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PubMed: 入门. http://www.ncbi.nlm.nih.gov http://www.pubmed.com. 图书馆文献检索教研室 赵文龙 cqzhaowl@cqmu.edu.cn. 一、概 述. PubMed 是美国国立医学图书馆( NLM )的国家生物技术信息中心( NCBI )提供的一项生物医学文献检索服务,包括 1950 年以来的生物医学文献 1500 万条,数据来源于 Medline 数据库和其它生命科学期刊, PubMed 数据库还提供将检索到的文献信息链接到部分收费或免费全文或相关资源的网站。.
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PubMed:入门 http://www.ncbi.nlm.nih.gov http://www.pubmed.com 图书馆文献检索教研室 赵文龙 cqzhaowl@cqmu.edu.cn
一、概 述 PubMed是美国国立医学图书馆(NLM)的国家生物技术信息中心(NCBI)提供的一项生物医学文献检索服务,包括1950年以来的生物医学文献1500万条,数据来源于Medline数据库和其它生命科学期刊,PubMed 数据库还提供将检索到的文献信息链接到部分收费或免费全文或相关资源的网站。
NCBI(National Center of Biotechnology Information) 1988年作为美国国家分子生物学信息资源中心而建立的,其主要工作是开发一些公共数据库,对计算生物学进行研究,开发一些分析基因组的软件工具,传播生物信息。
NCBI提供了28个免费数据库,PubMed只是其中一个,这些数据库使用统一的检索系统和界面—Entrez,该系统使用方便,操作简单。
是NLM的国家生物技术信息中心(NCBI)开发,于97年5月推出,用于检索网上生物医学文献信息的检索系统。是NLM的国家生物技术信息中心(NCBI)开发,于97年5月推出,用于检索网上生物医学文献信息的检索系统。 PUBMED免费 >1500万条高质量的题录摘要 每日完成来自全球的检索220万个 医学\护理\牙科\兽医\保健\临床前 生命科学的期刊 全文链接超过 3277种 分子生物学数据库 星期二到星期六每日更新
通过PubMed可检索到如下的信息 • oldMedline(1951-1965) • MEDLINE (1966- ) • PreMedline (最新 ) • 出版商提供的书目信息(生命科学) • MEDLINE收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1500万余条,虽然是世界范围的,但是大多数记录是从英语资料(87%)或有英文摘要(72%)的文献中获得的。
输入网址 基本检索对话框 检索详情 限制检索 预览/索引 检索历史 剪贴板 PubMed检索主界面
三、PubMed 系统的主要功能 • 词汇自动转换功能 • 截词检索功能 • 强制检索功能 • 链接功能
四、检索方式 • 基本检索 • 限制检索 • 浏览/索引检索 • 主题词途径检索 • 利用检索史检索
(一)基本检索 • 自由词检索 • 字段限制检索 • 著者检索 • 刊名检索 • 日期或日期范围检索 • …… • 布尔逻辑检索
基本检索:自由词 在检索的初始界面的检索提问框中输入欲检索的内容,然后点击按钮Go即可完成检索,系统自动将检索结果以默认方式显示在屏幕上。基本检索类似MEDLINE光盘检索的自由词检索,可进行布尔逻辑检索和截词检索,同样可进行主题词/副主题词的组配检索。
检索提问的形式 单个词语hepatitis, 词组vitamin c 截词形式hepat* 主题词/副主题词 hepatitis/dt或hepatitis/drug therapy 布尔逻辑表达式 vitamin c AND hepatitis/dt 语法命令(字段限制) hepatitis[titile]或zhang[au] PubMed具有智能检索功能,检索时可以对输入的检索词自动转换,查找相应的主题词,利用主题词进行检索。
