750 likes | 983 Views
FORENSIC DNA. DNA TİPLEMESİNİN ADLİ TIBBİ UYGULAMALARI. Yrd.Doç.Dr. Alper Tunga Akarsubaşı. Ref: Dr. Oğuzhan Ekizoğlu İstanbul Tıp Fakültesi Adli Tıp Ana Bilim Dalı. Summary. What is DNA?. Where is DNA found in the body?. How does DNA differ among individuals?. Forensic DNA Analysis.
E N D
FORENSIC DNA DNA TİPLEMESİNİN ADLİ TIBBİ UYGULAMALARI Yrd.Doç.Dr. Alper Tunga Akarsubaşı Ref: Dr.Oğuzhan Ekizoğlu İstanbul Tıp Fakültesi Adli Tıp Ana Bilim Dalı
Summary • What is DNA? • Where is DNA found in the body? • How does DNA differ among individuals? • Forensic DNA Analysis • DNA and Statistics
What is DNA? What does DNA stand for? DeoxyriboseNucleic Acid or Deoxyribonucleic Acid What does DNA do? • DNA contains genetic information. • DNA codes for the proteins our bodies make that are necessary for survival.
What is DNA? DNA is a code for making proteins AGC TAG CTT ATA CTC TAT CTC TTT Amino Acid Amino Acid Amino Acid Amino Acid Amino Acid Amino Acid The order of amino acids determines what type of protein is made.
What is DNA? Some common proteins are: • Hemoglobin - carries oxygen from lungs to cells • Insulin - regulates metabolism • Many types of enzymes - catalyze reactions in the body, such as the breakdown of sugar for energy DNA also determines how much of these proteins each cell makes.
What is DNA? What does DNA look like? Double Helix Like a Twisted Ladder
What is DNA? What does DNA look like? Sugar Phosphate Backbone (Sides of Ladder) Nitrogenous Base (Rungs of Ladder)
What is DNA? The DNA ladder is made up of building blocks called nucleotides. What is a nucleotide? Adenine Cytosine Guanine Thymine Phosphate Group Base Deoxyribose sugar
The 4 Bases A Adenine C Cytosine T Thymine G Guanine
The 4 Bases A C T G
The 4 Bases The bases pair up to form the rungs of the ladder. A pairs with T G pairs with C
What is DNA? DNA is written as the sequence of these bases: AAGTCGATCGATCATCGATCATACGT • Only one side of the ladder is written. • In humans, there are three billion (3,000,000,000) base pairs (letters) in the DNA within each cell.
What is DNA? Among humans, most of the 3 billion bases in the DNA sequence are exactly the same. • Our Human DNA is 99.8% similar to each other, but the 0.2% difference is more than enough to distinguish us from one another. • Human DNA is even 98% similar to chimpanzees. • NO TWO PEOPLE HAVE IDENTICAL DNA* *except identical twins
What is DNA? Stupid Facts: • If two different people started reciting their individual genetic code at a rate of one letter per second, it would take almost eight and a half minutes before they reached a difference. • If unwound and tied together, the strands of DNA in one cell would stretch almost six feet but would be only 50 trillionths of an inch wide. • If all the DNA in your body was put end to end, it would reach to the sun and back over 600 times (100 trillion times six feet divided by 92 million miles).
Where is DNA? DNA is found in the cells in our body. Nucleus (Brain of the cell) Mitochondria (more later)
Where is DNA? All types of cells in our body contain a copy of the same DNA. Some cells important to forensic science are: White Blood Cell Cheek Cell Sperm Cell
Where is DNA? DNA in the nucleus is packaged into Chromosomes
Where is DNA? Chromosomes come in pairs (one from Mother) (one from Father) There are 46 chromosomes in each cell. (23 pairs)
Where is DNA? What are sources of DNA at a crime scene? DNA can be recovered from any substance that contains cells. • Blood • Semen • Saliva • Tissue • Bone • Teeth • Hair • Maggot Crops
How does DNA differ among humans? DNA is a sequence of 4 possible letters A G C T Of the 3 billion letters, 99.8% of the sequence in all humans is identical. There are several ways the sequence can be different.
