260 likes | 510 Views
Karbonfiksering. Calvin syklus Fotosyntetisk karbohydratsyntese. Winnie Eskild, IMBV 2004. Karbonfiksering. Fotosyntesen har en lysavhengig og en lysuavhengig reaksjon Lysavhengig reaksjon = fotosyntesen Produserer NADPH og ATP basert på lysenergi Lysuavhengig reaksjon = karbonfiksering
E N D
Karbonfiksering Calvin syklus Fotosyntetisk karbohydratsyntese Winnie Eskild, IMBV 2004
Karbonfiksering • Fotosyntesen har en lysavhengig og en lysuavhengig reaksjon • Lysavhengig reaksjon = fotosyntesen • Produserer NADPH og ATP basert på lysenergi • Lysuavhengig reaksjon = karbonfiksering • Produserer 3C-atom forbindelser basert på CO2 og NADPH/ATP • Lysuavhengig reaksjon er et relativt begrep Reaksjonen er avhengig av NADPH/ATP som er avhengig av lys
Fotosyntetisk karbohydratsyntese • Syntese av karbohydrater med CO2 som substrat finner bare sted i fotosyntetiske organismer; autotrofe • Andre organismer må ha tilgang på karbonforbindelser med lavere oksidasjonstrinn; heterotrofe • Inkorporering av CO2 finner sted i disse organismer (glukoneogenese, fettsyresyntese, urea syklus) men fungerer bare som en aktiveringsmekanisme og CO2 fraspaltes igjen
Karbonfiksering foregår i kloroplasten • Karbonfiksering foregår i stroma • Fotosyntesen foregår i thylakoide membranen => protongradient • Protongradienten driver ATP syntesen som fører til dannelse av ATP på utsiden av thylakoidemembranen
Karbonfiksering er en 3-trinnsyklus Karbonfiksering kalles Calvin syklus etter oppdageren Den foregår i 3 trinn og er en reell syklus 1) Fiksering av CO2 og dannelse av 3-fosfoglyserat 2) Reduksjon av 3-fosfoglyserat til glyceraldehyd-3-fosfat 3) Regenerering av ribulose-1,5-bisfosfat som er CO2 mottaker
Trinn 1: Fiksering av CO2 • Hvert av 3 molekyler ribulose-1,5-bisfosfat reagerer med CO2 og omdannes til en 6C-atom forbindelse • Denne 6C-atom forbindelse spaltes i to 3C-atom forbindelser slik at det blir 6 • Enzymet er ribulose-1,5-bisfosfat karboksylase med trivialnavnet rubisco
Rubisco • Rubisco er et stort enzym-kompleks, MW 550 kDa • I planter består det av 8 store subenheter (MW 53 kDa) og 8 små subenheter (MW 14 kDa) • I fotosyntetiske bakterier finner en bare to subenheter med MW ca 53 kDa • I kloroplast stroma forekommer rubisco i 250 mg/ml og utgjør 50% av proteinmengden i kloroplasten • Rubisco er det enzym som forekommer i størst mengde i biosferen
Trinn 2: Reduksjon av 3-fosfoglyserat • Først fosforyleres 3-fosfo-glyserat på C-atom 1 av 3-fosfoglyserat kinase. Her leverer ATP fosfatgruppen og vi får dannet 1,3-bisfosfoglyserat • Neste reaksjon er en reduksjon og en defosforylering av 1,3-bis-fosfoglyserat. Enzymet er glyseraldehyd-3-fosfat dehydrogenase og NADPH leverer de reduserende ekvivalentene
Trinn 3: Regenerering av ribulose-1,5-bisfosfat • Vi har nå 6 molekyler glyseraldehyd-3-fosfat, dvs 18 C-atomer • Av disse trenger vi 15 C-atomer for å regenere 3 molekyler ribulose-1,5-bisfosfat • 1 av de 6 glyseraldehyd-3-fosfat molekylene tas ut. Dette representerer nettoutbyttet av én runde i Calvin syklus • De resterende 5 går inn i en serie prosesser som resulterer i dannelse av 3 ribulose-1,5-bisfosfat