布尔逻辑检索 • PubMed系统允许使用布尔逻辑检索,如:vitamin c OR zinc。 • 布尔逻辑检索的运算顺序为从左至右,可使用圆括号来改变其运算顺序。如common cold AND (vitamin c OR zinc), 圆括号中的检索式最先运算。 • 布尔逻辑检索允许在检索词后附加字段标识以限定检索字段。其检索表达式的格式为:检索词[字段标识] 布尔运算符 检索词[字段标识]。如:dna[mh] AND crick [au] AND 1993 [dp];又如:asthma[mh] AND review[pt] AND child[mh]
在基本检索的检索提问框下方,尚有Limits、Preview/Index、History、Clipboard和Details五个按扭,分别表示限制检索、浏览/索引检索、检索史、剪贴板和查看详细检索式功能。在基本检索的检索提问框下方,尚有Limits、Preview/Index、History、Clipboard和Details五个按扭,分别表示限制检索、浏览/索引检索、检索史、剪贴板和查看详细检索式功能。 Limits:可限制检索提问的时间和空间范围
Limits检索界面 限定作者/期刊 是否有全文 年代限制 研究对象 性别 专题子库 原文语种
Limits检索界面(续) 文献类型 年龄范围 字段选择
Limits功能检索,具体包括检索提问的以下字段限制:Limits功能检索,具体包括检索提问的以下字段限制: 字段限制(All Fields) 出版类型(Publication Types) 研究对象(Human or Animal) 年龄范围(Ages) 性别(Gender) 子库选择(Subsets) 原文语种(Languages) 数据库更新时间(Entrez Date) 原文出版时间(Publication Date) 检索时根据需要选择合适的条件,而后点击屏幕上方的检索动作按扭Go便可完成检索。
出版类型(Publication Types)包括临床试验(Clinical Trail)、编辑说明(Editorial)、通信(Letter)、荟萃分析(Meta-Analysis)、实践指南(Practice Guideline)、随机对照试验(Randomized Controlled Trial)和综述(Review)等7种。 年龄范围(Ages)包括All Infant(出身-23月),All Child(0-18岁),All Adult(19岁及以上),Newborn(出身-1月),Infant(1-23月),Preschool Child(2-5岁),Child(6-12岁),Adolescent(13-18岁),Adult(19-44岁),Middle Aged(45-64岁),Aged(65岁及以上),80 and over(80岁及以上)。
限制检索视频 BACK
为PubMed的高级检索 • 输入一个词语点击preview可以得到检索结果 • 可以查看以前的检索结果 • 可以查看检索史和增删修改检索策略 • 可从屏幕下端的检索提问输入框中输入检索提问,并可限制在特定字段进行布尔逻辑运算
检索完成后,系统会自动显示文献的一些简单信息,包括作者、篇名和出处等信息,但要显示其它如文摘信息,则需进一步处理。检索完成后,系统会自动显示文献的一些简单信息,包括作者、篇名和出处等信息,但要显示其它如文摘信息,则需进一步处理。 显 示(Display) 可以显示全部命中结果或选择性显示命中结果。 显示格式:显示MEDLINE数据主要有3种格式(Abstract report、Citation report、MEDLINE report)。 通过 “Display”后的下拉按钮▼来选择的。 摘要格式(Abstract report)由刊名、年代、卷期页码、篇名、作者、作者地址、文摘及文献类型等组成。引用格式(Citation report)除了摘要格式的内容外,尚有MeSH词、化学物质名称、项目合同号码等。 MEDLINE格式(MEDLINE report)与光盘相同。显示格式一般选择摘要格式(Abstract report)。
在Send to后面有以下几种选项,其功能分别是: Text:以纯文本的形式显示当前页题 录的信息 File:保存到本地磁盘 RSS Feed:信息定制文件 Clipboard:暂存在剪贴板中 Order:向NLM索取原文
打 印 1、直接用浏览器的打印功能 2、将检索结果套录成文本打印
临床咨询Clinical Queries 只检索该检索提问(词)的治疗(therapy)、诊断(diagnosis)、病因(etiology)和预后(prognosis)等4个与临床密切相关的文献 。 个性化服务My NCBI(Cubby) 可以保存检索史,便于日后跟踪检索。 需要注册后(免费注册),方可使用。