1 / 20

חלבונים

חלבונים. חומצות אמיניות כחומצות וכבסיסים. חברי הקבוצה. אלה פרוטקין- זילברמן אורנה פרידמן ברכה צביליך רים סאבא אסתר ברקוביץ מרים גלרמן. 14. R NH 3 - C - COO

steel-rivas
Download Presentation

חלבונים

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. חלבונים חומצות אמיניות כחומצות וכבסיסים חברי הקבוצה אלה פרוטקין- זילברמן אורנה פרידמן ברכה צביליך רים סאבא אסתר ברקוביץ מרים גלרמן 14

  2. R NH3- C - COO H החלבון הוא קופולימר של חומצות אמיניות R משתנה ולכן קיימים מגוון של חומצות אמינו מספר סוגי חומצות אמינו בטבע הוא 20. 15

  3. שווי משקל בסיס - חומצה HA(aq) + H2O(l) <--> H3O+(aq)+ A-(aq) Ka =[H3O(aq)+] [A-(aq)] [HA(aq)] pKa = -log Ka כאשר Kaשווה לריכוז יוני הידרוניוםA-(aq)] = [HA(aq)]] 16

  4. HA(aq) + H2O(l) <--> H3O+(aq)+ A-(aq) ב- pHחומצי רוב החלקיקים במערכת הם HA(aq) ב- pHבסיסי רוב החלקיקים במערכת הםׂ(aq)-A כאשר pH= pKa גם [HA(aq)] = [A-(aq)] 17

  5. שווי משקל חומצה - בסיס B(aq) + H2O(l) <--> BH+(aq) + OH-(aq) Kb =[BH+(aq)] [OH-(aq)] [B(aq)] pKb = - log Kb כאשר Kb שווה לריכוז יוני ההידרוכסיד גם [BH+(aq)] = [B(aq] 18

  6. BH+(aq) + H2O(l) <--> B(aq) + H3O ב- pH נמוך רוב החלקיקים במערכת הם בצורה BH+(aq) ב- pH גבוה רוב החלקיקים במערכת הם בצורה B(aq) כאשר pH=pKaגם [BH+(aq)] =[B] המטען הממוצע יהיה +1/2 19

  7.    +NH3-CHR-COO-(s) + H3O++NH3-CHR-COOH(aq)+ H2O(l)) +NH3-CHR-COO-(s) + OH- NH2 -CHR-COO-(aq)+ H2O(l) הומצה אמינית בסביבה חומצית היא יון חיובי בסביבה בסיסית היא יון שלילי 20

  8. pH=pK pH<pK pH>pK השתנות המטען של הקבוצות השונות עם שנוי ה- pH -1 -0 . 5 0 -COOH 0 +0 . 5 +1 NH3+ 21

  9. השתנות המטען נטו של החומצה האמינית עם שנוי pH 22

  10. הנקודה האיזואלקטרית pI זה ה- pH של התמיסה שבו המטען הנטו של החומצה האמינית שווה לאפס. pI “אמצע הדרך” בין ה- pH שבו המטען נטו היא 0.5 + לבין ה- pH שבו המטען נטו הוא 0.5 - 23

  11. מיון חומצות אמיניות על פי קבוצת R 1. חומצות אמיניות עם קבוצה צדדית R פחמימנית שאינה נושאת מטען חשמלי Ala Ile Leu Met Phe Pro Val Cys Tyr Trp 2. חומצות אמיניות עם קבוצה צדדית קוטבית שאינה נושאת מטען חשמלי אך יכולה ליצור קשרי עם מים. Asn Gln Ser Thr His Tyr 24

  12. 3. חומצות אמיניות עם קבוצה צדדית שיכולה לשאת מטען א. חיובי ב. שלילי Asp Glu Cys Tyr Lys Arg Hys 25

  13. מיון חומצות אמיניות ע”פ הקוטביות של R 1. חומצות אמיניות בסיסיות (טעונות חיובית בתמיסה מימית ) Lys Arg His .2. חומצות אמיניות חומציות (טעונות שלילית בתמיסה מימית ) Asp Glu Cys 3. חומצות אמיניות קוטביות (אינן טעונות בתמיסה מימית ) Asn Gln Tyr Ser His Thr 26

  14. 4. חומצות אמיניות הידרופוביות Ile Ala Gly Val Trp Leu Met Cys Phe Pro Tyr 27

  15. חישוב מטען נטו של פפטיד 1. קביעת המטען-נטו לכל קבוצה שנושאת מטען 2. סכום מטען נטו של כל הקבוצות הנושאות מטען שמרכיבות את הפפטיד הנחות א. ה-pKa של הקבוצה הפעילה (הנושאת מטען) בשרשרת הצדדית שווה ל-pKa של אותה קבוצה בחומצה האמינית הבודדת. ב.ה- pKa של קבוצת -COOH בקצה C בערך 3.5 ה- pKa של קבוצת NH3בקצה N בערך 8 28

  16. דוגמא לחישוב מטען-נטו של פפטידAsp-His-Arg-Glu-Asp 8 4.25 12.5 6.5 3.9 3.5 pKa Asp- His - Arg - Glu -Ala C N 29

  17. חישוב מטען - נטו Ala - Glu - Arg - His - Asp מטען נטו pH 30

  18. לכל פפטיד מטען אופיני התלוי : א. בהרכבו (הרכב החומצות האמיניות בו ) ב. ב-pH של התמיסה בה מצוי הפפטיד pH התמיסה בה מצוי הפפטיד משפיע על מסיסות הפפטיד ב- pI המסיסות היא הנמוכה ביותר 31

  19. אלקטרופורזה שיטה להפרדה בין מולקולות נושאות מטען על פי קצב נדידה שווה בשדה חשמלי ניתן להפריד בין : חומצות אמיניות שונות חלבונים שונים 32

  20. הפרדה ע”י אלקטרופורזה + - 14 0 pH האלקטרופורזה מתבצעת על ניר או על ג’ל כאשר הנוזל המריץ הוא תמיסת בופר בעל pH נתון. מרחק הנדידה תלוי בגודל המטען 33

More Related