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第二章 基因工程的工具酶和载体 第二节 克隆载体. 质粒. 噬菌体. 柯斯质粒. 人工微小染色体. 载体: 携带外源 DNA 进入宿主细胞的工具。 能够运载外源 DNA 片段(目的基因)进入受体细胞,具有自我复制能力,使外源 DNA 片段在受体细胞中得到扩增和表达,不被受体细胞的酶系统所破坏的一类 DNA 分子。. 载体按功能可分为 克隆载体 表达载体. 克隆载体应具备的条件. 具有复制原点,在宿主细胞内必须能够自我复制。 有一个或多个用于筛选的选择标记。 具备合适的限制性核酸内切酶的单一识别位点。 有较高的拷贝数。. 克隆载体包括:
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第二章 基因工程的工具酶和载体 第二节 克隆载体 质粒 噬菌体 柯斯质粒 人工微小染色体
载体:携带外源DNA进入宿主细胞的工具。 能够运载外源DNA片段(目的基因)进入受体细胞,具有自我复制能力,使外源DNA片段在受体细胞中得到扩增和表达,不被受体细胞的酶系统所破坏的一类DNA分子。
载体按功能可分为 克隆载体 表达载体
克隆载体应具备的条件 • 具有复制原点,在宿主细胞内必须能够自我复制。 • 有一个或多个用于筛选的选择标记。 • 具备合适的限制性核酸内切酶的单一识别位点。 • 有较高的拷贝数。
克隆载体包括: 质粒载体 噬菌体载体 人工构建的载体(黏粒和人工微小染色体)
一 、 质粒载体 1.质粒的一般生物学特性: (1)质粒的概念:是存在于细胞质中一类独立于染色体外的可自主复制的遗传成分,绝大多数质粒为共价闭合环状双链DNA,少数是线性。
(2)质粒的自主复制性 质粒能利用寄主细胞的DNA复制系统进行自主复制,质粒DNA的复制受质粒和宿主细胞双重遗传系统的控制。 质粒拷贝数:指宿主细菌在标准培养条件下,每个细菌细胞中含有的质粒数目。
按照质粒控制拷贝数的程度,可将质粒的复制方式分为松弛型和严谨型两种 松弛型:10-200 拷贝(加氯霉素扩增) 严谨型:1-10 拷贝
(3)质粒的不相容性 任何两种含有相似复制子结构的不同质粒,不能同时存在于一个细胞中,这种现象称为质粒的不相容性,不相容性的质粒组成不相容性群。
(4)质粒的可转移性 接合型质粒 能在天然条件下自发地从一个细胞转移到另一个细胞(接合作用),如F、Col、R质粒等 非接合型质粒 不能在天然条件下独立地发生接合作用如Col、R的其它成员。
(5 )携带特殊的遗传标记 野生型的质粒DNA上往往携带一个或多个遗传标记基因,这使得寄主生物产生正常生长非必需的附加性状,包括: 氨苄青霉素抗性基因、四环素抗性基因、氯霉素抗性基因、卡那霉素和新霉素抗性基因、lacZ’基因 这些标记基因对DNA重组分子的筛选具有重要意义!
LacZ基因表达的蓝白斑菌落 空转化子:蓝色 重组子:白色
2.质粒载体应具备的条件 (1)拷贝数较高。 (2)分子量较小。 (3)具有选择标记。抗性是常用的选择标记。 (4)具有较多的限制性酶切位点。MCS (5)具有复制起始点。
3.常用的克隆质粒 (1)pBR322质粒载体: 1977年,F Bolivar & R L Rodriguez构建 全长4362 bp 松驰型质粒 Ampr,Tetr 多种限制性酶切位点
(2)pUC质粒: • pUC 18/pUC 19 全长2674 bp ,有Amp 抗性基因,带有lac Z′基因。 • 一个复制起点ori。因在复制起点ori区域内缺失rop 基因(改进的pMB1复制子),细胞即使生长在无氯霉素环境中也可形成高拷贝数(500-700)。
pUC质粒的优点:1)突变位点位于复制起点,提高了拷贝数。2) 重组子的鉴定可一步完成,固体培养基中添加amp和X-gal, IPTG,节约了一半的时间。3)多克隆位点,可以使具有不同粘端的DNA片段插入载体,而不必连接linker。4)载体中的多克隆位点与M13mp系列的载体是相同的,因此,插入pUC系列的克隆DNA可以直接转入M13mp载体,可以进行DNA测序和体外定点突变。
