – cons. and Y orientations Ycons YY Btkcons

  30. D=44%** M=45%*** DYM=51% salient/invagination 330 km2

  31. problém nezávislosti vzorků: FST a FIS .... Ne • zasílení (reinforcement):

  32. W. Bateson T. Dobzhansky H. Muller Proč studovat hybridní zóny - speciace • Dobzhanského-Mullerův model

  33. Proč studovat hybridní zóny - speciace • Haldaneovo pravidlo • role pohlavních chromozomů • role genového konfliktu • speciační geny: Odysseus (Drosophila), Nup (Drosphila), Hst (myš) H. Allen Orr Jerry Coyne

  34. Programy pro analýzu hybridních zón: • Analyse: Stuart J.E. Baird, Nick H. Barton (Mac) • ClineFit: Adam Porter (PC) • CFit: Thomas Lenormand (PC) • (Geneland) S.J.E. Baird N.H. Barton T. Lenormand A. Porter

  35. Gompert and Buerkle (2009): celogenomová analýza

  36. Cytonukleární nerovnováhy • = nenáhodné asociace jaderných a cytoplazmatických (mitochondriálních) alel • 3  2 tabulka

  37. Absence hybridizace Náhodné křížení, hybridní roj Hybridizace bez výraznější introgrese,křížení nezávisí na pohlaví Hybridizace bez introgrese,křížení závisí na pohlaví

  38. Hybridi se častěji kříží s méně diskriminujícím druhem Symetrická introgrese do obou druhů Možná introgrese,křížení závislé na pohlaví

More Related