1 / 18

Penanda Genetik

Penanda Genetik. Sebuah alel , sebuah band pada gel atau sifat / karakter yang berfungsi sebagai probe secara eksperimental untuk mengidentifikasi individual atau satu dari karakteristik individual. a measurable character that can detect variation in either a protein or DNA sequence.

reagan-lucas
Download Presentation

Penanda Genetik

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. PenandaGenetik Sebuahalel, sebuahbandpada gel atausifat/karakter yang berfungsisebagaiprobesecaraeksperimentaluntukmengidentifikasi individual atausatudarikarakteristik individual a measurable character that can detect variation in either a protein or DNA sequence

  2. Tipe genetic marker/penandagenetik • Morphological traits • Protein (biochemical) markers • - DNA (molecular) markers

  3. Hubungan fenotipe dan genotipe •Fenotipe – Trait-specific • Molecular markers/Penanda molekular – DNA or protein • Sekuen DNA – Allelic diversity • Ekspresi – RNA level

  4. Protein (biochemical) markers Protein marker biasanya disebut biochemical marker Berdasarkan pada migrasi properti protein yang dipisahkan dengan elektroforesis Dideteksi dengan assay histokimia yang spesifik Kelebihan: • Memerlukan peralatan yang relatif sederhana • Lebih robust dibandingkan penilaian variasi berdasarkan morfologi Kekurangan: • Terpengaruhi oleh lingkungan • Jumlah terbatas

  5. Isozyme Isozymes are charge isomers of metabolic proteins called enzymes

  6. Hillis, D.M., C. Moritz and B. K. Mable. 1996. Molecular Systematics, 2nd ed.  Sinauer Assoc. Inc., Sunderland, Mass Detection Dipisahkanmelalui electrophoresis pada gel pati Pewarnamengandungsubstratuntuk enzyme, cofactors, dan oxidized salt (dye) Menghasilkanpola yang disebutzymogram

  7. DNA (molecular) markers Merupakanpolimorfisme yang dideteksipadasekuen DNA padanukleusdanpadaorganel Keuntungan: • Tidakdipengaruhilingkungan • Jumlahtidakterbatas • Pengukurvariasi yang objektif Kekurangannya : perluteknik yang danalat yang lebihkompleks.

  8. TIPE DNA NUCLEAR ORGANEL – Mitochondrial DNA (mtDNA) – Chloroplast DNA (cpDNA)

  9. Tipe-tipemolekular markers RFLP RAPD AFLP SSR

  10. Aplikasi marker SSR

  11. Properti marker genetik yang baik: • Memiliki polimorfisme yang tinggi : bervariasi antar individual • - Dapat diulangi dengan hasil yang sama : di lab yang berbeda • - Kodominan : harus dapat mendeteksi bentuk yang berbeda dari marker, membedakan homosigot dan heterosigot • -Terdistribusikan secara merata di seluruh genom • Dapat membedakan: dapat mendeteksi perbedaan antara individu yang berkerabat dekat • Tidak tergantung pada lingkungan dimana individu hidup ataupun tahap perkembangan individu • -Tidak mahal : murah, mudah, cepat • - Mudah diukur

More Related