การใช้โปรแกรม ASReml V2.0 Discovery edition เพื่อการวิเคราะห์ค่าการผสมพันธุ์สัตว์

1. การใช้โปรแกรม ASReml V2.0 Discovery edition เพื่อการวิเคราะห์ค่าการผสมพันธุ์สัตว์ ดร.วุฒิพงษ์ อินทรธรรม นักวิชาการสัตวบาลเชี่ยวชาญ กลุ่มวิชาการปศุสัตว์ กรมปศุสัตว์

2. ความเป็นมา -โปรแกรม ASReml เป็นเพจเกจทางสถิติที่ได้พัฒนามาตั้งแต่ปี 1993 จากความร่วมมือระหว่างโปรแกรม Biometrics ของภาควิชา PrimaryIndustries มหาวิทยาลัย New South Wale กับภาควิชา Biomathematics และ Bioinformatics ของสถาบันวิจัย Rothamsted

3. ความเป็นมา -V1.0 พัฒนาโปรแกรมและมีการใช้จากปี 1993-ปลายปี2005 -V2.0 พัฒนาเสร็จสมบูรณ์ ในเดือนธันวาคม 2005 และมีการใช้ตั้งแต่เดือนมิถุนายน 2006-14 พฤศจิกายน 2008 -V3.0 พัฒนาเสร็จสมบูรณ์ ปลายปี 2008 และใช้มาจนถึงปัจจุบัน

4. ความเป็นมา -V2.0 เป็น free software เรียกว่า ASReml DiscoveryEditionสามารถดาวน์โหลดได้จาก http://www.asreml.co.uk เป็นโปรแกรมที่ให้ใช้ในองค์กรที่ไม่แสวงหาผลกำไร สถาบันการกุศล และสังคมสงเคราะห์ในประเทศที่มีรายชื่อกำหนดไว้ - Directory C:\ASRemlDiscovery\Bin\.........

5. ความเป็นมา • ประกอบด้วย 2 โปรแกรม • ASReml.exe • ติดต่อสื่อสารกับผู้ใช้ผ่านหน้าจอบนระบบ dos, linuxเหมือนกับ Version 1.0 • 2. ASRemlW.exe • ติดต่อสื่อสารกับผู้ใช้ผ่านหน้าต่างวินโดส์(window interface) ช่วยในการเตรียมไฟล์นำเข้าและดูผลลัพธ์ได้สะดวกขึ้นทั้งในรูปที่เป็นอักษรและกราฟฟิค

6. โปรแกรม ASReml วิเคราะห์: • ข้อมูลแบบ longitudinal data ทั้งแบบสมดุลและไม่สมดุล • ข้อมูลที่มีการวัดซ้ำ(การวิเคราะห์ความแปรปรวนหลายลักษณะ • และโมเดลspline type) • ข้อมูลจากแผนการทดลองต่างๆ ทั้งแบบสมดุลและไม่สมดุล • ข้อมูลการทดสอบจากหลายสภาพแวดล้อมและการวิเคราะห์อภิมาน (meta analysis) • ข้อมูลการปรับปรุงพันธุ์สัตว์ทั้งแบบการวิเคราะห์ลักษณะเดียวและหลายลักษณะ • ข้อมูลเชิงพื้นที่ (spatial data)

7. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

8. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

9. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

10. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

11. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

12. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

13. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

14. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

15. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

16. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

17. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

18. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

19. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

20. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

21. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

22. การใช้โปรแกรมผ่าน window interface

23. ตัวอย่างการวิเคราะห์ค่า EBV

24. Input file 1. Pedigree file C:\ASRemlDiscovery\Bin\ pedbra1.dat 2. Data file C:\ASRemlDiscovery\Bin\ brafinal.dat ทั้งใน pedigree และ data file สามารถเตรียมได้ในโปรแกรม excel นามสกุล .txt หรือ .csv 3. Command file เขียนในโปรแกรม note pad แล้ว save as “aw2.as” C:\ASRemlDiscovery\Bin\aw2.as 4. Pin file เขียนหลังจาก run แล้ว เพื่อคำนวณ heritability จาก output aw2.asrเขียนในโปรแกรม note pad แล้ว save as “aw2.pin” C:\ASRemlDiscovery\Bin\ aw2.pin

25. 1. Pedigree file

26. 2. Data file

27. 3. command file

28. Step for analyses

29. Step for analyses

30. Step for analyses

31. Step for analyses

32. Step for analyses

33. Step for analyses

34. Output files 1. aw2.asr

35. Output files 1. aw2.asr

36. Output files 2. aw2.sln ACC =  1- SE2 Va Va = 139.35

37. Output files 3. aw2.yht

38. Output files 4. aw2.rsv

39. Output files 5. aw2.veo

40. Output files 6. aw2.vvo

41. การเขียน Pin file

42. พบ Pin file เพิ่มใน console

43. runPin file

44. runPin file

45. ได้ output file เพิ่มเติม 7. aw2.pvc h2 = 0.24 ± 0.02

46. Next! Demonstration with real situation Thank you