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中外文医学文摘数据库检索方法与技巧

中外文医学文摘数据库检索方法与技巧. 北京大学口腔医院图书馆 李晓霞 Email: lxx_xc@163.com. 主要内容. PubMed 数据库检索技巧. CBM《 中国生物医学文献数据库 》. GOOGLE SCHOLAR 检索技巧. PubMed 数据库. PubMed 主要内容. PubMed 概况 PubMed 数据类型 PubMed 检索方法 My NBCI 个性化服务. PubMed 概况. 创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心 (NCBI) 1997 年 6 月开始向全球开放

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中外文医学文摘数据库检索方法与技巧

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Presentation Transcript

  1. 中外文医学文摘数据库检索方法与技巧 北京大学口腔医院图书馆 李晓霞 Email: lxx_xc@163.com

  2. 主要内容 PubMed数据库检索技巧 CBM《中国生物医学文献数据库》 GOOGLE SCHOLAR 检索技巧

  3. PubMed数据库

  4. PubMed主要内容 • PubMed概况 • PubMed数据类型 • PubMed检索方法 • My NBCI个性化服务

  5. PubMed概况 • 创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI) • 1997年6月开始向全球开放 • 特色：具有收录范围广(约占世界医学文献期刊的80%以上)、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点， • 每篇文献都有全文通道链接（linkout），便于检索者方便地找到所需的原文。

  6. PubMed概况 • 收录文献的时间范围： 1950- 每日更新（周二-周六） • 检索全世界生物医学期刊论文的重要工具 • 网址：www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 或www.pubmed.gov

  7. PubMed - as supplied by publisher PubMed 属于Medline收录范围，建立ti、au、ab等基本书目信息。 （暂）不属于Medline收录范围，但也建立ti、au、ab等基本书目信息。 PubMed - in process 赋予MeSH、PT等字段并被index。 PubMed - indexed for MEDLINE  PubMed数据类型（状态） PubMed除了1966年以前的OldMedline，其余文献按处理过程分4种类型（或状态）

  8. PubMed检索方法

  9. 1. 检索机制 PubMed检索方法——怎么用？ 如果输入的检索词在以上词表中未找到，且该词后有一或二个字母，PubMed就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词，PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed将该词组的每个单词用`AND’组配并在所有字段中查找。 包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例如，如果你输入“New England Journal of Medicine”，PubMed将按“N Engl J Med［ta］”查询。 如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词，PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表， MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如，如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索：(“Biotin［MeSH］OR vitamin h［tw］)——vitamin h是MeSH词Biotin的款目词。 • 自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping) 对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是： MeSH表 期刊刊名注释表 短语表 作者索引 • 短语检索(Phrase Searching) • 要将短语作为一个词组进行检索，可用双引号“ ”将其引起来。 • 如：“drug therapy”作为词组进行检索的词，系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。

  10. PubMed检索方法——怎么用？ A B A B A B 2. 布尔逻辑运算符 布尔逻辑组合 检索，常用的 逻辑关系词有 AND，OR， NOT等 逻辑与（AND） --检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如：A AND B （AIDS and therapy） 逻辑或（OR） --检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如：A OR B （ AIDS or Acquired Immunodeficiency Syndrome） 逻辑非（NOT） --在含检索词A的记录中，去掉含检索词B的记录。 如：A NOT B（Hepatitis not Animal）

  11. 基本检索 高级检索 主题检索

  12. 一.基本检索 PubMed检索方法——怎么用？ 默认检索字段为主题、作者、期刊

  13. 一.基本检索 PubMed检索方法——怎么用？ • 关键词、词(词组)或短语： ⑴ 输入任意关键词：liver cancer、Lung cancer； ⑵ 带有双引号“ ”作为短语检索：“cancer therapy”； ⑶ 带有连接号“-”作为一个词组检索：interleukin-6。 • 限制检索字段：如liver cancer[ti] • 作者：Smith J 、 仅知道作者姓，则必须加上字段标识，如： Smith[au] 2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索 如：Joshua Lederberg

