720 likes | 1.1k Views
Biofizyka białek. Białka - liniowe kopolimery złożone z aminokwasów. Liczba rodzajów białek - nieznana. Biofizyka białek. Cechy wspólne białek 1. wielkocząsteczkowy charakter niedializują, roztwory koloidalne 2. wywierają ciśnienie osmotyczne 3. zdolność wiązania jonów
E N D
Biofizyka białek Białka - liniowe kopolimery złożone z aminokwasów Liczba rodzajów białek - nieznana
Biofizyka białek Cechy wspólne białek 1. wielkocząsteczkowy charakter niedializują, roztwory koloidalne 2. wywierają ciśnienie osmotyczne 3. zdolność wiązania jonów 4. posiadają ładunek – wędrują w polu elektrycznym 5. ulegają wysalaniu 6. skręcają płaszczyznę światła spolaryzowanego -refraktometria 7. ulegają denaturacji
Biofizyka białek Jedynie pewne określone ugrupowania spełniają funkcje biologiczne Konserwatywność budowy Powtarzalność struktur
Biofizyka białek Białka (podział wg funkcji)- strukturalne - transportujące - magazynujące - enzymy - obronne
Biofizyka białek Białka (podział wg funkcji)- strukturalne- transportujące - magazynujące - enzymy - obronne
Biofizyka białek Białka (podział wg funkcji)- strukturalne - transportujące- magazynujące - enzymy - obronne
Biofizyka białek Białka (podział wg funkcji)- strukturalne - transportujące - magazynujące- enzymy - obronne
Biofizyka białek Białka (podział wg funkcji)- strukturalne - transportujące - magazynujące - enzymy- obronne
Biofizyka białek Białka (podział wg budowy)- proste - złożone- histony- protaminy- albuminy- globuliny
Biofizyka białek Białka (podział wg budowy)- proste - złożone - fosfo- - metalo-- lipo--gliko--nukleo-- chromo- proteiny
Biofizyka białek Chromoproteina – (hemoglobina)
Biofizyka białek Aminokwasy --- Peptydy --- Białka Hierarchiczność budowy struktury I rzędu II rzędu III rzędu IV rzędu
Biofizyka białek Struktura I rzędu - kolejność aminokwasów
g. karboksylowa g. aminowa reszta specjalna Aminokwasy Biofizyka białek -COOH -NH2 Reakcje uwarunkowane grupami funkcyjnymi - tworzenie soli - estryfikacja - acylacja
Biofizyka białek Aminokwasy -NH2 -COOH Ładunek zależny od pH środowiska+ obojętny - Aminokwasy: zasadowe, obojętne, kwaśne
Biofizyka białek Punkt izoelektrycznypIpH, przy którym cząsteczka nie jest obdarzona żadnym ładunkiem i nie porusza się w polu elektrycznym
Biofizyka białek Widmo absorpcyjne aminokwasów aromatycznych w UV
Biofizyka białek charakter w. częściowo podwójnego (88 kJ/mol) -0,015 +0,002
Biofizyka białek Kąty torsyjne wiązania peptydowego Konformacja kątów i i i decyduje o strukturze II rzędu
Biofizyka białek Kąty torsyjne w kolejnych wiązaniach peptydowych1. stałe wartość – konformacja regularna-helisa lub struktura 2. wartości nieregularne – konformacje nieregularne
Biofizyka białek -helisa najtrwalsza i najczęściej występująca w białkach konformacja II rzęduZazwyczaj prawoskrętna = - 58º = - 47ºn = 3,6 n- liczba jednostek peptydowych przypadających na skręt
Biofizyka białek n- liczba jednostek peptydowych przypadających na skręt p – odległość między sąsiednimi skrętami mierzonymi wzdłuż osi (skok śruby) p = 0,15 * 3,6 = 0,54 nm t – 360º/n – jednostkowy skręt (kąt obrotu przypadających na jedną resztę aa h – jednostkowa wysokość przypadająca na jedną resztę aa mierzoną wzdłuż osi helisy
Biofizyka białek -helisa zawsze Ala, Leu, Met, Glunigdy Pro, Gly, Tyr, Ser, Cys Obecność atomów siarki w łańcuchu bocznym uniemożliwia utworzenie -helisy – wzrost oddziaływań typu dipol-dipol pomiędzy wiązaniem C-S a N-H preferowana struktura
Biofizyka białek Struktura (pofałdowanej kartki) jest zawsze kombinacją kilku sekwencji aa, czasami dość odległych na łańcuchu = - 120º = -140º ułożeniefragmentów może być- równoległe 0,35 nm- antyrównoległe 0,325 nm
Biofizyka białek struktura w większość białek nie jest planarna
Biofizyka białek -wstęga 180º --- 5 aa
Biofizyka białek - zgięcie
Biofizyka białek - zgięcie i+2 Asn Cys Aspi+3 Asn Asp Gly Trp
Biofizyka białek -zgięcie jedynie 3 aminokwasy
Biofizyka białek cytochrom c Pętla – element nieregularny zazwyczaj 6 - 16 aa Pętle i zgięcia usytuowane są głównie na powierzchni białek i bogate są w aa hydrofilowe
Biofizyka białek Obszary wiązania antygenów zbudowane są z sześciu pętli
Biofizyka białek główna funkcja to łączenie elementów struktury II rzędu