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第一章 孟德尔式遗传分析. 第一节 孟德尔第一定律及遗传分析 第二节 孟德尔第二定律及遗传分析 第三节 遗传学研究中的统计学原理. 第一节 孟德尔第一定律及遗传分析 . 一、孟德尔的植物杂交试验 及其成功的原因 二、孟德尔实验及分析 三、基因、基因型和表现型. 一、孟德尔的植物杂交试验 及其成功的原因. ( 一 ) 孟德尔的植物杂交试验 孟德尔简介 孟德尔的植物杂交试验. ( 二 ) 孟德尔成功的原因. 汲取了前人的经验教训 选择合适的试验植物 采用科学的研究方法.
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第一章 孟德尔式遗传分析 • 第一节 孟德尔第一定律及遗传分析 • 第二节 孟德尔第二定律及遗传分析 • 第三节 遗传学研究中的统计学原理 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
第一节 孟德尔第一定律及遗传分析 一、孟德尔的植物杂交试验 及其成功的原因 二、孟德尔实验及分析 三、基因、基因型和表现型 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
一、孟德尔的植物杂交试验 及其成功的原因 (一)孟德尔的植物杂交试验 • 孟德尔简介 • 孟德尔的植物杂交试验 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
(二)孟德尔成功的原因 • 汲取了前人的经验教训 • 选择合适的试验植物 • 采用科学的研究方法 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
(一)孟德尔分析的关键名词概念 1、性状、单位性状和相对性状 • 性状(character):生物的形态特征、生理特性、行为本能、代谢类型等方面的总称。例如豌豆种子的圆和皱、豌豆品种的早熟和晚熟都是性状,前者是形态性状,后者是生理性状。 • 单位性状(unit character ):豌豆种子的形状(圆和皱),植株的高矮,水稻的早晚熟等可以被区分开来的性状,似乎各是一个遗传单位,称为单位性状。 • 相对性状(contrasting character):同一单位性状在不同个体间表示出来的相对差异。如豌豆种子的圆和皱、植株的高矮、早熟和晚熟等。 相对性状是遗传学研究的基础,孟德尔就是用有明显差异的7对相对性状进行杂交实验。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
2、遗传因子(hereditary determinant, factor) 在遗传分析中,孟德尔用来代表某一性状的符号,如豌豆种子的 圆(R)和皱 (r),用现代术语说既是基因。 3、基因(gene)和基因座(locus) 染色体上有特定的核苷酸顺序的DNA片段,是储存遗传信息的功能单位。 基因在染色体上所处的位置。特定的基因在染色体上有其特定的座位 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
4、等位基因(alleles):在同源染色体上占据相同坐位 的两个不同形式的基因,是由突变造成的许多可能的状态之一。 5、显性基因(dominant gene)和隐性基因(recessive gene):显性基因是在杂合状态中能够表现其表型状态的基因,一般以大写字母表示;隐性基因是在杂合状态中不能够表现其表型状态的基因,一般以小写字母表示。 6、基因型(genotype)和表现型(phenotype): 基因型是个体或细胞特定的基因组成; 表现型是生物体某特定基因所表现的性状(形态特征、化学产物、行为特性等) Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
7、杂合体(heterozygote)和纯合体(homozygote):基因座上有两个不同的等位基因(基因 异质结合)称为杂合体;基因座上有两个相同的等位基因(基因的同质结合)称为纯合体 8、回交(backcross)和测交(testcross):回交是杂交产生的子一代个体再与亲本进行交配的杂交方式;如果子一代是与隐性(双隐性)亲本杂交就特称为测交 9、真实遗传(true breeding ):子代性状永远与亲代相同的遗传方式 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
(二)、一对相对性状杂交实验的遗传表现 • 试验材料:1857年,孟德尔买了34个豌豆品种,从中选出7对差异明显的相对性状的品种作实验材料:豆粒的圆和皱、子叶的黄和绿、种皮的褐和白、豆荚(jia )饱满和缢缩、嫩荚绿色和黄色、花顶生和腋生及高茎和矮茎。 孟德尔用这7对相对性状的品种作亲本(P,parent),分别成对的杂交,在子一代和子二代中分别出现了显性现象和分离现象 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
