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酶促反应动力学. 是研究酶促反应的速率以及影响此速率的各种因素的科学。. 一、. 影响酶促反应速度的因素. 二.底物浓度对酶促反应速度的影响. 1903年, Henri 用蔗糖酶水解蔗糖的实验. 在低底物浓度时, 反应速度与底物浓度成正比,表现为一级反应特征。 当底物浓度达到一定值,反应速度达到最大值( V max), 此时再增加底物浓度,反应速度不再增加,表现为零级反应。. (一) 酶与底物的中间络合物学说 ( Henri 和 Wurtz). 该学说认为当酶催化某一化学反应时,酶首先和底物结合生成中间复合物( ES), 然后生成产物( P), 并释放出酶。
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酶促反应动力学 是研究酶促反应的速率以及影响此速率的各种因素的科学。
影响酶促反应速度的因素 二.底物浓度对酶促反应速度的影响 1903年,Henri 用蔗糖酶水解蔗糖的实验 • 在低底物浓度时, 反应速度与底物浓度成正比,表现为一级反应特征。 • 当底物浓度达到一定值,反应速度达到最大值(Vmax),此时再增加底物浓度,反应速度不再增加,表现为零级反应。
(一)酶与底物的中间络合物学说(Henri和Wurtz)(一)酶与底物的中间络合物学说(Henri和Wurtz) 该学说认为当酶催化某一化学反应时,酶首先和底物结合生成中间复合物(ES),然后生成产物(P),并释放出酶。 S+E ES P+E
(二)酶促反应的动力学方程式 Ks k S+E ES P+E 1913年前后,Michaelis和Menten在前人工作的基础上,假定 S+E ES 快速建立平衡,底物浓度远远大于酶浓度,ES分解产物的逆反应忽略不计,推导出下列方程: 米氏方程
1.米氏方程的推导 • 在Michaelis和Menten的酶促反应动力学基础上,1925年,Briggs和Haldane提出酶反应分两步进行,即“稳态平衡”理论: 所谓稳态是指反应进行一段时间后,系统的复合物ES浓度,由零逐渐增加到一定数值,在一定时间内,尽管底物浓度和产物浓度不断地变化.复合物ES也在不断地生成和分解,但是当反应系统中ES的生成速率和ES的分解速率相等时,络合物ES浓度保持不变的这种反应状态称为稳态,即: 第一步: 第二步: ES的浓度与(1)(2)都有关系 [E]为酶的总浓度 [ES]为中产物浓度 [E]-[ES]为游离酶浓度 [S]为底物浓度 由于[S][E]所以 [S]-[ES][S] (1) (2) ES的形成速度为: (3) (4) ES的分解速度:
在稳态下,ES的生成速率和ES的分解速率相等,即[ES]保持动态平衡:在稳态下,ES的生成速率和ES的分解速率相等,即[ES]保持动态平衡: 因为酶反应速率 与[ES]成正比,即: 由干反应系统中[S]>>[E],当[S]很高时所有的酶都被底物所饱和形成ES,即[E]=[ES],酶促反应达到最大速率 ,则: 米氏方程
当[S]Km时,v=Vmax/Km[S] 当[S]Km时,v=Vmax 当[S]=Km时,v=Vmax/2 所以,Km的物理意义是: 米氏常数是当酶反应速率达到最大反应速率的一半时的底物浓度。 • 因此,米氏常数的单位为mol/L。
2.动力学参数的意义 (1)米氏常数的意义 ①Km是酶的一个重要的特征常数。 只与酶的性质有关,而与其浓度无关。Km值只是在固定的底物,一定的温度和pH条件下,一定的缓冲体系中测定的,不同条件下具有不同的Km值。 Km值可用来鉴别酶。 ②Km值可以判断酶的专一性和天然底物。 有的酶可作用于几种底物,因此有几个Km 值,同一种酶有几种底物就有几个Km值,其中Km值最小的底物一般称为该酶的最适底物或天然底物。1/Km值可近似地表示酶对底物亲和力的大小, 1/Km值大表示亲和程度大,酶的催化活性低; 1/Km值小表示亲和程度大,酶的催化活性高。 可判断酶的专一性。
