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第三章 生物信息的传递(上) —— 从 DNA 到 RNA. Contents. ● 基本概念 ● 转录起始: RNA 聚合酶、启动子 ● 转录的基本过程 ● 转录后加工 ● 原核生物与真核生物 mRNA 的特征比较 ● RNA 合成与 DNA 合成异同点. 转录. RNA. DNA. 一、 基本概念. 转录 (transcription) :. 生物体以 DNA 为模板合成 RNA 的过程 。. 参与转录的物质. 原料 : NTP (ATP, UTP, GTP, CTP) 模板 :DNA 酶 : RNA 聚合酶 其他蛋白质因子.
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Contents ● 基本概念 ● 转录起始: RNA聚合酶、启动子 ● 转录的基本过程 ● 转录后加工 ● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 ● RNA合成与DNA合成异同点
转录 RNA DNA 一、基本概念 转录(transcription) : 生物体以DNA为模板合成RNA的过程 。
参与转录的物质 原料: NTP (ATP, UTP, GTP, CTP) 模板:DNA 酶: RNA聚合酶 其他蛋白质因子 RNA合成方向:5' 3'
转录的不对称性: 在RNA的合成中,DNA的二条链中仅有一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性。 编码链与模板链 与mRNA序列相同的那条DNA链称为编码链;将另一条根据碱基互补原则指导mRNA合成的DNA链称为模板链。
转录方向 3 5 5 3 编码链 模板链 转录方向 模板链 编码链 模板链并非永远在同一条单链上 结构基因: DNA分子上转录出RNA的区段,称为结构基因。
转录单元(transcription unit) 一段从启动子开始至终止子结束的DNA序列。
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二、参与转录起始的关键酶与元件 (一) RNA聚合酶 ●原核生物RNA聚合酶(大肠杆菌为例) 全酶=核心酶+ σ因子
● 真核生物RNA聚合酶 真核细胞的三种RNA聚合酶特征比较
(二) 启动子(promoter) 启动子定义:指能被RNA聚合酶识别、结合并启动基因转录的一段DNA序列。
● 原核生物启动子结构 Pribnow 41-44bp
TATA区:酶的紧密结合位点(富含AT碱基,利于双链打开) TTGACA区:提供了RNA聚合酶全酶识别的信号
转录起始点 启动子 Probnow盒子 编码链 AACTGT ATATTA 3’ DNA 模板链 TATAAT 5’ TTGACA 转录区 3510+1 3’ 5’ RNA 转录起点 与新生RNA链第一个核甘酸相对应DNA链上的碱基。
大肠杆菌RNA聚合酶全酶所识别的启动子区 T89A89T50A65A100 T85T83G81A61C69A52
典型启动子的结构 -35 -10 转录起点 TTGACA 16-19bp TATAAT 5-9bp
● 真核生物启动子 真核有三种不同的启动子和有关的元件 启动子Ⅱ最为复杂,它和原核的启动子有很多不同
核心启动子(core promoter) 上游启动子元件(upstream promoter element,UPE) 真核生物启动子的结构
1、核心启动子 ●定义:指保证RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列,包括转录起始位点及转录起始位点上游TATA区 TATA 常在-25bp左右,相当于原核的-10序列 T85A97T93A85A63A83A50 ●作用:选择正确的转录起始位点,保证精确起始
2、上游启动子元件 ●包括CAAT盒(CCAAT)和GC盒(GGGCGG)等 CAAT:-70 - -80bp GGGCGG:-80 - -110bp ●作用:控制转录起始频率。
SV40 早期启动子 组蛋白H2B CAAT GC TATA
(三) 转录起始复合物 ● 原核生物转录起始复合物
● 真核生物转录起始复合物 转录因子 转录复合体 TBP TAFs TFIIA TFIIB TFIIF Pol II TFIIE RNA pol Ⅱ的转录起始
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三、转录的基本过程 1、起始位点的识别:RNA聚合酶与启动子DNA双链相互作用并与之相结合的过程。
RNA链上第一个核甘酸键的产生 2、转录起始
3、RNA链的延伸 ● 亚基脱落,RNA–pol聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着DNA模板前移; ●在核心酶作用下,NTP不断聚合,RNA链不断延长。
4、转录终止 终止子(terminator,t) ●强终止子-内部终止子 ●弱终止子 -需要ρ因子(rho factor) 又称为ρ依赖性终止子 (Rho-dependent terminator) 不依赖Rho (ρ)因子的转录终止 依赖Rho (ρ)因子的转录终止
不依赖因子的终止 终止位点上游一般存在一个富含GC碱基的二重对称区,RNA形成发夹结构; 在终止位点前面有一段由4-8个A组成的序列,RNA的3’端为寡聚U
发夹式结构和寡聚U的共同作用使RNA从三元复合物中解离出来。发夹式结构和寡聚U的共同作用使RNA从三元复合物中解离出来。
依赖因子的终止 因子:六聚体蛋白、水解各种核甘三磷酸促使新生RNA链从三元转录复合物中解离出来,从而终止转录。
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5’端加帽 • 3’端加尾 • RNA的剪接 • RNA的编辑
1、在5’端加帽 5’端的一个核苷酸总是7-甲基鸟核苷三磷酸(m7Gppp)。mRNA5’端的这种结构称为帽子(cap)。
m7Gppp 鸟甘酸转移酶
帽子结构功能: ①能被核糖体小亚基识别,促使mRNA和核糖体的结合; ②m7Gppp结构能有效地封闭mRNA 5’末端,以保护mRNA免受5’核酸外切酶的降解,增强mRNA的稳定。
多聚腺苷酸尾巴 2、3’端加尾 AAUAAA: ★准确切割 ★加poly(A)
多聚腺苷酸尾巴功能: 提高了mRNA在细胞质中的稳定性。