显性现象和分离现象 孟德 尔F1中表显出的亲本的性状叫显性性状(dominant character),F1中不显示出来的性状叫隐性性状(recessive character),这就是显性现象。 F1植株自交,F2中既有显性性状,也隐性性状,孟德尔称之为分离现象(segregetion)。而且一般显性性状的植株与隐性性状植株之比接近3:1。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
孟德尔杂交实验的结果 参考姚世鸿等(2001)
(三)分离现象的解释---孟德尔假设 P 高茎(DD)×矮茎(dd) 参考姚世鸿等(2001) D d 高茎(Dd) 1/2D 1/2d 1/2D 1/2d F1雄配子 F1 F1雌 配子 F2 基因型比 1DD :2Dd :1dd F2 表现型型比 3高茎(D-):1矮茎(dd)) 图1. 豌豆高茎×矮茎的遗传
(四)分离现象的验证 参考姚世鸿等(2001) • 孟德尔推论假设 • 如果上述假设是正确的,那么F1高豌豆与矮豌豆的测交结果应是: • 高茎(Dd)×矮茎(dd) 即测交后代应为高茎、矮茎各占一半。
如果上述假设是正确的,那么F2高、矮豌豆的自交结果应是:如果上述假设是正确的,那么F2高、矮豌豆的自交结果应是: • F21高茎(DD): 2高茎(Dd): 1 矮茎(dd) F3 全高茎; (2/3高茎;1/3矮茎 ); 矮茎 即F3中,F2高茎豌豆的后代有1/3全为高茎,2/3发生分离; F2矮茎豌豆的后代全是矮茎。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
孟德尔验证 • 测交实验结果 F1 (Dd)×矮茎(dd) 高茎(Dd): 矮茎(dd) 87 : 79
孟得尔自交实验结果-豌豆F2显性个体自交后代F3表型比例孟得尔自交实验结果-豌豆F2显性个体自交后代F3表型比例 参考姚世鸿等(2001) 单位性状 F3中全显性 F3中分离出隐性 总个体数 比例(1:2) 的个体数 性状的个体 种皮颜色 36 64 100 1:1.8 豆粒形状 193 372 565 1:1.93 子叶颜色 166 353 519 1:2.13 豆荚形状 29 71 100 1:2.45 嫩荚颜色 40 60 100 1:1.50 着花位置 33 67 100 1:2.03 植株高度 28 72 100 1:2.57
测交和自交验证的结果都证明孟得尔的假设是正确的。这样孟得尔就归纳出了分离定律。测交和自交验证的结果都证明孟得尔的假设是正确的。这样孟得尔就归纳出了分离定律。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
分离定律 子一代体细胞中,等位基因的两个成员保持相对独立性,在形成配子时完全按原样分离到不同配子中去。配子的分离比是1:1;F2基因型分离比是1:2:1;F2表型分离比是3:1。 分离出来的隐性纯合体与原来的隐性亲本在表型上完全一样,隐性基因并不因为曾和显性基因在一起而改变它的性质。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
(五) 分离定律在人类遗传中的运用 • 1、人类家系图中常用符号 • 2、人类多指家系图(显性遗传) • 3、人类一个白化家系(隐性遗传) Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
1、人类家系图中常用符号 参考姚世鸿等(2001) I、II为世代数 1、2为子女数 先症者 已死亡 X连锁隐性携带者 I 正常男人 正常女人 配偶 近亲婚配 二卵双生 一卵双生 患者 携带者 · II 1 2 ·
I 1 2 2、人类多指家系图(显性遗传) II 2 3 4 5 1 III 4 5 1 2 3 6 参考姚世鸿等(2001)
3、人类一个白化家系(隐性遗传) I II III IV 1 2 1 2 3 4 5 6 2 1 2 3 4 5 6 参考姚世鸿等(2001)
三、基因、基因型和表现型 基因(gene):丹麦遗传学家于1909年提出的替代孟德尔遗传因子的一个术语。他还提出了基因型和表现型的概念。 基因型(genotype):生物产生特定遗传性状的有关基因组成(肉眼看不见,需杂交才能鉴定,如DD,Dd和dd)。 表现型(phenotype):生物个体特定基因型所表现出的性状,是基因型和环境共同作用的结果(如高茎、矮茎等)。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
