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蛋白质 生物合成. 第十一章. 曹慧颖. 将 mRNA 分子中的遗传信息,通过 遗传密码 破译的方式解读为蛋白质一级结构中20种氨基酸的排列顺序过程,称为蛋白质的生物合成或 翻译 ( translation)。. 第一节. 蛋白质生物合成体系 Protein Biosynthesis System. 参与蛋白质合成的物质:. 原料:20种氨基酸 模板: mRNA 运载体: tRNA 场所:核糖体( rRNA 与蛋白质构成) 蛋白质因子: 起始因子( initiation factor, IF)
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蛋白质生物合成 第十一章 曹慧颖
将mRNA分子中的遗传信息,通过遗传密码破译的方式解读为蛋白质一级结构中20种氨基酸的排列顺序过程,称为蛋白质的生物合成或翻译(translation)。
第一节 蛋白质生物合成体系 Protein Biosynthesis System
参与蛋白质合成的物质: • 原料:20种氨基酸 • 模板:mRNA • 运载体:tRNA • 场所:核糖体(rRNA与蛋白质构成) • 蛋白质因子: • 起始因子(initiation factor, IF) • 延长因子(elongation factor,EF) • 释放因子(release factor,RF) • 其他:酶类、ATP、GTP、无机离子等
一、mRNA及遗传密码 (一)mRNA是遗传信息的携带者 • 遗传学将编码一个多肽的遗传单位称为顺反子(cistron)。 • 原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的mRNA可编码几种功能相关的蛋白质,为多顺反子(polycistron) 。 • 真核生物一个mRNA只编码一种蛋白质,为单顺反子(single cistron) 。
3 5 PPP 蛋白质 3 mG - 5 PPP 蛋白质 非编码序列 核蛋白体结合位点 编码序列 起始密码子 终止密码子 原核生物的多顺反子 真核生物的单顺反子
(二)mRNA上存在遗传密码 mRNA分子上从5至3方向,由AUG开始,每3个核苷酸为一组,决定肽链上一个氨基酸,称为三联体密码(triplet coden)。 数量:64(43) 起始密码(initiation coden): AUG 终止密码(termination coden): UAA,UAG,UGA
1. 无标点性 (三)遗传密码的特点 编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。
2.遗传密码无重叠 • 每三个碱基编码一个氨基酸,一个碱基编码完一个氨基酸后不能再次用于编码另一个氨基酸。
3. 简并性(degeneracy) 遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅有一个密码子外,其余氨基酸有2、3、4个,甚至多至6个密码子。
4. 摆动性(wobble) tRNA上的反密码子需要通过碱基互补与mRNA上的遗传密码配对,但反密码子与密码子间不严格遵守常见的碱基配对规律,称为摆动配对。
密码子、反密码子配对的摆动现象 密码子的摆动性,保证当mRNA第三个碱基突变时也能翻译出正确的氨基酸.