  14. PubMed检索方法——怎么用？ 一.基本检索 作者姓名检索 按照姓+名缩写（不用标点）的格式键入作者姓名，如：smith ja或jones k, 系统会自动在作者字段内进行检索。姓名第一个字母可用大写也可用小写，姓前名后,姓用全称，名字一般用缩写。 考虑到作者姓名的不同形式，PubMed采用自动转换功能进行作者姓名检索，如：smith j将检索成smith ja, smith jc,smith jr 等。 精确检索：可以用双引号将作者名引起来，再加作者字段限定[AU]，如："smith j"[au]，这样可避免PubMed自动转换，实现精确查找。

  15. PubMed检索方法——怎么用？ 作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写)， 之间不用标点 键入作者姓名 smith j

  16. 精确检索避免 PubMed自动 词汇转换，实 现精确查找 "smith j"[au]

  17. 一.基本检索 PubMed检索方法——怎么用？ • 期刊刊名： ⑴可用期刊全称：GENE THERAPY[TA]； ⑵可用期刊简称：JAMA[TA]；(The Journal of the American Medical Association)

  18. PubMed检索方法——怎么用？ 一.基本检索 期刊检索 在检索框中键入期刊名，如：molecular biology of the cell，系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成mol biol cell[journal]进行检索。 也可以直接输入Medline的期刊标准缩写形式，如：mol biol cell，或者是输入刊物的ISSN（国际标准出版物代码）进行检索，如：1059-1524。 如果一个杂志名恰好是主题词或关键词，如：cancer， science，cell等，PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中的主题词进行检索。因此，需要将检索请求进行标准化处理，即在杂志名后面加[TA]。如："cell"[ta]

  19. 期刊的一般检 索，是在检索 输入框中键入 期刊名或期刊 的ISSN号 Eur J Immunol

  20. 期刊的标准检 索，是在期刊 名后面加字段 限定[TA]. 比 如:"cell"[ta] "cell"[ta]

  21. 一.基本检索 PubMed检索方法——怎么用？ • 复杂表达式：liver cancer AND therapy • 带有摘要文献的检索 ：liver cancer AND has abstract

  22. PubMed检索方法——怎么用？ 一.基本检索 截词检索 截词检索的作用：扩大检索范围，提高查全率。 截词符：用*表示，代表多个字符，将*加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索。 如：bacter*，可以检出bacter，bacteria， bacteriophage ，bacterium，等最多600个单词。

  23. 截词检索可以 扩大检索范围 提高查全率。 bacter*[TI]

  24. PubMed检索方法——怎么用？ 1.基本检索 字段限制检索 采用字段限制方式进行检索，其规则是： 检索词1[字段标识] 逻辑运算符 检索词2[字段标识] 如：查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面的文献. 检索式： DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]

  25. 常用字段组成 标识符 字段名称 TI Title AU Author AD Affiliation AB Abstract DP Publication Date SO Source TA Journal Title Abbreviation MH MeSH Terms PT Publication Type

  26. 字段限制检索 其规则是：检 索词+[字段 标识] DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]

  27. 高级检索

  28. 高级检索

  29. 检索区 输入区 检索史

  30. 高级检索举例： 查阅北京大学俞光岩的文章. 分析该课题，可知： • 作者为：俞光岩（yu gy) • 作者单位为： 北京大学（peking university）

  31. MeSH主题词检索

  32. MeSH主题词检索 主题词也称为叙词，是描述文献重点讨论的内容，是对自然语言进行规范化处理后的结果，主要用于文献的标引和检索。 副主题词是用于对主题词进一步限定的词，又称限定词。 注意：主题词检索只适用于有主题标引的MEDLINE数据！

  33. 进入主题词检索界面，两个途径。

  34. 糖尿病（Diabetes ）治疗（therapy）方面的文献。

  35. 主题词检索开始 第一步：输入检索词:diabetes

  36. 第二步：确定规范的主题词

  37. 第三步：确定副主题词

  38. 第三步：找到相应副主题词

  39. 第四步：检索

  40. 检索结束

  41. 选择检索条件 加权与不加权

  42. 主题词“加权”表示主题词的重要程度，反映文章论述的核心内容。加权主题词在数据库用“ * ”表示，如“ * 肝肿瘤”。 加权检索表示仅对加星号(*)主题词 (主要概念主题词) 检索； 不加权检索表示对加星号主题词和非加星号主题词（非主要概念主题词）均进行检索。 “加权检索”可提高检索结果的相关性。

  43. 如果想更准确,可进行加权检索

  44. 不加权检索 加权检索

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