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RFLPs. Electroforesis de RFLPs y su correspondiente patrón. RFLPs. AMOVA: Componentes de la varianza en nuestra especie para diferentes polimorfismos. Barbujani et al , 1997. RFLPs. Nei et al , 1996. STRs. Electroferograma de un microsatélite. STRs. Y-STRs. STRs. STRs.

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Presentation Transcript

  1. RFLPs Electroforesis de RFLPs y su correspondiente patrón

  2. RFLPs AMOVA: Componentes de la varianza en nuestra especie para diferentes polimorfismos Barbujani et al, 1997

  3. RFLPs Nei et al, 1996

  4. STRs Electroferograma de un microsatélite

  5. STRs Y-STRs

  6. STRs

  7. STRs Análisis de Structure para un grupo de STRs en diferentes poblaciones Rosenberg et al, 2002

  8. STRs Zhivotovsky et al 2003 Análisis de Coordenadas Principales para un grupo de STRs en diferentes poblaciones

  9. STRs Pérez-Miranda et al 2005 MDS para STRs en poblaciones de la cuenca mediterranea

  10. Frecuencias alélicas de genes PCR-SSP

  11. Frecuencias alélicas de genes

  12. Frecuencias alélicas de genes PCR-SSP

  13. Frecuencias alélicas de genes Sánchez-Mazas, 2001 MDS HLA-DPB1

  14. Frecuencias alélicas de genes Pérez-Miranda et al 2004 Algunas clinas HLA en Europa

  15. SNPs Detección de SNPs mediante secuenciación

  16. SNPs SNPs del cromosoma 5

  17. SNPs Genomic organization of CYP24A1 gene, location of genotyped SNPs, linkage disequilibrium between SNPs (with R2 indicated by bullet size)

  18. SNPs Asociación entre la variación en el gen fosfodiesterasa 4D y la densidad mineral del hueso. Cartografía fina a partir de 80 SNPs Reneland et al 2005

  19. SNPs Fig. 1. DNA sequence variation in the human genome D. Altshuler et al., Science 322, 881 -888 (2008)

  20. SNPs AFC realizado a partir de 749 SNPs en una serie de muestras europeas Seldin et al 2006

  21. ADN mitocondrial d-loop Esquema del ADN mitocondrial humano

  22. ADN mitocondrial Dispersión de los principales haplogrupos de ADN mt

  23. ADN mitocondrial Dendrograma de un grupo de primates a partir de ADN mt Gagneux et al 1999

  24. ADN mitocondrial MDS para un grupo de poblaciones a partir de ADN mt Alfonso-Sánchez et al 2006

  25. Inserciones Alu Proceso de inserción

  26. Inserciones Alu Esquema de una inserción

  27. Inserciones Alu Electroforesis de agarosa de varias muestras analizadas para una inserción Alu

  28. Inserciones Alu Watkins et al 2003 Dendrograma obtenido a partir de frecuencias de 100 inserciones Alu

  29. Inserciones Alu Mapa topogenético de una serie de poblaciones de la cuenca mediterránea García-Obregón et al 2006

  30. Inserciones Alu Poblaciones consideradas Gómez-Pérez et al 2007

  31. Inserciones Alu Europa Africa del Norte y Próximo Oriente América Medio Oriente Africa Subsahariana Este de Asia Análisis discriminante, MDS, Reynolds Gómez-Pérez et al 2007

  32. Bibliografía complementaria Alfonso-Sánchez et al 2006 Sequence polymorphisms of the mtDNA control region in a human isolate: the Georgians from Swanetia J Hum Genet 51:429-439 (JAP1309) Barbujani et al 1997 An apportionment of human DNA diversity. Proc Natl Acad Sci Usa 94:4516-4519 (JAP1305) García-Obregón et al 2006 Genetic Position of Valencia (Spain) in the Mediterranean Basin According to Alu Insertions American Journal of Human Biology 18:187-195 (JAP1093) Gagneux et al 1999 Mitochondrial sequences show diverse evolutionary histories of African hominoids Proc Natl Acad Sci 96:5077-5082 (JAP757) Gómez-Pérez, L., Alfonso-Sánchez, M.A., Pérez-Miranda, A.M., de Pancorbo, M.M., Peña, J.A., 2007, Utilidad de las inserciones Alu en los estudios de mestizaje, Antropo, 14, 29-36. www.didac.ehu.es/antropo Gresham et al 2001 Origins and Divergence of the Roma (Gypsies) Am J Hum Genet 69:1314-1331 (JAP1308) Kalaydjieva et al 2001 Genetic studies of the Roma (Gypsies): a review BMCMedical Genetics, 2:5 (JAP1307) Lovell et al 2005 Ethiopia: between Sub-Saharan Africa and Western Eurasia. Annals of Human Genetics. 69,275–287 Nei M, Takezaki N 1996 The Root of the Phylogenetic Tree of Human Populations Mol Biol Evol 13:170-177 (JAP1306) Pérez-Miranda A.M. Alfonso-Sánchez M.A. Vidales M.C. Calderón R. Peña J.A. 2004 Genetic polymorphism and linkage disequilibrium of the HLA-DP region in Basques from Navarre (Spain) Tissue Antigens 64: 264–275 (JAP1025) Pérez-Miranda et al 2005 Microsatellite data support subpopulation structuring among Basques J Hum Genet 50:403-414 Reneland et al 2005 Association between a variation in the phosphodiesterase 4D gene and bone mineral density BMC Medical Genetics 2005, 6:9 Rosenberg et al 2002 Genetic Structure of Human Populations Science 298:2381-2385 (JAP1020) Sánchez-Mazas A 2001 African diversity from the HLA point of view: Influence of genetic drift, geography, linguistics, and natural selection Human Immunology 62:937-948 (JAP861) Seldin et al 2006 European Population Substructure: Clustering of Northern and Southern Populations PLoS Genet. 2(9): e143 (JAP1164) Tishkoff et al 2007 Convergent adaptation of human lactase persistence in Africa and Europe Nature Genetics, 9 Watkins et al 2003 Genetic Variation Among World Populations: Inferences From 100 Alu Insertion Polymorphisms Genome Research 13:1607–1618 (JAP1101) Zhivotovskyet al 2003 Features of Evolution and Expansion of Modern Humans, Inferred from Genomewide Microsatellite Markers Am. J. Hum. Genet. 72:1171–1186 (JAP1160)

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