基因型和表现型的关系 基因型确定表现型,但不同的基因型可以表现出相同的表型,如DD 、Dd都表现为高茎; 另一方面,相同的基因型在不同的环境下也可有不同的表型,如 在某作物中A决定生成叶绿素,a不生成叶绿素, A对a是显性;A_ 是绿色,aa 是白色,但A_仅在有光时表现为绿色,在无光时表现为白色,而aa,无论是否有光都表现为白色。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
第二节 遗传因子的自由组合 • 一、两对相对形状的杂交实验 • 二、自由组合现象的解释 • 三、自由组合现象的验证 • 四、多对相对性状杂交实验的遗传 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
一、两对相对形状的杂交实验 P 黄色圆形 × 绿色皱缩 F1黄色圆形 F2黄色圆形 黄色皱缩 绿色圆形 绿色皱缩 实得豆粒数 315 101 108 32 理论数 313 104 104 35 比 例 (9/16) (3/16) (3/16) (1/16) 参考姚世鸿等(2001)
二、自由组合现象的解释 P YYRR(黄圆 )×yyrr(绿皱) YR yr F1配子 YyRr(黄圆) 1/4YR 1/4Yr 1/4yR 1/4yr F1 1/4YR 1/4Yr 1/4yR 1/4yr F1配子 F2 参考姚世鸿等(2001)
三、自由组合假设的验证 • 测交验证 • 自交验证 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
F1 黄圆YyRr × P 绿皱yyrr 配子 YR Yr yR yr 预期基因型 YyRr Yyrr yyRr yyrr yr 预期表现型 黄圆 黄皱 绿圆 绿皱 预期比例 1 1 1 1 实验结果 55 49 51 52 双杂合体的测交理论预期值和实验结果 参考姚世鸿等(2001)
根据子二代豆粒的表型预期子三代的分离情况 参考姚世鸿等(2001) F2表型 F2基因型 F3的分离情况 1YYRR 不分离 2YYRr 圆皱要分离 9黄圆 9Y-R 2YyRR 黄绿要分离 4YyRr 两对性状都要分离 1YYrr 不分离 3黄皱 3Y-rr 2Yyrr 黄绿要分离 1yyRR 不分离 3绿圆 3yyR- 2yyRr 圆皱要分离 1绿皱 1yyrr 不分离
子二代自交所得的分离数据(实验数据) F2表型 F2植株数目 F3豆粒表型种类 参考姚世鸿等(2001) 从F3豆粒的表型看F2 基因型 频率 黄圆 38 全黄圆 YYRR 1 黄圆 65 黄圆、黄皱 YYRr 2 黄圆 60 黄圆、绿圆 YyRR 2 黄圆 138 黄圆、黄皱、绿圆、绿皱YyRr 4 黄皱 28 全黄皱 Yyrr 1 黄皱 68 黄皱、绿皱 Yyrr 2 绿圆 35 全绿圆 yyRR 1 绿圆 67 绿圆 yyRr 2 绿皱 30 绿皱 yyrr 1
四、多对相对性状杂交实验的遗传表现 P 黄圆红×绿皱白 F1黄圆红 F2 8种表型 比例是:27:9:9:9:3:3:3:1 参考姚世鸿等(2001)
杂交中基因对数与子二代分离比 参考姚世鸿等(2001) F1配子类型数 F2表型种类数 F2基因型种类数 F2表型分离比 F1 雌雄配子 可能组合数 基因对数 1 2 3 4 . . . n 2 4 8 16 . . . 2n 4 16 64 256 . . . 4n 2=21 4=22 8=23 16=24 . . . 2n 3=31 9=32 27=33 81=34 . . . 3n (3:1)1 (3:1)2 (3:1)3 (3:1)4 . . . (3:1)n
第三节 遗传学研究中的统计学原理 • 一、孟德尔遗传学中的概率 • 二、概率的概念和基本定理 • 三、遗传比率的推算 • 四、好适度测验 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
一、孟德尔遗传学中的概率 F2豆粒形状 F2豆粒颜色 F1株号 F1株号 圆 园的概率 黄 绿 皱 黄的概率 孟德尔实验中子一代单株后代的分离比和积加 1 45 12 0.789 1 25 11 0.694 2 27 8 0.782 2 32 7 0.760 3 24 7 0.780 3 14 5 0.756 4 19 10 0.757 4 70 27 0.738 5 32 11 0.754 5 24 13 0.724 6 26 6 0.762 6 20 6 0.728 7 88 24 0.770 7 32 13 0.726 8 22 10 0.763 8 44 9 0.741 9 28 6 0.768 9 50 14 0.748 10 25 7 0.769 10 44 18 0.743 253 54741850 0.747 253 6022 2001 0.751 参考姚世鸿等(2001)
从上表可以看出:只有当群体较大时,分离比才会接近3:1。从上表可以看出:只有当群体较大时,分离比才会接近3:1。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