5. 通用性(universal) • 蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到人类都通用。 • 已发现少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体。 • 密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。
6.起始密码子和终止密码子 • AUG---起始密码子,编码蛋氨酸 • UAA,UAG,UGA---终止密码子,不编码任何氨基酸
二、tRNA • tRNA —— 运载活化型氨基酸
A U C tRNA反密码子与mRNA上的密码子配对
三、核糖体 • 核糖体是蛋白质的合成场所,由蛋白质和RNA组成
原核生物核糖体结构模式 P位:肽酰位 (peptidyl site) A位:氨基酰位 (aminoacyl site) E位:排出位 (exit site)
第二节 蛋白质生物合成过程 The Process of Protein Biosynthesis
一、氨基酸的活化 1、活化 氨酰tRNA合成酶 Aa + ATP Aa-AMP - E + ppi Mg2+或Mn2+ 2、 转移 氨酰tRNA合成酶 Aa-AMP-E+ tRNA Aa- tRNA + AMP
总反应: 氨酰tRNA合成酶 Aa + ATP + tRNA Aa- tRNA + AMP + ppi Mg2+或Mn2+
二、蛋白质合成的起始 起始氨基酸和起始氨酰tRNA 原核: fMet fMet-tRNAf ; 真核: Met Met-tRNAi ;
肽链合成起始是mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核糖体结合而形成翻译起始复合物 (translational initiation complex)的过程。有多种蛋白质的起始因子(initiation factor,IF)参与。
(一)原核翻译起始复合物形成 1. 核糖体大小亚基分离(IF3,IF1) 2. mRNA在小亚基上定位结合 3. fMet-tRNAf的结合(IF2,GTP) 4. 核蛋白体大亚基结合 起始复合物 fmet-tRNA f -mRNA-核蛋白体 • 需要三种起始因子(IF)及GTP的参与
1. 核蛋白体大小亚基分离 IF-1 IF-3
mRNA 5' 3' A U G 2. mRNA在小亚基定位结合 IF-1 IF-3 mRNA与小亚基的结合依赖于: • SD序列与16S rRNA 3’端一段富含嘧啶的序列的互补
S-D序列 (Shine-Dalgarno sequence ) mRNA起始密码AUG上游约8~13个核苷酸处,有一段4~9个核苷酸的富含嘌呤的序列,以…AGGA…为核心,叫S-D序列。
IF-2 GTP 5' 3' A U G 3. fMet-tRNAf结合到小亚基 IF-1 IF-3
50S IF-2 GDP+Pi 50S mRNA 5' 5' 3' 3' A A U U G G IF-1 IF-3 4. 核糖体大亚基结合,起始复合物形成 IF-2 GTP IF-1 IF-3
50S 50S IF-2 GTP IF-2 GDP+Pi mRNA 50S mRNA 5' 5' 3' 3' A A U U G G IF-1 IF-3 IF-1 IF-3
(二)、肽链的延长 指根据mRNA密码序列的指导,依次添加氨基酸从N端向C端延伸肽链,直到合成终止的过程。
肽链每次增加一个氨基酸,包括以下三步: • 进位(entrance) • 成肽(peptide bond formation) • 转位(translocation) • 需要延长因子(elongationfactor, EF )和GTP的参与
1、进位 根据mRNA上遗传密码的指导,使相应氨基酰-tRNA进入核糖体A位。
2、成肽 在转肽酶的催化下, P位上fMet(或延长中的肽酰基)转移到A位点,与A位点的氨基酸结合形成肽键。
成 肽 肽链合成延长阶段的肽键形成过程
3、转位 延长因子EF-G有转位酶( translocase )活性,可结合并水解1分子GTP,促进核糖体向mRNA的3`方向移动一个密码子的位置,使下一个密码子对准A位点,空载tRNA在E位点脱落。
进位 成肽 转位
核蛋白体循环 • 从5`AUG开始直至终止密码子 • 核蛋白体从5`→3`方向阅读mRNA遗传密码 • 肽链的合成是从N端到C末端 • 每进行一次核蛋白体循环,肽链延长一个 氨基酸
(三)、肽链合成的终止 当mRNA上终止密码出现后,多肽链合成停止,肽链从肽酰-tRNA中释出,mRNA、核蛋白体等分离,肽链合成终止。
终止相关的蛋白因子称为释放因子 • (release factor, RF) 原核生物释放因子:RF-1,RF-2,RF-3 释放因子的功能: 1、识别终止密码,如RF-1特异识别UAA、UAG;而RF-2可识别UAA、UGA。 2、诱导转肽酶改变为水解酶活性,使肽链不能向A位点转移,使肽链从核蛋白体上释放。
原核生物肽链合成终止过程 • 终止密码的辨认:RF • 肽链从肽酰-tRNA水解出:RF诱导转肽酶 • mRNA、空载tRNA及RF从核蛋白体脱离 • 大小亚基解聚:IF-1、IF-3 • 解聚后的大、小亚基可再次结合,重新进入肽链合成过程