370 likes | 923 Views
TÉCNICAS MOLECULARES UTILIZADAS EN EL DIAGNÓSTICO GENÉTICO I. Mapas de restricci ó n. Marcadores moleculares: RFLP, SSLP, VNTR (minisat é lites y microsat é lites), SNP. Secuenciaci ó n. Hibridación. Obtención de sondas. Transferencia Northern y Southern. ADNc. PCR. Microarray.
E N D
TÉCNICAS MOLECULARES UTILIZADAS EN EL DIAGNÓSTICO GENÉTICO I. Mapas de restricción. Marcadores moleculares: RFLP, SSLP, VNTR (minisatélites y microsatélites), SNP. Secuenciación. Hibridación. Obtención de sondas. Transferencia Northern y Southern. ADNc. PCR. Microarray.
TÉCNICAS DE GENÉTICA MOLECULAR • FRAGMENTACIÓN DEL ADN • CLONACIÓN • AMPLIFICACIÓN DEL ADN • SECUENCIACIÓN DEL ADN • HIBRIDACIÓN DE ÁCIDOS NUCLÉICOS
CLONACIÓN EN PROCARIOTAS • Aislar y multiplicar en tubo de ensayo un determinado gen o, en general, un trozo de ADN
ADN donante Vector recombinante con el inserto 1 o 2
IDENTIFICACIÓN DE LAS BACTERIAS RECOMBINANTES RESISTENCIA A ANTIBIÓTICOS: El plásmido que contiene el gen de la proteína de interés también contiene un gen de resistencia a un antibiótico BACTERIAS “COLOREADAS”: El gen de nuestra proteína se inserta en el plásmido interrumpiendo al gen de una enzima que produce color azul
TIPOS DE GELES • POLIACRILAMINA: para fragmentos de ADN menores de 500 nucleótidos • AGAROSA: para fragmentos de ADN mayores de 500 nucleótidos • CAMPO PULSANTE (agarosa): fragmentos grandes de ADN, incluso cromosomas completos
SECUENCIACIÓN DE UN FRAGMENTO PURIFICADO DE ADN * Método Enzimático de Sanger * Método Químico de Maxam y Gilbert
MÉTODO ENZIMÁTICO DE SANGER • Síntesis in vitro de ADN en presencia de nucleótidos trifosfato terminadores de cadena A C G T A C G T Autorradiografía (300 nt) Secuenciador Automático (+700 nt)
HIBRIDACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS La hibridación se produce sólomente entre cadenas complementarias
HIBRIDACIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS SONDA: secuencia conocida de ADN o de ARN que es complementaria a la secuencia de interés y que se apareará con ella; se utiliza para localizar secuencias específicas de ADN
SONDAS • Marcaje de fragmentos de ADN: • sondas altamente marcadas • sondas marcadas en 5´ • Tipo de marcaje: • radiactivo: p32 • químico: fosfatasa alcalina, biotina, etc.
SONDAS Altamente Marcadas Marcadas en 5´ Marcaje de fragmento de DNA (Obtención de sondas): Sondas altamente marcadas o marcadas en 5´. Marcaje radiactivo o químico.
En un corte histológico para detectar la expresión de un gen concreto. Localiza los ARNm en las posiciones precisas que ocupan en las células o tejidos Hibridación “in situ”
MARCADOR MOLECULAR Sitio de heterocigosidad de ADN, no asociado necesariamente a una variación fenotípica, que se utiliza como una etiqueta de un locus cromosómico particular • SNP (polimorfismo de un solo nucleótido): sustitución de un nucleótido por otro • SSLP (polimorfismos en la longitud de secuencias simples): variación en el tamaño del fragmento por inserción/deleción • VNRT (número variable de repeticiones en tándem): • Minisatétiles (centrómeros y telómeros) • Microsatétiles (distribuidos por todo el genoma)
RFLP (polimorfismo en la longitud de los fragmentos de restricción): Método para la detección de los distintos polimorfismos, mediante la utilización de enzimas de restricción LOS POLIMORFISMOS SE COMPORTAN COMO ALELOS (dos alelos por individuo)
ER ER ER DETECCIÓN DE SNPs MEDIANTE RFLP 1, 1 1, 2 2, 2 1 ER ER 2 SNP
ER ER ER ER ER ER ER DETECCIÓN DE SNPs MEDIANTE RFLP 1, 1 1, 2 2, 2 1 ER 2 SNP
PADRE MADRE HIJO Padre Madre Hijo
1 2 1 DETECCIÓN DE VNTR MEDIANTE RFLP ER ER ER ER ER ER 2 ER ER