改建质粒的要求 • 尽可能使质粒缩小,以便插入更大的外源DNA片段; • 增加多种酶切位点; • 增加标记基因; • 提高外源DNA的表达水平; • 增加质粒在受体细胞中的拷贝数
质粒载体总体评价 优点:种类多,改建方便,筛选方便,操作简单,DNA提取容易 缺点:装载容量有限,<10Kb
二、λ噬菌体 • λ噬菌体DNA 是线性双链DNA分子,48.5kb • 噬菌体λ粒子,DNA线性双链,带有12bp的粘性末端,称为cos位点。 噬菌体感染细菌以后,双链DNA分子通过COS位点成环状 • λ基因组三个区域: 左侧:包括外壳蛋白基因,20kb 中间区:18kb 右侧:复制及裂解基因,12kb λDNA+外源DNA之和必须在39-53kb之间,所以可插入7-21kb外源片段
l 噬菌体生物学特性:生物结构 黏性末端 溶菌控制基因 cos 头部合成基因 晚期控制基因 DNA合成控制基因 阻遏基因 l - DNA 早期控制基因 尾部合成基因 阻遏基因 重组基因 删除与整合基因 COS 3’ CCCGCCGCTGGA 5’ 5’ TCCAGCGGCGGGG 3’ COS
λ-DNA载体的构建:删除重复的酶切位点 野生型的l-DNA链上有5个EcoRI位点和7个HindIII位点,不利于重组操作,必须删除至1 -2个 同时,为了便于各种来源的DNA片段的克隆,还需要增加一些单一的酶切位点。如利用酶切和采用定点突变技术去除或增加酶位点 增加标记基因lacZ
l-DNA作为载体的优点: l-DNA可在体外包装成噬菌体颗粒,能高效转染大肠杆菌 l-DNA载体的装载能力为25 kb,远远大于质粒的装载量 重组l-DNA分子的筛选较为方便 重组l-DNA分子的提取较为简便 l-DNA载体适合克隆和扩增外源DNA片段,但不适合表达 外源基因
三、M13单链噬菌体 M13噬菌体的生物学特性:生物结构 M13噬菌体的外型呈丝状 M13噬菌体由外壳包装蛋白和正链DNA组成 M13DNA全长6407个核苷酸 M13 DNA上至少有10个基因 M13噬菌体不裂解宿主细胞,但抑制其生长
四、考斯质粒 • 1978年由Collins和Hohn改建 •正常的质粒与噬菌体的cos位点构成 •有Ampr抗性基因 •Cos位点可识别噬菌体的外壳蛋白,可被包装 •包装能力:30-40kb
考斯质粒(cosmid) 考斯质粒载体的特点: 能像l-DNA那样进行体外包装,并高效转染受体细胞 能像质粒那样在受体细胞中自主复制 重组操作简便,筛选容易 装载量大(45 kb)且克隆片段具有一定的大小范围 不能体内包装,不裂解受体细胞
五、人工微小染色体 YAC载体应含有下列元件: 酵母染色体的端粒序列 酵母染色体的复制子 酵母染色体的中心粒序列 酵母系统的选择标记 大肠杆菌的复制子 大肠杆菌的选择标记 YAC载体的装载量为800 -1000 kb
优点:装载容量大,酵母细胞克隆 缺点:基因分离困难,需亚克隆 酵母人工染色体的应用
克隆载体的发展历史 第一代:环状质粒,装载8-10个kb片段; 第二代:经过改建的病毒,装载能力20kb左右; 第三代:cosmid,装载能力30-40kb; 第四代: YAC, 装载能力1-2 Mb; 第五代: 新型载体: BAC, PAC, MAC, Fosmid 等,装载能力80-200kb
思考题 1、第一个作为重组DNA载体的质粒是( ) (a)pBR322 (b)ColEl (c)pSCl01 (d)pUCl8 2、同一种质粒DNA以三种不同的形式存在电泳时它们的迁移速率是( ) (a)OCDNA>SCDNA>LDNA (b)SCDNA>LDNA>OCDNA (c)LDNA>OCDNA>SCDNA (d)SCDNA>OCDNA>LDNA
3、pBR322是一种改造型的质粒,含有两个抗性基因,其中四环素抗性基因来自 ( ) (a)ColEl (b)Ri质粒 (c)pSCl01 (d)pUCl8 4、关于穿梭质粒载体,下面哪一种说法最正确?( ) (a)在不同的宿主中具有不同的复制机制 (b)在不同的宿主细胞中使用不同的复制起点 (c)在不同的宿主细胞中使用不同的复制酶 (d)在不同的宿主细胞中具有不同的复制速率