How does DNA differ among individuals? 1. One of the bases (letters) can be different. Person 1AGCTAGATCGTTATTCCGAG Person 2AGCTAGATCGTCATTCCGAG
How does DNA differ among individuals? 2. Bases (letters) can be added or removed. Person 1AGCTAGATCGTTATTCCGAG Person 2AGCTAGATCGTATTCCGAG Person 3AGCTAGATCGTTTATTCCGAG Person 4AGCTCCGAG
How does DNA differ among individuals? 2. Bases (letters) can be added or removed. Person 1AGCTAGATCGTTATTCCGAG Person 2AGCTAGATCGTATTCCGAG Person 3AGCTAGATCGTTTATTCCGAG Person 4AGCTCCGAG
How does DNA differ among individuals? 3. Regions of DNA can be repeated a different # of times Person 1..GCCAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTTTCAT..
How does DNA differ among individuals? 3. Regions of DNA can be repeated a different # of times Person 1..GCCAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTTTCAT.. 1 2 3 4 5 6 Person 2..GCCAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTTTCAT.. 1 2 3 4 5 Person 3..GCCAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTT.. 1 2 3 4 5 6 7
Forensic DNA Analysis Basic Steps in Analysis Extraction: • Separates DNA from sample Amplification or PCR: • Amplifies small portions of DNA (STR regions) Separation: • Separates amplified fragments according to size.
The Thermal Cycler Amplifies DNA
FMBio Separates Amplified DNA
Forensic DNA Analysis Color image of gel
Forensic DNA Analysis Gel Electrophoresis Black and white image of STR gel. Samples will have one or two bands at each loci.
ABI 310 Genetic Analyzer Separates Amplified DNA
Forensic DNA Analysis 13 loci used in CODIS
DNA and Statistics The final result is presented as a statistic. Do not say: “The DNA in the bloodstain is John Doe’s DNA.” Do Say: “The chance that another person has this DNA in the bloodstain is 1 in 300 billion.”
DNA and Statistics Where do the statistics come from? First, the frequency of each allele is estimated using data from a population data base. Allele frequency from database Locus: D5S818 7 26% Alleles: 7,9 9 11%
DNA delillerinintoplanmasıvesaklanması • Kriminalaraştırmalarınbaşarılışekildesonuçlanmasıiçinfizikseldelilincelemesinin ilk dönemiçokönemlidir. • Yakınzamandakiolgulardeliltoplanmasıvesaklanmasımetodlarıhakkındakibilgilerinmahkemedetitizlikleincelenmeyeveitirazkonusuolmayadevamedeceğiniaçıkbirşekildedesteklemektedir.
Gerçektenmahkemede DNA testininkabuledilebilirliğiiçin, kalanbirkaçitirazınçoğumetodolojiyiönplanaalmaktadır. Bunlar ; • Örnektoplanmasınınbaşlangıcını • Örneğinsaklanmasını • biyolojikdelilinişlenmesini
GENEL TEDBİRLER • Herhangibirtiptebiyolojikmateryelalınırken, kanvevücutsıvılarıiçingeneltedbirlerizlenmelidir; • Kanlataşınanpatojenlerfazlacayaygınolduğundan, kaynağınabakılmaksızıntümbiyolojikörneklerinenfeksiyözolduğunufarzetmekakıllıcaolur. • Biyolojikdelilledirekttemastankaçının, • Biyolojikdelilihazırlarkenyadaüzerindeişlemleryaparkeneldivengiyin, • Yemekten-içmektensakının
DNA KAYNAKLARI Mitokondrial DNA analizleridışında, DNAanaliziiçinuygundeliller, nükleusluhücreleriiçerenbiyolojiksubstanslarlasınırlıdır. • Kan vekanlekeleri • Semenve seminal lekeler • Dokularveorganlar • Kemiklervedişler • Saçvetırnaklar • Tükrük, idrarvediğerbiyolojiksıvılar
Gözyaşı, ter, serumgibidiğerbiyolojikdeliltürlerinükleusluhücrelerdenmahrumolduğundan standard DNA analizleriiçinuygundeğildir. • Gastriksıvıvegaitalekelerigibidiğermateryellerden DNA izoleedilmiştir. • Bununlabirliktebumateryellerinolguörneklerindenyeterli DNAeldeetmekgüçtür. • Hattaadıgeçenörneklerdensıklıkla DNA tiplendirilebilmişolmasınarağmençoğuolguda, örneğinkaliteve/veyamiktarı DNA analiziiçinuygundeğildir.