二、概率的概念和基本定理 • 概率(probability):又称为几率或或然率。是指某一事件发生的机会和可能性的大小;即某一事件发生的次数在总事件中所占的比例。概率的数值在0~1之间。 • 乘法定理:两个或两个以上的独立事件同时出现的概率等于各自概率的乘积。 • 加法定理:两个事件相互排斥,非此即彼,则一事件或另一事件出现的概率是两个各别事件出现的概率之和。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
三、遗传比率的推算 • 1、棋盘法(qunnett square) • 2、分支法(brangching process) • 3、二项式展开和通项公式 • 二项式展开 • 通项公式 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
五、适合度测验(goodness of fit) 概念:测验实得比数与理论预期比数之间的符合程度,从而判断试验结果是否可用这个理论预期比数来说明。 常用的方法:卡平方(x2)法 公式:X2 = ∑ [(O-E)2 /E] ∑是总和符号;O是实际观察值;E是理论预期值;O-E是实际值与理论预期值的偏差,X2值就是平均偏差平方的总和。 实际观察值与理论预期值愈接近,X2值愈小,概率值愈大;反之,实际观察值与理论预期值偏离愈大,X2值愈大,概率值愈小。
X2表见教材p.32表1-12. • X2测验法的应用举例 、 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
例1. 黄色、圆形豌豆与绿色、皱缩豌豆杂交,子二代共得到556粒豆粒,其中黄圆315粒,黄皱101粒,绿圆108,绿皱32。孟德尔的这些观察值与理论9∶3∶3∶1的比率相符合吗? • 解:首先计算预期数: • 黄圆 556×9/16=5004/16=312.75; • 黄皱 556×3/16=1668/16=104.25; • 绿圆 556×3/16=1668/16=104.25; • 绿皱 556×1/16=556/16=34.75。 • 然后将观察数值与理论预期数值分别列入表1-13中,计算X2值。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
表1-13两对基因杂种后代的X2测验 黄 圆 黄 皱 绿 圆 绿 皱 总 数 实得数(O) 315 101 108 32 556 预期理论数(E) 312.75 104.25 104.25 34.75 556 偏 差D(O-E) 2.25 3.25 3.75 -2.75 D25.06 10.56 14.06 7.56 D2/E 0.016 0.10 0.13 0.22 0.47 X2=∑(D2/E)=0.016+0.10+0.13+0.22=0.47,n=4-1=3,查X2值表,p在0.90~0.95之间,即p>0.05,说明观察值与理论预期值的差异不显著,F2四种豆粒类型的观察值符合预期9∶3∶3∶1的分离比。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
例2.香豌豆 (Lathyrus odoratus) 的花冠有紫色与红色,花粉的形状有 长粒与圆粒。Bateson和Punnett用紫色圆形植株与红色长形植株杂交,F1都是紫花 长花粉,说明紫色、长形是显性。F1植株自花授粉得到F2,共计4种类型、419株。其中,紫花长形226株,紫花圆形95株,红花长形97株,红花圆形1株。此结果符合9∶3∶3∶1 的分离比吗? • 按以上方法先算出预期数,然后分别列入表1-14中,用X2测验确定它们是否符合9∶3∶ 3∶1的分离比。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
表1-14. 两对基因杂种后代的X2测验 紫长 紫圆 红长 红圆 总数 实得数(O) 226 95 97 1 419 预期数(E) 235.69 78.56 78.56 26.19 419 偏差D(O-E) -9.69 16.44 18.44 -25.19 D2 93.90 270.07 340.03 634.54 D2 /E 0.40 3.44 4.33 24.23 32.40 按以上的方法列表计算,得到X2值是32。4,N=4-1=3,查表得p小于0.01,表明差异极显著,实得的子二代四种类型的数值不符合9:3:3:1。实际上这是自由组合定律的首次例外,其机理将在第四章讨论。
习题:p.35 第8、9、12和14题。 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University
主要参考文献: • 姚世鸿,王景佑,陈庆富,主编,2001:遗传学。贵州人民出版社 Prof.XM Gu, Guizhou Normal University