740 likes | 1.18k Views
血流感染实验室诊断新进展. 北京协和医院检验科 王瑶 2013 年 4 月 13 日. 内容. 什么是血流感染? 血流 感染流行病学特点 血培养流程优化 提高阳性率 分析培养结果 减少污染 分子生物学 方法检测血流感染 基于 PCR 的技术 MALDI-TOF MS PNA-FISH. 概念. 感染=炎症 + 病原体 全身炎症反应综合征( SIRS ) 体温 >38 ⁰C 或 <36 ⁰ C 心率 >90 次 / 分 呼吸频率 >20 次 / 分,或 PaCO 2 <32mmHg
E N D
血流感染实验室诊断新进展 北京协和医院检验科 王瑶 2013年4月13日
内容 • 什么是血流感染? • 血流感染流行病学特点 • 血培养流程优化 • 提高阳性率 • 分析培养结果 • 减少污染 • 分子生物学方法检测血流感染 • 基于PCR的技术 • MALDI-TOF MS • PNA-FISH
概念 • 感染=炎症+病原体 • 全身炎症反应综合征(SIRS) • 体温>38⁰C或<36 ⁰C • 心率>90次/分 • 呼吸频率>20次/分,或PaCO2<32mmHg • 白细胞>12×109/L或<4×109/L,或幼稚细胞>10% • 脓毒血症(sepsis)=感染+SIRS,血培养可以阳性或阴性 • 重度脓毒血症(severe sepsis)=sepsis+脏器功能障碍、组织灌注不良和低血压 • 感染性休克(septic shock)
概念 • 败血症(septicemia):病原菌及其毒素侵入血流所引起的临床综合征,是一种严重的全身感染。病原菌主要是细菌,也可为真菌、分枝杆菌等。 • 菌血症(bacteremia):细菌在血流中短暂出现的现象,一般无明显毒血症状,在国外文献中常与败血症通用。 • 血流感染(bloodstream infection, BSI):败血症和菌血症目前统称为血流感染。
血流感染 • 医院获得性血流感染 • 原发血流感染 • 实验室证实血流感染(Laboratory-confirmed Bloodstream Infection, LCBI) • 临床血流感染(Clinical Sepsis) • 继发血流感染:血培养分离出有意义微生物,而且此微生物与另一部位之院内感染有关。唯不包括血管或血管内导管装置所引起之血流感染。 • 社区获得性血流感染
实验室证实血流感染(LCBI) • 标准一:从一次或多次血标本中培养出一种一致的致病菌,而且培养出的病原体与其它部位的感染无关。 • 标准二:病人至少具有下列症状和体征之一:发热(>38 ⁰C ),寒颤或低血压,并致病符合下列之一: • 1.从两次或两次以上不同部位抽血的标本中培养出皮肤寄生菌(如类白喉杆菌、芽孢杆菌、丙酸杆菌、凝固酶阴性葡萄球菌或微球菌)。 • 2.至少一次从带血管内导管的病人血标本中培养出皮肤寄生菌群(如类白喉杆菌、芽孢杆菌、丙酸杆菌、凝固酶阴性葡萄球菌或微球菌),并且主管医生开始了适当的抗菌药物治疗。 • 3.血中抗原检测阳性(如流感嗜血杆菌、肺炎链球菌、脑膜炎奈瑟菌或B群链球菌)。与实验室阳性结果一致的症状和体征与其它部位的感染无关。 • 标准三:年龄<1岁的病人具备下列症状或体征中的至少一项,发热(>38 ⁰C ),低温(<37 ⁰C ),呼吸暂停、脉搏徐缓,并具有下列之一(同上3点略)
临床血流感染(Clinical Sepsis) 具有下列二条件之一者: • 具有非其它已知原因所引起的发烧、血压过低(收缩压≤90mmHg或收缩压低于平常超过40mmHg),少尿(每小时尿量低于30ml)等临床症状任何一项,且符合下列所有条件者: • 未做血培养,或血培养阴性或血液抗原反应呈阴性者 • 其它部位无明显感染者 • 医生针对此感染中毒症状给予适当抗菌药物治疗 • 1岁以下婴儿 ,具有非其它书籍原因引起的发烧、体温过低、呼吸中止或心跳过缓等临床症状任何一项,且符合下列所有条件者: • 未做血培养,或血培养阴性或血液抗原反应呈阴性者 • 其它部位无明显感染者 • 医生针对此感染中毒症状给予适当抗菌药物治疗