DNA profilieldeedebilmeyietkileyen faktörler • Örneğinmiktarı • Örneğinbozunmasıyanidegradasyonu • Örneğinsaflığı
Toplamavesaklamayöntemleribu 3 konuüzerindeciddietkiyesahiptir. • Amaçlanan test içinyeterliDNA’nıneldeedilmesinisağlayacakkadarçokmiktardamateryeltoplanmalıdır. • Ortamdakikir, yağvediğerpisliklerinalınmasındankaçınmakesastır.( - PCR) • Örneklertoplandıktansonrahemenadlitıplaboratuvarınateslimedilmelidir. • Parçalarlaboratuvarateslimedilenekadarsoğukvekuruortamdatutulmalıdır.
Genellikle biyolojik deliller 2 yoldan biri ile transfer edilir : • Direkt deposit (döküntü) : Örnek direkt temas eder • Sekonder (indirekt) transfer:Biraracıyoluylataşınabilir. Sekondertransferdeorijinalkaynakile (DNA delilinindonorü) hedefyüzeyarasındadirekttemasyoktur.
DNA DelilininBelgelenmesi Suçalanındadelil : • Delilindokunmadan, hareketettirmedenveyaalmadanöncefotoğrafınıçekin • Delilivesuçalanındakinisbilokalizasyonunu video-teypealın • Delilindurumunuveyerinibelgeleyin • Olay yerindekidiğerobjelerledelilinuzaysalilişkisini (3 boyutlu) not edin, krokisiniçizin • Delilpaketiniişaretleyin, numaralayınvemühürleyin
AdliTıpLaboratuvarındaDelil : • Delilpaketininmühürünündurumunu, işaretini, numarasını not alın • Paketiörnektoplayıcınınadı, laboratuvarolgunumarasıvetarihiişaretleyin • Doğruörneğinteslimalındığındaneminolun. • Paketiçeriğininfotoğrafve/veyakrokisini not edin • Herhangibirörneklemedenöncemateryelüzerindekibiyolojikdelilindurumuveyerleşiminibelgeleyin. • Eğerherhangibirhazırlıktestiyapılacaksa, testinnatürünüvesonuçlarınıkayıtedin.
OtopsiSalonundaDelil : • Ceseditemizlemedenöncecesedinveekdelillerinfotoğrafınıçekin • Delili not edinvekrokisiniçizin • Temizaletlerkullanarak her delilparçasınısistematikolaraktoplayın • Uyguntoplamakaplarına her delilparçasınıayrıayrıpaketleyin • Toplamakabınıişaretleyinvetoplananörneğinmiktarını not edin. • Örneğiuygunşekildesaklayın • Giysileridikkatlialın
Kan ve Kan Lekeleri Bir Bireyden Kan : • Antikoagülan olarak EDTA içeren vakumlu bir tüp içine en az 5 ml. kan alınmalıdır (mor kapaklı). • Eğer geleneksel serolojik ve/veya ilaç yada alkol analizleri yapılacaksa ek tüplere kan alınmalıdır. • Her tüp tarih, saat, olgu adı, alım yeri, alınan miktar, olgu sayısı ve örnek sayısı ile işaretlenmelidir. • Kan örnekleri buzdolabına konmalı ve mümkün olduğunca çabuk bir şekilde laboratuvara gönderilmelidir. • Eğer serolojik testler yapılması düşünülüyorsa kanın dondurulmaması gerektiğine dikkat edin.
Suçalanındasıvı kanörnekleri • Steriliğneveya disposable pipetkullanılarakalınmalıvetemiztercihensterilbir test tübünenakledilmelidir. • Birkanpıhtısıtemizbirspatülakullanılaraktemizbir test tüpüneaktarılabilir. • Temizbirpamuklukumaşsıvıkanyadakanpıhtısınınemdirilmesiiçinkullanılabilir. • Kan paketlenmedenvelaboratuvarateslimedilmedenöncehavailekurutulmalıdır (fakatdirektgüneşışığıaltındadeğil).
Kar, Buzveya Su İçindekiSıvı Kan • Karyadasuiçindebulunankanörnekleridahafazladilüsyondankaçınmakiçinderhalalınmalıdır • Bu örneklerin en konsantrekısmıvemümkünolduğuncafazlamiktarıtemizuygunbirkapiçinealınmalıdır (örneğinörnekfincanıile) ve dondurulmamalıdır