③Km与KsKm不等于Ks 。在K3<<K1、K2时, Km看作Ks,也只有此时1/Km 才可以近似表示酶与底物结合的难易程度。 Km= 所以1/Km表示形成ES的趋势大小 特例: Km=K2/K1=Ks(在K3K2时)
④若已知某个酶的Km值,可以计算在某一个底物浓度时,反应速率相当于最大反应速率Vmax的百分率。④若已知某个酶的Km值,可以计算在某一个底物浓度时,反应速率相当于最大反应速率Vmax的百分率。 如:[S]=3Km时,根据: 则: ⑤Km可以帮助推断某一反应的方向和途径
A.判断可逆反应方向的效率,了解其主要催化方向A.判断可逆反应方向的效率,了解其主要催化方向 肌酸+ATP 磷酸肌酸+ADP Km (mol/L) B.可推断连锁反应的限速步骤 Km (mol/L) 酶1 10-2 酶2 10-3 酶3 10-4
C.可推断多酶体系中的优势途径 Km=1.7x10-5mol/L Km=1.3x10-3 mol/L Km=1.0x10-3mol/L 丙酮酸 乳酸 乳酸脱氢酶 丙酮酸脱氢酶 乙酰CoA 丙酮酸脱羧酶 乙醛
(2)Vmax和 的意义 在一定酶浓度下,酶对特定底物的Vmax也是一个常数。同一种酶对不同底物的Vmax 也不同,pH、温度和离子强度等因素也影响Vmax 的数值。 当[S] 很大时, 成线性关系,而直线的斜率为 ,为一级反应速率常数,它表示当酶被底物饱和时每秒钟每个酶分子转换底物的分子数,这个常数又叫做转换数(简称TN),通称为催化常数 。 值越大,表示酶的催化效率越高。
3. 利用作图法测定Km和Vmax 1 Km 1 1 = + VVmax [S] Vmax
a.双倒数作图法(Lineweaver-Burk) 斜率=Km/Vmax -1/Km 1/Vmax
将米氏方程改写: b. v-v/[S]作图法(Eadie-Hofstee) Vmax Vmax/Km
1 Km 1 1 = + VVmax [S] Vmax c.Hanes-Woolf作图法
d. Eisenthal和Cornish-Bowden直接线性作图 将米氏方程改写为:
(三)多底物的酶促反应动力学 1.酶促反应按参加的底物数目来分 分单底物、双底物和三底物反应,最重要的是双底物反应。 2.按动力学机制来分 (1)序列反应——底物的结合和产物的释放有一定的顺序,产物不能在底物完全结合前释放。A和B两底物均结合到酶上,然后反应产生两产物P和Q。 序列反应分两类:有序反应和随机反应
①有序反应——底物按照一定的顺序与酶结合,形成三元复合物,然后按照一定的顺序释放反应的产物。①有序反应——底物按照一定的顺序与酶结合,形成三元复合物,然后按照一定的顺序释放反应的产物。 需要NAD或NADP的脱氢酶属于这种类型,这些脱氢酶的一般反应为: 优先底物A 随后底物B 随后产物Q 优先产物P
以乙醇脱氢酶为例: 底物B 底物A AEB PEQ 产物Q 产物P
②随机反应——两底物随机地与酶结合,形成三元复合物,产物的释放也是随机的。②随机反应——两底物随机地与酶结合,形成三元复合物,产物的释放也是随机的。
以肌酸激酶为例: 肌酸(Cr) + ATP 磷酸肌酸+ADP
(2)乒乓反应——酶与领先底物A的反应产物(P)在酶与第二个底物B反应之前释放出来,结果酶E转变为一种修饰酶形式E’,然后再与底物B反应生成第二个产物Q,同时释放出未被修饰的酶E。(2)乒乓反应——酶与领先底物A的反应产物(P)在酶与第二个底物B反应之前释放出来,结果酶E转变为一种修饰酶形式E’,然后再与底物B反应生成第二个产物Q,同时释放出未被修饰的酶E。 氨基转移酶属于这类作用机制
