180 likes | 267 Views
Mamaprint. Mammaprint. Mammaprint genexpressieprofiel Heeft alleen zin als je weet wat de functie van het gen is!!. Tumordiagnostiek. Zoek relevante genen: Groei Deling Differentiatie. Bijvoorbeeld. Oncogenen: Regulatie van celgroei en celdeling Tumorsuppressorgenen :
E N D
Mammaprint • Mammaprint genexpressieprofiel • Heeft alleen zin als je weet wat de functie van het gen is!!
Tumordiagnostiek Zoek relevante genen: • Groei • Deling • Differentiatie
Bijvoorbeeld Oncogenen: • Regulatie van celgroei en celdeling Tumorsuppressorgenen: • Genen die coderen voor eiwitten die celdeling stoppen
Kanker Ongecontroleerde deling Ontregeling door mutaties Kloon van abnormale cellen = tumor • Goedaardig lokaal • Kwaadaardig verspreiding (metastase)
Kanker • Doodsoorzaak nr 2 • Doodsoorzaak nr 1? • Hart en vaatziekten
DNA chip • Micro array: • Bekende genen in vaste volgorde op glasplaat
Genexpressieprofiel • Welke actieve genen • Info over: • Welk celtype is gaan woekeren • Tumorstadium • wat is de beste behandeling?
Micro array • Iedere positie bevat enkelstrengs oligonucleotide
Reverse transriptase • Maakt cDNA copy van mRNA • cDNA = enkelstrengs • Gelabeld met fluorochroom
Elke positie bevat oligonucleotideRepresentatief voor gen Binding met • cDNA van actief genmaakt mRNA
Indentificatie • Groen=Actieve genen in controleweefsel
Identificatie • Rood=Actieve genen in tumorweefsel
Identificatie • Genen die in beide weefsels actief zijn
Interpretatie • Vergelijken expressieprofiel controle + tumor weefsel