BSI流行病学特点 • BSI发病率逐年增加 • 凝固酶阴性葡萄球菌、肠球菌、真菌血流感染发病率逐年上升,革兰阴性菌下降 • 耐药菌比例逐年增加 • 社区获得与医院获得血流感染病原谱存在差异 • 院内BSI患者病死率高
+600% +300% +300% 美国脓毒血症流行病学 Martin et al, NEJM 2003;348:1546
加拿大CANWORD监测2002-2009 DiagMicrobiolo Infect Dis. 2011; 69: 307
加拿大CANWORD监测2002-2009 Diag Microbiolo Infect Dis. 2011; 69: 307
美国49医院BSI病原谱 CID. 2004, 39: 309-317
PUMCH2012年144株BSI大肠埃希菌药敏结果 ESBL 60.2%
PUMCH2012年67株BSI肺炎克雷伯菌药敏结果 ESBL 34.4%
采血量是影响血培养阳性率的独立相关因素 • CLSI M47-A:每位患者采集2~3套血培养(40~60ml) • Surviving Sepsis Campaign Guidelines (Worldwide):抗菌药物治疗前至少采集2套血培养 • 英国NHS血培养标准:采集2套血培养
采血量对血培养阳性率的影响 JCM 2007
采血量对血培养阳性率的影响 J. Clin. Microbiol. 2011, 49(12):4047
采血量和阳性率 非条件致病菌 Routine Set @ Mayo Clinic: 2 BACTEC Aerobic Plus Bottles + 1 BACTEC Anaerobic Lytic Bottle J. Clin. Microbiol. 2011, 49(12):4047
血培养污染菌 • 在多次血培养中单次培养下列细菌阳性 • 凝固酶阴性葡萄球菌 • 棒状杆菌 • 微球菌 • 丙酸杆菌 • 芽孢杆菌 • 如多次培养阳性,可能为条件致病菌,需结合临床分析
为什么需氧+厌氧? 两种组合均能检测 非条件致病菌 Pathogen No. Mayo Clinic 不同的病原菌 (p<0.001) J. Clin. Microbiol. 2011, 49(12):4047
表皮葡萄球菌血培养阳性意义 CID 1997
血培养阳性时间-凝固酶阴性葡萄球菌 需氧瓶=242 厌氧瓶=72 需+厌=150 96%(+) 86%单瓶(+)
如何分析血培养凝固酶阴性葡萄球菌? • University Hospital of Base,2003-2007 • 3060阳性血培养,654CNS,粒缺患者除外 • 232 (35%)真正BSI,422 (65%)污染 • BSI由感染科医生判断,至少一份血培养CNS阳性,有感染临床表现 • SIRS: 体温>38C or <36C; 心率>90/min; 呼吸 >20/min; 白细胞>12 or <4 G/L or >10% 未成熟中性粒细胞 • 32%患者有1瓶以上CNS阳性,BSI68 %,污染12%(p <0.001) • 没有SIRS症状:BSI 5%,污染29%(p <0.001) ClinMicrobiol Infect. 2012 online
单瓶血培养CNS的BSI和污染患者区别 Clin Microbiol Infect. 2012 online
单瓶血培养CNS阳性BSI与临床症状相关性 Clin Microbiol Infect. 2012 online
降低血培养污染率--严格消毒 • 血培养瓶消毒:70%酒精消毒血培养瓶橡皮塞,待干60秒。或70%异丙醇消毒干燥 • 皮肤消毒: • 三步法 • 70%酒精擦拭静脉穿刺点 >30秒 • 1%2%碘酊30秒或10%碘伏消毒60秒:从穿刺点向外画圈消毒,直径>3cm • 70%酒精脱碘 • 一步法 • 葡萄糖酸洗必泰作用30 s,或70%异丙醇消毒后自然干燥,但不适用于2个月以内的新生儿。