双底物反应的动力学方程 (1)乒乓机制的动力学方程和动力学图 对上式取双倒数,得下式:
(2)序列机制的动力学方程和动力学图 对上式取双倒数,得下式:
(抑制剂对酶反应速度的影响) 三.酶的抑制作用 抑制作用与抑制剂 凡使酶的活性降低或丧失,但并不引起酶蛋白变性的作用称为抑制作用(inhibition)。 能够引起抑制作用的化合物则称为抑制剂(inhibitor)。(抑制剂不同于变性剂) (一) 抑制程度的表示方法 加入抑制剂后的反应速率 不加抑制剂时的反应速率
(二) 抑制作用的类型 包括不可逆抑制作用(irreversible inhibition)和可逆抑制作用(reversible inhibition)。 1. 不可逆抑制作用(irreversible inhibition) 抑制剂与酶蛋白中的必需基团以共价键形式结合,引起酶的永久性失活,不能用透析或超滤等物理方法除去抑制剂而恢复酶活性。 专一性不可逆抑制作用:这类抑制剂只作用于与酶活性部位有关的氨基酸残基或一类酶。 非专一性不可逆抑制作用:这类抑制剂作用于酶分子上不同的基团或作用于几类不同的酶。如:酰化剂酸酐和磺酰氯等可使酶蛋白的-OH、SH、NH2等发生酰化。
2. 可逆抑制作用(reversibleinhibition)抑制剂与酶蛋白以非共价键方式结合,引起酶活性降低或暂时性丧失。抑制剂可以通过透析等方法被除去,并且能部分或全部恢复酶的活性。根椐抑制剂与酶结合的情况,又可以分为三类 竞争性抑制(competitive inhibition) 非竞争性抑制(noncompetitive inhibition ) 反竞争性抑制(uncompetitive inhibition )
(1)竞争性抑制(competitive inhibition) • 某些抑制剂的化学结构与底物相似,因而能与底物竞争与酶活性中心结合。当抑制剂与活性中心结合后,底物被排斥在反应中心之外,其结果是酶促反应被抑制了。 竞争性抑制通常可以通过增大底物浓度, 即提高底物的竞争能力来消除。
(2) 非竟争性抑制(noncompetitive inhibition ) • 酶可同时与底物及抑制剂结合,即底物和抑制剂没有竞争作用。酶与抑制剂结合后,还可与底物结合;酶与底物结合后,也可再结合抑制剂,但是三元的中间产物不能进一步分解为产物,所以酶活性降低。 如某些金属离子(Cu2+、Ag+、Hg+、Pb2+等)通常能与酶分子的调控部位中的-SH基团作用,改变酶的空间构象,引起非竞争性抑制;EDTA结合金属离子引起的抑制作用也属于非竞争性抑制。 非竞争性抑制剂与酶活性中心以外的基团结合。这类抑制作用不会因提高底物浓度而减弱
(3) 反竞争性抑制(uncompetitive inhibition ) • 酶只有与底物结合后才与抑制剂结合,从而导致酶活性下降。这类抑制作用最不重要。
(三)可逆抑制作用和不可逆抑制作用的鉴别 1.物理方法 用透析、超滤或凝胶过滤等物理方法区别。 2.动力学方法 ①在测定酶活力的系统中加入一定量的抑制剂,然后测定不同酶浓度的反应初速率。
②在测定酶活力的系统中加入不同浓度的抑制剂,然后测定不同酶浓度的反应初速率。②在测定酶活力的系统中加入不同浓度的抑制剂,然后测定不同酶浓度的反应初速率。
(四)可逆抑制作用动力学 1. 竞争性抑制 • 加入竞争性抑制剂后,Km 变大,酶促最大反应速度不变。
2.非竞争性抑制 • 加入非竞争性抑制剂后,Km 不变,而Vmax减小。
3.反竞争性抑制 加入反竞争性抑制剂,使Km和Vmax均减小
(五)一些重要的抑制剂 1.不可逆抑制剂 (1)非专一性不可逆抑制剂 ①有机磷化合物—与酶活性直接有关的丝氨酸上的-OH牢固地结合,从而抑制某些蛋白酶或酯酶。(DFP、敌百虫、敌敌畏、农药1605等)