Emanuel Teixeira Nº24924 Bioengenharia

1. 2011-2012 Emanuel TeixeiraNº24924Bioengenharia Bioinformática KEGG

2. KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes. • Enciclopédia de genes e genomas de Kyoto • Fundaçãodevida ao programa genoma humano japonês em 1995 • Colecção online de bases de dados de genómica para a análise das funções dos genes: genomas, vias enzimáticas, produtos químicos biológicos e redes de interacções moleculares nas células e variantes específicas a determinados organismos…

3.  http://www.kegg.jp/http://www.genome.jp/kegg/ • Contem genomas completamente sequenciados e outros parcialmente, porem estes contêm anotações actualizadas a respeito das funções dos genes • Contem representações gráficas (processos celulares i. e. metabolismo, transporte membranar,transdução de sinal e ciclo celular) • E ainda, aplicações principalmente em JAVA que permitem “navegar” em mapas de genomas e ferramentas de comparação de sequências genéticas

4. KEGG • Bases de Dados principais • KEGG Pathway (vias e complexos) • KEGG BRITE • KEGG Module • KEGG Mapper • KEGG Atlas

5. http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html

6. Relaciona a informação conhecida sobre redes de interacção molecular, genes e proteínas geradas por projectos de genoma, compostos bioquímicos e as suas reacções, dividindo-as pelas bases de dados respectivas.

7. KEGG Pathway • Metabolismo; • Processamento de informação genética; • Processamento de informação ambiental; • Processos celulares; • Doenças Humanas; • Desenvolvimento de medicamentos… • (Trabalhos em curso: adicionar bases de dados ortológicas i.e. arvores genealógicas)

8. http://www.genome.jp/kegg/pathway.html

10. Outras bases de dados relacionam • Compostos (moleculares, celulares…); • Medicamentos; • Reacções (celulares, dos medicamentos…); • Enzimas; • … • http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html

13. drosophila melanogaster