Stroma:Lagring som stivelse Glyseraldehyd-3-fosfat isomeriseres til dihydroksyacetonefosfat og kondenseres til fruktose-1,6-bisfosfat Fru-1,6-bisP defosforyleres og isomeriseres til glc-1-P for deretter å bli polymerisert til stivelse Stivelse lagres som korn i stroma Cytosol: Energi eller sukrose Glyseraldehyd-3-fosfat isomeriseres til dihydroksyacetonefosfat og overføres til cytosol Her kan det reisomeriseres til glyseraldehyd-3-fosfat og gå inn i glykolysen for energiproduksjon Glyseraldehyd-3-fosfat og dihydroksy-acetonefosfat kan kondenseres til fruktose-1,6-bisfosfat Etter defosforylering til fru-6-P og isomerisering av halvparten av molekylene til glc-6-P kan disse konden-sere til sukrose og transporteres rundt i planten Utnyttelse av glyseraldehyd-3-fosfat
Regenerering av ribulose-1,5-bisfosfat • Foregår i stroma i kloroplasten • Denne serie av reaksjoner likner mye på en omvendt pentosefosfatvei • To enzymer står sentralt: Transaldolase og transketolase • Transaldolase kopler 3C-enheter i ketoseform til 3C-enheter i aldoseform • Transketolase flytter 2C-enheter i ketoseform til en aldose • Rearrangeringen av C-atomer skjer innen rammene av visse begrensninger: • Intet molekyler kan være mindre enn 3 C-atomer • Intet molekyler kan være større enn 7 C-atomer
Regenerering av ribulose-1,5 bisfosfat • Glyseraldehyd-3-fosfat isomeriseres til dihydroksyacetonefosfat av enzymet triosefosfat isomerase • Glyseraldehyd-3-fosfat kondenseres med dihydroksyacetonefosfat og fører til dannelse av fruktose-1,6-bisfosfat. Enzymet er transaldolase • Reaksjonen er lik den vi finner i glykolysen hvor den går i motsatt retning • Både isomerasen og transaldolasen er isoenzymer av glykolyseenzymene i cytosol transaldolase + C3 + C3 C6
Regenerering av ribulose-1,5 bisfosfat • Fruktose-1,6-bisfosfat hydrolyseres av enzymet fruktose-1,6-bisfosfatase og det dannes fruktose-6-fosfat • Enzymet er isoenzym av det tilsvarende i glukoneogenesen
Regenerering av ribulose-1,5 bisfosfat • C-atom 1 og 2 i fruktose-6-fosfat overføres til glyseraldehyd-3-fosfat • Resten av fruktose-6-fosfat blir til erythrose-4-fosfat • Glyseraldehyd-3-fosfat omdannes til xylulose-5-fosfat • Enzymet er transketolase som benytter tiaminpyrofosfat som kofaktor • TPP er bæreren av 2C-atom gruppen C3 + C6 + + C5 + C4
Transketolasereaksjonen • Transketolase overfører en 2C-gruppe fra en ketose til en aldose • TPP bærer 2C-gruppen
Regenerering av ribulose-1,5 bisfosfat • En ny glyseraldehyd-3-fosfat isomeriseres til dihydroksyacetonefosfat som deretter kondenseres med erythrose-4-fosfat • Det dannes seduheptulose-1,7-bisfosfat • Enzymet er transaldolase transaldolase + C3 + C4 C7
Regenerering av ribulose-1,5 bisfosfat • Seduheptulose-1,7-bisfosfat hydrolyseres til sedoheptulose-7-fosfat • Enzymet er sedoheptulose-7-fosfatase
Regenerering av ribulose-1,5 bisfosfat • Fra sedoheptulose-7-fosfat overføres C-atom 1 og 2 til glyseraldehyd-3-fosfat • Enzymet er transketolase, TPP er kofaktor • Resten av sedoheptulose-7-fosfat blir til ribose-5-fosfat • Glyseraldehyd-3-fosfat blir omdannet til xylulose-5-fosfat C5 + C5 C7 + C3
Regenerering av ribulose-1,5 bisfosfat • De to xylulose-5-fosfat epimeriseres til ribulose-5-fosfat • Enzymet er ribose-5-fosfat epimerase • Ribose-5-fosfat isomeriseres til ribulose-5-fosfat • Enzymet er ribose-5-fosfat isomerase • Nå er det dannet 3 stk ribulose-5-fosfat • Disse fosforyleres av ribulose-5-fosfat kinase og vi får dannet ribulose-1,5-bisfosfat • Enzymet er det andre unike plante-enzym som gjør karbonfiksering mulig • Denne fosforylering krever ATP
Hva koster en triosefosfat • Nettoreaksjon: 3 CO2 + 3 H2O + 9 ATP + 6 NADPH glyseraldehyd-3-fosfat + 9 ADP + 6 NADP+ + 6 H+ + 8 Pi • Det koster altså 9 ATP +6 NADPH som kommer fra fotosyntesen • Et uorganisk fosfat innkorporeres i glyseraldehyd-3-fosfat og må erstattes for at alle ATP kan regenereres • Kunstgjødsel består bl.a.fosfat