急诊血培养污染率与工作量相关 • The University of Michigan Health System急诊 • 血培养大多数由采血员采集,其次为护士和医生 • 采血员:病人= 1:9,重症区护士:病人= 2:3,其它区域护士:病人=1:4 • 年病人量82521人,采集血培养者7586人 • 11.4%至少1瓶阳性,病原菌阳性率8.0%,污染率3.7% • 多套培养患者阳性率7.4%,单套培养阳性率5.1%(p<0.001),污染率无显著差别(2.2% vs. 2.6%) Schuyler Halverson, et al. JCM. 2013 online
急诊小时工作量 Schuyler Halverson, et al. JCM. 2013 online
繁忙时血培养污染率增加 OR=1.23 OR=0.93 Schuyler Halverson, et al. JCM. 2013 online
抗菌药物治疗与血流感染死亡率 死亡率 Chest 115 (2): 1999
血培养三级报告制度 鉴定+标准药敏 鉴定菌株 传种培养 革兰染色 血培养 阳性 终报告 电话报告 初步报告 (直接药敏)
血培养结果回报对治疗的影响 • A = Appropriate Therapy(正确治疗) • I = Inappropriate Therapy(不正确治疗) ClinInfec Dis 24:584-602, 1997
血流感染快速分子诊断 • 分子诊断不受抗菌药物使用的影响 • 血培养阳性后分子诊断 • 直接使用血标本进行分子诊断 • 快速 • 但不能提供药敏结果
血培养阳性瓶分子鉴定 Antigone Kotsaki, et al. Expert Opin. Med. Diagn. 2012, 6(3):209
阳性血培养-基于PCR的检测 • PCR特异性检测 • 病原特异性PCR • 特定耐药基因检测:葡萄球菌mecA, 肠球菌van • 细菌载量:肺炎链球菌自溶毒A基因lytA拷贝数 • 广谱检测:PCR扩增特定靶位 • 多态性分析 • 测序 • 后续基因检测 • 种特异性real-time PCR Expert Opin. Med. Diagn. 2012, 6(3):209. Curr Opin Infect Dis. 2011, 24(2):137
qPCR鉴定血培养阳性瓶中铜绿假单胞菌 • Target:ecfX gene • 血培养系统:BacT/ALERT,87瓶FA、13瓶FN,涂片均显示G-b • 对照方法:氧化酶,API 20E • DNA提取:0.5ml肉汤,离心后加裂解液,水煮法 • 定量PCR: • 扩增:Oligonucleotide primers • 基因特异性检测:fluorescent-labeled hybridization probes,152bp fragment AnnalClinMicrobiolAntimicrob 2010, 9:21
qPCR鉴定血培养阳性瓶中铜绿假单胞菌 • 33瓶pae,敏感性和特异性均为100% • 1瓶kpn+pae,由于pae(20CFU/ml)≤kpn (108CFU/ml),PCR(-) • 检测限:将ATCC27853 ecfX基因克隆至TOP10 E.coli Annal Clin Microbiol Antimicrob 2010, 9:21
阳性血培养-基于PCR的检测 • 最常见病原体多重PCR • 电泳谱、ELISA杂交、多重Real-time PCR • HyplexBloodScreen (BAG, Lich, Germany): 多重PCR+ELISA, 4.5-6h完成 • Prove-It Sepsis (Mobidiag, Helsinki, Finland):多重real-time PCR+微阵列分析,检测多种病原及mecA,3h完成 • 多重Real-time PCR Expert Opin. Med. Diagn. 2012, 6(3):209.
血培养阳性-多重real-time PCR NEW MICROBIOLOGICA, 36, 65-74, 2013