530 likes | 818 Views
P ürinler. P i rimidin ler. Şeker. Pento z (5-C şeker). Nükleozit. N ük leoti d. Pürin ve primidin bazlarının katabolizması ve yeniden kullanımı. mavi - katabolizma kırmızı-salvaj yolu. endonu k lea zlar : pan k reati k RNAse pan k reati k DN Ase Fosfodiesterazlar:
E N D
Pürinler Pirimidinler
Şeker • Pentoz (5-C şeker)
Pürin ve primidin bazlarının katabolizması ve yeniden kullanımı mavi-katabolizma kırmızı-salvaj yolu endonukleazlar: pankreatik RNAse pankreatik DNAse Fosfodiesterazlar: Genellikle non-spesifik
PRPP sentetaz (-) AMP, ADP, GDP
Transformilasyon reaksiyonları multiprot. kompleksi tarafından katalizlenir Kompleksin bileşenleri: GAR transformylase (4) AICAR transformylase (10) serine hydroxymethyl transferase, trifunctional formylmethenyl-methylene-THF synthase (activities shown with asterisk)
AMP ve GMP den ATP ve GTP oluşumu Spesifik kinazlar GMP + ATP <-------> GDP + ADP Guanilat kinaz AMP + ATP <-------> 2 ADP Adenilat kinaz Nukleozit difosfat kinaz (NDK) enziminin katalizlediği reaksiyon ile trifosfatlara dönüşüm: GDP + ATP <------> GTP + ADP
GMP redüktaz GMP IMP (+) (-) GTP XMP AMP deaminaz AMP IMP (-) (+) K+, ATP Pi, GDP, GTP
AMP + H2O IMP + NH4+(AMP Deaminase) IMP + Aspartate + GTP AMP + Fumarate + GDP + Pi(Adenylosuccinate Synthetase) İki reaksiyonun toplamı: Aspartate + H2O + GTP Fumarate + GDP + Pi+ NH4+ İki reaksiyonun birleşimi GTP harcanarak aspartatın fumarata deaminasyonudur
Purin Nükleotid Döngüsü Net: Asp+GTP+H2ONH3+GDP+Pi+fumarate
Purinlerin salvaj yolu: Hipoksantin-guanin fosforibozil transferaz (HGPRT) HGPRT Hipoksantin + PRPP IMP + PPi APRT Adenin + PRPP AMP + PPi APRT: Adenin fosforibozil transferaz
UTP 3 basamakta CTP ye dönüşür UMP + ATP UDP + ADP + Pi1 UDP + ATP UTP + ADP + Pi2 Nükleozit monofosfat kinaz Nükleozit difosfat kinaz
Bir enzyme, ribonucleotide reductase, tüm ribonucleotidleri deoxyribo türevlerine dönüştürür. Serbest radical mekanisması ribonucleotide reductase reaksiyonunda rol alır. Doğada 3 sınıf ribonucleotide reductase var Class I: tyrosine radikal, NDP kullanır Class II: adenosylcobalamin. NTP kullanır (cyanobacteria, bacteria, Euglena). Class III: SAM and Fe-S radical, NTP ları kullanır. (anaerobes and fac. anaerobes).
KAP Sentetaz II allosterik olarak kontrol edilir • (Ökaryotlarda kontrol basamağı) • PRPP ve IMP aktivatör • Bazı primidinler inhibitör • Aspartat transkarbamoilaz prokaryotlarda kontrol basamağı
Fe-içeren ribonükleozit difosfat redüktaz ribonükleozit difosfatları karşılık gelen deoksiribonükleotidlerine indirger: NDP dNDP
Timidilat sentaz ve tetrahidrofolat metabolizması enzimleri arasındaki ilişki
Thioredoxin and glutaredoxin okside RR yi indirger NDP indirgenmesi için electron transfer yolu
RR is feedback yoluyla düzenlenir. Herhangibir dNTP nin bulunmaması öldürücüdür vefazla bulunması da DNA ya hatalı nükleotid eklenmelerine neden olur
dUMP metil vericisi olarak methylene-tetrahydrofolate kullanılarak thymidine synthetase enzimi ile dTMP ye dönüştürülür. Bu rxn. THF ın hem karbon vericisi hem de indirgeyici ajan olarak kullanıldığı bilinen tek rxn. dur.
Primidinlerin katabolizması Primidinlerokside olmak yerine indirgenirler
dUMP nin metilasyonu dTMP oluşturur • Deoksitimidilat (dTMP) ( DNA sentezi için gerekli) UMP den 4 basamakta oluşur UMP UDP dUDP dUMP dTMP
İnsan dihydrofolate reductase (DHFR) • Metatroksat (kırmızı) DHFR enzimini inhibe eder • NADHP kosubstrattır (sarı)
Purin Katabolisması (deoksi) ribozdan bazın ayrılması • Purine-nucleoside phosphorylase (PNP) separates the free purine base from the ribose (or deoxyribose) (Deoxy)Nucleoside + Pi Base + (Deoxy)-a-D-Ribose 1-phosphate
Timin oluşumu • deoxyuridine monophosphate (dUMP) ın metilasyonu ile oluşur • UTP RNA sentezi için gerekli • dUTP dUTPase (dUTP difosfohidrolaz) ile dUMP ye hidroliz edilir dUMP C5de metillenir ve dTMP oluşur dTMP dTTP oluşturmak üzere yeniden fosforile edilir